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HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法

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本发明属于基因组学和生物信息领域，涉及HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法。具体地，所述构建HLA基因型别-SNP连锁数据库的方法，包括如下步骤：a）选择一个或多个HLA基因座的序列作为参考序列；b）将现有HLA数据库中已知型别的HLA基因与参考序列比对，找出与参考序列的差异位点即SNP位点，得到每个型别相对于参考序列的SNP连锁关系，构建HLA基因型别-SNP连锁数据库。本发明还涉及确定HLA基因的SNP连锁关系的方法，以及HLA分型装置。本发明的分型方法实现了HLA的低成本，高通量、高准确率、高分辨率的分型。

著录项

公开/公告号CN103221551B

专利类型发明专利
公开/公告日2015-10-07

原文格式PDF
申请/专利权人深圳华大基因股份有限公司;
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申请/专利号CN201080070269.7
发明设计人曹红志;张伟;王煜;
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申请日2010-11-23
分类号C12Q1/68(20060101);
代理机构中国国际贸易促进委员会专利商标事务所;
代理人刘海罗
地址 518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层
入库时间 2022-08-23 09:30:11

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2017-12-29

专利权的转移 IPC(主分类):C12Q1/68 登记生效日:20171211 变更前: 变更后: 申请日:20101123

专利申请权、专利权的转移
2015-10-07

授权

授权
2015-08-19

专利申请权的转移 IPC(主分类):C12Q1/68 变更前: 变更后: 登记生效日:20150727 申请日:20101123

专利申请权、专利权的转移
2013-08-21

实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20101123

实质审查的生效
2013-07-24

公开

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1. HLA基因型别-SNP连锁数据库、其构建方法、以及HLA分型方法 [P] . 中国专利： CN103221551B . 2015.10.07
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机译： HLA基因型-SNP链接数据库，其构建方法和HLA分型方法
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机译： hla dna分型方法，引物组和hla基因dna分型试剂盒
5. method to determine if a patient is hla-b * 1502, kit to determine if a patient is hla-b * 1502, three probe kit to determine if a patient is hla-b * 1502, method to determine if a patient is hla-b * 5801, kit to determine if a patient is hla-b * 5801, three probe kit to determine if a patient is hla-b * 5801 and method to determine if A compound is a candidate that induces a drug-induced adverse reaction (adr) in a patient who has a hla allele associated with drug-induced adr [P] . BRPI0710436A8 . 2018-06-26

机译：确定患者是否为hla-b * 1502的方法，确定患者是否为hla-b * 1502的试剂盒，确定患者是否为hla-b * 1502的三探针试剂盒，确定患者是否为hla-b * 1502的方法b * 5801，确定患者是否为hla-b * 5801的试剂盒，三探针确定患者是否为hla-b * 5801的试剂盒，以及确定化合物是否为可诱发药物诱导的不良反应的候选药物的方法（ adr）患有与药物诱导的adr相关的hla等位基因的患者