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CDPBC: A Software Application for Estimation of Concentration Dependent Plasma Binding Capacity of Small Molecule

机译：CDPBC：一种估计小分子浓度依赖性血浆结合能力的软件应用

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Abstract Drug‐plasma binding (DPB) is an important aspect during pharmacokinetics (PK) studies. DPB of small molecule cannot be evaluated through computational means. Here we present CDPBC; a standalone application for evaluation of small molecule for its capacity (concentration dependent) of binding with plasma proteins. This application is freely available at URL (https://github.com/undwive di/CDPBC.git). The application is enriched with evaluation of five major proteins of plasma. Input for application is a docked complex against the suggested PDBs of plasma proteins. As part of the analysis, software compares interaction of query compound with control compound. Main output comes as plot as well as table displaying percentage of binding in reference of concentration gradient of small molecule used in docking. The application is an advanced add‐on component to ADME analysis of small molecules as well as lead optimization.
机译：摘要药物 - 血浆结合（DPB）是药代动力学（PK）研究期间的一个重要方面。 不能通过计算装置评估小分子的DPB。 在这里我们提出了CDPBC; 对血浆蛋白结合物能力（浓度依赖性）评估小分子的独立应用。 此应用程序可在URL（https://github.com/undwive di / cdpbc.git）自由使用。 该申请富集了评价五种主要蛋白质的血浆。 申请的输入是对接的血浆蛋白的PDB对接。 作为分析的一部分，软件比较查询化合物与对照化合物的相互作用。 主要输出作为绘图以及表显示用于对接中使用的小分子的浓度梯度参考的结合百分比。 该应用是一种高级附加组件，以ADME分析小分子以及铅优化。

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