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Variability analysis of HIV-1 gp120 V3 region: IV. Distribution functions for intra- and inter-subtype amino acid hamming distances.

机译:HIV-1 GP120 V3区域的变化分析:IV。 分布型亚氨基酸锤近距离的分布函数。

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摘要

Distribution functions for intra- and inter- HIV-1 V3-loop subtypes amino acid Hamming distances were calculated (850 V3-loop sequences from the Los Alamos HIV-1 Database (1996) were used). These functions have pronounced bell-like shape. Such shapes of the histograms for HIV-1 V3 intra- and inter-subtype distriutions are discussed to confirm the applicability of different hierarchical cluster procedures for HIV-1 V3 classification. Two-mode distribution for the subtype E could sertificate that this subtype includes two thinner taxons.
机译:计算出用于和间族间族-1V3环亚型的分布函数计算氨基酸锤距距离(使用来自LOS Alamos HIV-1数据库(1996)的850V3环序列)。 这些功能具有明显的钟形状。 讨论了HIV-1 V3内部和亚型间分配的直方图的这种形状,以确认不同分层集群程序对HIV-1 V3分类的适用性。 亚型E的双模式分布可以陈列置这个亚型包括两个较薄的速度。

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