法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
2013-05-22
未缴年费专利权终止 IPC(主分类):C12Q1/68 授权公告日:20090923 终止日期:20120330 申请日:20070330
专利权的终止
2009-09-23
授权
授权
2007-10-24
实质审查的生效
实质审查的生效
2007-08-29
公开
公开
技术领域
本发明涉及一种准确和批量鉴定鲶(Silurus asotus)和大口鲶的试剂盒,以及使用该试剂盒鉴定鲶和大口鲶(Silurus meridionalis)的方法。
背景技术
鲶和大口鲶在分类上都属于鲶属(Silurus)鱼类,鲶是世界上的广布种类,而大口鲶主要分布在我国长江、闽江、湘江等水系,一般有大口鲶分布的水系都有鲶分布。成体时鲶(S.asotus)的个体比大口鲶(S.meridionalis)小很多,可通过个体大小和外部特征区分它们。然而,在种苗阶段,一般在250g以下,两种鲶鱼形态极相似,仅凭外形特征很难将它们正确区分开,即便是很有经验的鱼类分类学工作者也难以正确鉴定它们。所以,急需建立准确的鉴定技术,让非专业人员也能准确鉴定两种鲶。近年来,分子鉴定(尤其是PCR)技术已开始在鱼类分类中应用,为了准确鉴定两种鲶,有必要建立PCR鉴定技术和研制PCR鉴定试剂盒。通过RAPD技术在鲶和大口鲶筛选到一差异条带,对该条带克隆测序后,将该序列在GenBank中比对发现没有找到与其高度同源的序列,说明是未知序列,以该序列为摸板设计特异引物(NS和NA)来区分鲶和大口鲶。
发明内容
本发明的首要目的在于提供一种准确鉴定鲶和大口鲶的试剂盒,特别是提供一对特异引物NS和NA,使用该试剂盒可准确区分鲶和大口鲶。本发明建立了准确鉴定两种鲶的PCR检测技术并研制了检测试剂盒,以满足科学研究和生产中种苗准确鉴定的需要。
本发明的另一目的在于提供上述检测试剂盒鉴定两种鲶的方法。
本发明的目的是由下述技术方案实现的:
一种准确鉴定鲶(Silurus asotus)和大口鲶(Silurus meridionalis)的试剂盒,包括DNA提取试剂、聚合酶链式反应(PCR)试剂、电泳和显色试剂:
(a)DNA提取试剂,包括
试剂1:DNA提取缓冲液:10mmol/L Tris-HCl(pH8.0),2mmol/L EDTA(pH8.0),0.4mol/L NaCl,1%SDS。
试剂2:蛋白酶K 20mg/mL。
试剂3:氯化钠6mol/L。
试剂4:异丙醇(分析纯)。
试剂5:70%乙醇。
(b)聚合酶链式反应试剂:包括反应预混试剂6和试剂7。
试剂6:含有10倍聚合酶链式反应缓冲液(含MgCl2 15mM)、特异引物对NS和NA、dNTP(四种脱氧核苷酸的混合物)和灭菌双蒸水,含量分别为2.5μl、0.5-0.75μl(10μM)、0.5-0.75μl(10μM)、0.5μl(10μM each)和19.375-20.375μl。
试剂7:Taq酶(5个单位/μl)。
(c)电泳和显色试剂,包括试剂8、试剂9、试剂10和试剂11。
试剂8:为50倍TAE(电泳缓冲液),含三羟基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,浓度分别为0.04M和0.001M;(实际使用时用蒸馏水稀释50倍)。
试剂9:为凝胶加样缓冲液,含w/v为40%的蔗糖和0.25%的溴酚蓝和二甲苯青FF;
试剂10:电泳级琼脂糖。
试剂11:溴化乙锭0.5μg/μl。
为了更好地实现本发明,所述特异引物NS和NA序列如下:
特异引物NS指5′AACTGTAGTCCACGAACAACATCTT 3′,
