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准确鉴定鲶和大口鲶的试剂盒及其鉴定方法

摘要

本发明提供了一种准确鉴定鲶和大口鲶的试剂盒及其检测方法,该试剂盒包括DNA提取试剂,包括试剂1、试剂2、试剂3、试剂4和试剂5;聚合酶链式反应试剂,包括反应预混试剂6和试剂7;电泳和显色试剂,包括试剂8、试剂9、试剂10和试剂11。本发明特别提供一对特异引物NS和NA,利用该对引物进行PCR扩增反应可准确鉴定鲶和大口鲶,特点是准确、批量、对鉴定鱼损伤轻,不会导致被鉴定活鱼死亡。

著录项

  • 公开/公告号CN101024858A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2007-08-29

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 西南大学;

    申请/专利号CN200710078355.2

  • 发明设计人 张其中;

    申请日2007-03-30

  • 分类号C12Q1/68;

  • 代理机构重庆华科专利事务所;

  • 代理人康海燕

  • 地址 400715 重庆市北碚区天生路1号

  • 入库时间 2023-12-17 19:03:16

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2013-05-22

    未缴年费专利权终止 IPC(主分类):C12Q1/68 授权公告日:20090923 终止日期:20120330 申请日:20070330

    专利权的终止

  • 2009-09-23

    授权

    授权

  • 2007-10-24

    实质审查的生效

    实质审查的生效

  • 2007-08-29

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明涉及一种准确和批量鉴定鲶(Silurus asotus)和大口鲶的试剂盒,以及使用该试剂盒鉴定鲶和大口鲶(Silurus meridionalis)的方法。

背景技术

鲶和大口鲶在分类上都属于鲶属(Silurus)鱼类,鲶是世界上的广布种类,而大口鲶主要分布在我国长江、闽江、湘江等水系,一般有大口鲶分布的水系都有鲶分布。成体时鲶(S.asotus)的个体比大口鲶(S.meridionalis)小很多,可通过个体大小和外部特征区分它们。然而,在种苗阶段,一般在250g以下,两种鲶鱼形态极相似,仅凭外形特征很难将它们正确区分开,即便是很有经验的鱼类分类学工作者也难以正确鉴定它们。所以,急需建立准确的鉴定技术,让非专业人员也能准确鉴定两种鲶。近年来,分子鉴定(尤其是PCR)技术已开始在鱼类分类中应用,为了准确鉴定两种鲶,有必要建立PCR鉴定技术和研制PCR鉴定试剂盒。通过RAPD技术在鲶和大口鲶筛选到一差异条带,对该条带克隆测序后,将该序列在GenBank中比对发现没有找到与其高度同源的序列,说明是未知序列,以该序列为摸板设计特异引物(NS和NA)来区分鲶和大口鲶。

发明内容

本发明的首要目的在于提供一种准确鉴定鲶和大口鲶的试剂盒,特别是提供一对特异引物NS和NA,使用该试剂盒可准确区分鲶和大口鲶。本发明建立了准确鉴定两种鲶的PCR检测技术并研制了检测试剂盒,以满足科学研究和生产中种苗准确鉴定的需要。

本发明的另一目的在于提供上述检测试剂盒鉴定两种鲶的方法。

本发明的目的是由下述技术方案实现的:

一种准确鉴定鲶(Silurus asotus)和大口鲶(Silurus meridionalis)的试剂盒,包括DNA提取试剂、聚合酶链式反应(PCR)试剂、电泳和显色试剂:

(a)DNA提取试剂,包括

试剂1:DNA提取缓冲液:10mmol/L Tris-HCl(pH8.0),2mmol/L EDTA(pH8.0),0.4mol/L NaCl,1%SDS。

试剂2:蛋白酶K 20mg/mL。

试剂3:氯化钠6mol/L。

试剂4:异丙醇(分析纯)。

试剂5:70%乙醇。

(b)聚合酶链式反应试剂:包括反应预混试剂6和试剂7。

试剂6:含有10倍聚合酶链式反应缓冲液(含MgCl2 15mM)、特异引物对NS和NA、dNTP(四种脱氧核苷酸的混合物)和灭菌双蒸水,含量分别为2.5μl、0.5-0.75μl(10μM)、0.5-0.75μl(10μM)、0.5μl(10μM each)和19.375-20.375μl。

