首页> 中国专利> 蛋白质信号肽及其切割位点预测实现方法

蛋白质信号肽及其切割位点预测实现方法

页面导航

摘要
著录项
相似文献

摘要

一种基于融合领域规则和深度学习的蛋白质信号肽及其切割位点预测实现方法，以待测氨基酸序列的PSSM和HMM合成其氨基酸序列表征后，依次通过序列级分类和残基级分类得到待测氨基酸序列是否包含信号肽、跨膜螺旋或属于非分泌蛋白以及每个残基具体属于信号肽、切割位点或成熟蛋白质，再根据预测结果进行加权合并后以最大统计分数对应的位点作为最终预测出的信号肽切割位点。本发明利用深度模型直接分类信号肽、跨膜螺旋及非分泌蛋白，通过在biLSTM网络上结合自注意力机制显著提升了识别蛋白质信号肽切割位点识别的精度。

著录项

公开/公告号CN111091871B

专利类型发明专利
公开/公告日2022-02-18

原文格式PDF
申请/专利权人上海交通大学;
展开▼

申请/专利号CN201911317226.3
发明设计人张维洵;潘小勇;沈红斌;
展开▼

申请日2019-12-19
分类号G16B20/30(20190101);G06N3/04(20060101);G06N3/08(20060101);
代理机构31201 上海交达专利事务所;
代理人王毓理;王锡麟
地址 200240 上海市闵行区东川路800号
入库时间 2022-08-23 13:07:58

相似文献

专利
中文文献
外文文献

1. 蛋白质信号肽及其切割位点预测实现方法 [P] . 中国专利： CN111091871B . 2022.02.18
2. 一种基于分层混合模型的信号肽及其切割位点的预测方法 [P] . 中国专利： CN106951735B . 2019.06.04
3. METHOD AND APPARATUS FOR PREDICTING A SIGNAL PEPTIDE CLEAVAGE SITE [P] . 世界知识产权组织专利： WO0181929A3 . 2003-08-21

机译：预测信号肽切割位点的方法和装置
4. METHOD AND APPARATUS FOR PREDICTING A SIGNAL PEPTIDE CLEAVAGE SITE [P] . 欧洲知识产权局专利： EP1356410A2 . 2003-10-29

机译：预测信号肽切割位点的方法和装置
5. Method and apparatus for predicting a signal peptide cleavage site [P] . 美国专利： US2002019012A1 . 2002-02-14

机译：预测信号肽切割位点的方法和装置