特异引物NA指5′CTAAACTTTCTTACGGCTTCTCCC 3′。
所述聚合酶链式反应试剂的优选组成为:试剂6:2.5μl 10×PCR Buffer,0.5μl NS,0.5μl NA,0.5μl dNTP(10mM each),20.375μl ddH2O;试剂7:0.125μl Taq酶。
采用上述的试剂盒鉴定鲶和大口鲶的方法,包括以下步骤:
(1)取鱼鳍50-100mg,剪碎,加400μl试剂1;
(2)加入10μl试剂2,55-65℃水浴2h,至颗粒完全溶解;
(3)加300μl试剂3,振荡混匀30秒,然后10,000×g离心30min,取上清至新离心管;
(4)加入等体积试剂4,-20℃放置1h,然后10,000×g离心15min,弃去上清;
(5)用1ml试剂5洗涤沉淀,10,000×g离心5min,空气中控干,灭菌双蒸水溶解,即为DNA提取液;
(6)PCR扩增:取0.5-1μl DNA作为PCR扩增的模板;取23.875-24.375μl试剂6与0.125μl试剂7混合;在热循环仪上通过94℃解链3-5分钟;然后用94℃变性20-30秒,60-62℃复性30-40秒钟,72℃延伸45-90秒钟,如此循环30-35次,最后在72℃保温8-12分钟,将扩增目的特异片段增加到108mol以上。
(7)电泳和显色检测:取5-10μl扩增后的样品,与1-2μl试剂9(凝胶加样缓冲液)混合,在1.0%(W/V)的琼脂糖凝胶(0.1g试剂10中加入10ml已稀释50倍的试剂8)中电泳(试剂8用蒸馏水稀释50倍作为工作电泳缓冲液),在紫外光下显色检测。如果出现一条约640核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为鲶;如果出现一条约420核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为大口鲶。
附图说明
图1为鉴定鲶和大口鲶试剂盒对两种鱼的鉴定实验结果图。
其中M:DNA marker,1:为鲶特征性条带(约640bp),2:为大口鲶特征性条带(约420bp)。
具体实施方式
下面实施例是进一步对本发明的说明,但本发明的实施方式不限于此。
实施例1
可使用100次的鉴定鲶和大口鲶的试剂盒,其成分组成如下:
(a)DNA提取试剂,包括
试剂1,40毫升,其成分为:10mmol/L Tris-HCl,pH8.0;2mmol/L EDTA,pH8.0;0.4mol/L NaCl,1%SDS;
试剂2,0.8毫升,其成分为:蛋白酶K,20mg/mL;
试剂3,30毫升,其成分为:氯化钠,6mol/L;
试剂4:30ml异丙醇(分析纯);
试剂5:100ml 70%乙醇。
(b)聚合酶链式反应试剂:包括反应预混试剂6和试剂7;
试剂6,含有100份以下组成成分(括号中的数字是1份的体积,100份的总量为2450μl):10倍聚合酶链式反应缓冲液(含MgCl215mM)(2.5μl)、特异引物NS(0.5μl(10μM))和NA(0.5μl(10μM))(请生物技术公司(如上海生工、英俊公司或大连Takara公司)按照序列(NS:5′AACTGTAGTCCACGAACAACATCTT 3′,NA:5′CTAAACTTTCTTACGGCTTCTCCC 3′)合成即可)、四种脱氧核苷酸的混合物(0.5μl(10μMeach))和灭菌双蒸水(20.375μl);
试剂7,130μl,推荐使用宝生物工程(大连)有限公司产品Taq酶,5U/μl;
(c)电泳和显色试剂,包括试剂8、试剂9、试剂10和试剂11;
试剂8,100毫升,为50倍电泳缓冲液,含三羟基甲基氨基甲烷-乙酸和乙二胺四乙酸,浓度分别为0.04M和0.001M;(实际使用时用蒸馏水稀释50倍)