试剂7:Taq酶(5个单位/μl)。

(c)电泳和显色试剂,包括试剂8、试剂9、试剂10和试剂11。

试剂8:为50倍TAE(电泳缓冲液),含三羟基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,浓度分别为0.04M和0.001M;(实际使用时用蒸馏水稀释50倍)。

试剂9:为凝胶加样缓冲液,含w/v为40%的蔗糖和0.25%的溴酚蓝和二甲苯青FF;

试剂10:电泳级琼脂糖。

试剂11:溴化乙锭0.5μg/μl。

为了更好地实现本发明,所述特异引物NS和NA序列如下:

特异引物NS指5′AACTGTAGTCCACGAACAACATCTT 3′,

特异引物NA指5′CTAAACTTTCTTACGGCTTCTCCC 3′。

所述聚合酶链式反应试剂的优选组成为:试剂6:2.5μl 10×PCR Buffer,0.5μl NS,0.5μl NA,0.5μl dNTP(10mM each),20.375μl ddH2O;试剂7:0.125μl Taq酶。

采用上述的试剂盒鉴定鲶和大口鲶的方法,包括以下步骤:

(1)取鱼鳍50-100mg,剪碎,加400μl试剂1;

(2)加入10μl试剂2,55-65℃水浴2h,至颗粒完全溶解;

(3)加300μl试剂3,振荡混匀30秒,然后10,000×g离心30min,取上清至新离心管;

(4)加入等体积试剂4,-20℃放置1h,然后10,000×g离心15min,弃去上清;

(5)用1ml试剂5洗涤沉淀,10,000×g离心5min,空气中控干,灭菌双蒸水溶解,即为DNA提取液;

(6)PCR扩增:取0.5-1μl DNA作为PCR扩增的模板;取23.875-24.375μl试剂6与0.125μl试剂7混合;在热循环仪上通过94℃解链3-5分钟;然后用94℃变性20-30秒,60-62℃复性30-40秒钟,72℃延伸45-90秒钟,如此循环30-35次,最后在72℃保温8-12分钟,将扩增目的特异片段增加到108mol以上。

(7)电泳和显色检测:取5-10μl扩增后的样品,与1-2μl试剂9(凝胶加样缓冲液)混合,在1.0%(W/V)的琼脂糖凝胶(0.1g试剂10中加入10ml已稀释50倍的试剂8)中电泳(试剂8用蒸馏水稀释50倍作为工作电泳缓冲液),在紫外光下显色检测。如果出现一条约640核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为鲶;如果出现一条约420核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为大口鲶。

附图说明

图1为鉴定鲶和大口鲶试剂盒对两种鱼的鉴定实验结果图。

其中M:DNA marker,1:为鲶特征性条带(约640bp),2:为大口鲶特征性条带(约420bp)。

具体实施方式

下面实施例是进一步对本发明的说明,但本发明的实施方式不限于此。

实施例1

可使用100次的鉴定鲶和大口鲶的试剂盒,其成分组成如下:

(a)DNA提取试剂,包括

试剂1,40毫升,其成分为:10mmol/L Tris-HCl,pH8.0;2mmol/L EDTA,pH8.0;0.4mol/L NaCl,1%SDS;

试剂2,0.8毫升,其成分为:蛋白酶K,20mg/mL;

试剂3,30毫升,其成分为:氯化钠,6mol/L;

试剂4:30ml异丙醇(分析纯);

试剂5:100ml 70%乙醇。

(b)聚合酶链式反应试剂:包括反应预混试剂6和试剂7;

