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一种对特定群中的亚群进行定量分析的方法

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摘要

一种对特定群中的亚群进行定量分析的方法。具体地，包括以下步骤：(1)提供对应于所述特定群的(a)参考基因组序列数据、(b)参考SNP矩阵和(c)宏基因组测序数据；(2)将所述宏基因组测序数据比对到对应于所述特定群的参考基因组数据上，以便获得比对结果；(3)根据所述参考SNP矩阵的位点信息，构建频率矩阵；(4)根据频率矩阵对参考SNP矩阵做二值化处理，得到二值化SNP矩阵；和(5)基于所述的频率矩阵、所述的二值化SNP矩阵、理论碱基频率向量f(x)和观测碱基频率向量y，通过有约束的线性模型，得出所述特定群中各亚群的相对丰度，从而获得对所述特定群中的亚群的定量分析结果。

著录项

  • 公开/公告号CN109997193A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-07-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳华大生命科学研究院;

    申请/专利号CN201680090780.0

  • 发明设计人 彭也;李俊桦;唐珊媚;张慧;

    申请日2016-11-10

  • 分类号

  • 代理机构上海一平知识产权代理有限公司;

  • 代理人胡丹

  • 地址 518083 广东省深圳市盐田区盐田街道北山工业区综合楼

  • 入库时间 2024-02-19 12:22:45

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-08-02

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B25/00 申请日:20161110

    实质审查的生效

  • 2019-07-09

    公开

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