试剂9,0.5毫升,为凝胶加样缓冲液,含w/v为40%的蔗糖和0.25%的溴酚蓝和二甲苯青FF;
试剂10,10克电泳级琼脂糖;(使用时用稀释50倍的试剂8按W/V配置:1.0%琼脂糖)
试剂11,300μl溴化乙锭(0.5μg/μl)。(使用时按照每毫升琼脂糖加1μg溴化乙锭)
使用操作步骤:
1、取鱼鳍100mg,剪碎,加400μl试剂1;
2、加入10μl试剂2,55℃水浴2h,至溶液内无颗粒物;
3、加300μl试剂3,振荡混匀30秒,然后10,000×g离心30min,取上清至新离心管;
4、加入等体试剂4,-20℃放置1h,然后10,000×g离心15min,弃去上清;
5、用1ml试剂5洗涤沉淀,10,000×g离心5min,空气中控干,灭菌双蒸水溶解,即为DNA提取液;
6、PCR扩增:取0.5μlDNA作为PCR扩增的模板;取24.375μl试剂6与0.125μl试剂7混合;在热循环仪上通过94℃解链3分钟;然后用94℃变性30秒,62℃复性30秒钟,72℃延伸45秒钟,如此循环30次,最后在72℃保温8分钟。
7、电泳和显色检测:取10μl扩增后的样品,与2μl试剂9(凝胶加样缓冲液)混合,在1.0%(W/V)的琼脂糖凝胶(0.1g试剂10中加入10ml已稀释50倍的试剂8)中电泳(试剂8用蒸馏水稀释50倍作为工作电泳缓冲液),在紫外光下显色检测。如果出现一条约640核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为鲶;如果出现一条约420核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为大口鲶。
实施例2
1、取鱼鳍50mg,剪碎,加400μl试剂1;
2、加入10μl试剂2,60℃水浴约2h,至溶液内无颗粒物;
3、加300μl试剂3,振荡混匀30秒,然后10,000×g离心30min,取上清至新离心管;
4、加入等体积体试剂4,-20℃放置1h,然后10,000×g离心15min,弃去上清;
5、用1ml试剂5洗涤沉淀,10,000×g离心5min,空气中控干,灭菌双蒸水溶解,即为DNA提取液;
6、PCR扩增:取1μl DNA作为PCR扩增的模板;取23.875μl试剂6与0.125试剂7混合;在热循环仪上通过94℃解链3分钟;然后用94℃变性30秒,60℃复性30秒钟,72℃延伸45秒钟,如此循环30次,最后在72℃保温8分钟。
7、电泳和显色检测:取10μl扩增后的样品,与2μl试剂9(凝胶加样缓冲液)混合,在1.0%(W/V)的琼脂糖凝胶(0.1g试剂10中加入10ml已稀释50倍的试剂8)中电泳(试剂8用蒸馏水稀释50倍作为工作电泳缓冲液),在紫外光下显色检测。如果出现一条约640核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为鲶;如果出现一条约420核苷酸对(bp)的条带,说明该鱼为大口鲶,检测结果见图1。
机译: 了解利什曼原虫抗原,多核苷酸,药物成分的融合多肽,以及用于利什曼病和诊断试剂盒的感染检测和鉴定试剂盒,用于检测和鉴定试剂盒的感染鉴定方法
机译: 丙烷氧化细菌的染色体DNA所得的DNA序列,包含prmA或prmD基因,与上述序列互补的寡核苷酸,细菌的鉴定和定量方法,细菌的鉴定顺序,试剂盒的试剂盒prmA和prmD基因鉴定基因扩增的主因及发现油藏或天然气藏的方法
机译: 用于鉴定生物样品中抗蚂蚁碳水化合物含量的侧向流动测试装置,用于鉴定生物样品中碳水化合物抗蚂蚁试剂盒的试剂盒,生产该测试装置的方法以及用于鉴定样品生物样品中抗微生物碳水化合物的方法钙