试剂6,含有100份以下组成成分(括号中的数字是1份的体积,100份的总量为2450μl):10倍聚合酶链式反应缓冲液(含MgCl215mM)(2.5μl)、特异引物NS(0.5μl(10μM))和NA(0.5μl(10μM))(请生物技术公司(如上海生工、英俊公司或大连Takara公司)按照序列(NS:5′AACTGTAGTCCACGAACAACATCTT 3′,NA:5′CTAAACTTTCTTACGGCTTCTCCC 3′)合成即可)、四种脱氧核苷酸的混合物(0.5μl(10μMeach))和灭菌双蒸水(20.375μl);

试剂7,130μl,推荐使用宝生物工程(大连)有限公司产品Taq酶,5U/μl;

(c)电泳和显色试剂,包括试剂8、试剂9、试剂10和试剂11;

试剂8,100毫升,为50倍电泳缓冲液,含三羟基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,浓度分别为0.04M和0.001M;(实际使用时用蒸馏水稀释50倍)

试剂9,0.5毫升,为凝胶加样缓冲液,含w/v为40%的蔗糖和0.25%的溴酚蓝和二甲苯青FF;

试剂10,10克电泳级琼脂糖;(使用时用稀释50倍的试剂8按W/V配置:1.0%琼脂糖)

试剂11,300μl溴化乙锭(0.5μg/μl)。(使用时按照每毫升琼脂糖加1μg溴化乙锭)

使用操作步骤:

1、取鱼鳍100mg,剪碎,加400μl试剂1;

2、加入10μl试剂2,55℃水浴2h,至溶液内无颗粒物;

3、加300μl试剂3,振荡混匀30秒,然后10,000×g离心30min,取上清至新离心管;

4、加入等体试剂4,-20℃放置1h,然后10,000×g离心15min,弃去上清;

5、用1ml试剂5洗涤沉淀,10,000×g离心5min,空气中控干,灭菌双蒸水溶解,即为DNA提取液;

6、PCR扩增:取0.5μlDNA作为PCR扩增的模板;取24.375μl试剂6与0.125μl试剂7混合;在热循环仪上通过94℃解链3分钟;然后用94℃变性30秒,62℃复性30秒钟,72℃延伸45秒钟,如此循环30次,最后在72℃保温8分钟。

7、电泳和显色检测:取10μl扩增后的样品,与2μl试剂9(凝胶加样缓冲液)混合,在1.0%(W/V)的琼脂糖凝胶(0.1g试剂10中加入10ml已稀释50倍的试剂8)中电泳(试剂8用蒸馏水稀释50倍作为工作电泳缓冲液),在紫外光下显色检测。如果出现一条约640核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为鲶;如果出现一条约420核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为大口鲶。

实施例2

1、取鱼鳍50mg,剪碎,加400μl试剂1;

2、加入10μl试剂2,60℃水浴约2h,至溶液内无颗粒物;

3、加300μl试剂3,振荡混匀30秒,然后10,000×g离心30min,取上清至新离心管;

4、加入等体积体试剂4,-20℃放置1h,然后10,000×g离心15min,弃去上清;

5、用1ml试剂5洗涤沉淀,10,000×g离心5min,空气中控干,灭菌双蒸水溶解,即为DNA提取液;

6、PCR扩增:取1μl DNA作为PCR扩增的模板;取23.875μl试剂6与0.125试剂7混合;在热循环仪上通过94℃解链3分钟;然后用94℃变性30秒,60℃复性30秒钟,72℃延伸45秒钟,如此循环30次,最后在72℃保温8分钟。

7、电泳和显色检测:取10μl扩增后的样品,与2μl试剂9(凝胶加样缓冲液)混合,在1.0%(W/V)的琼脂糖凝胶(0.1g试剂10中加入10ml已稀释50倍的试剂8)中电泳(试剂8用蒸馏水稀释50倍作为工作电泳缓冲液),在紫外光下显色检测。如果出现一条约640核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为鲶;如果出现一条约420核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为大口鲶,检测结果见图1。

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