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猪乙型脑炎病毒SH0601株基因组序列分析

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将猪源JEV SH0601株基因组RNA分五段进行RT-PCR并克隆入pCRII-Blunt-TOPO和pBluescript载体中,测定了全长cDNA序列,并根据E蛋白基因序列对SH0601株进行了遗传分型.cDNA序列分析结果表明:SH0601株基因组全长10977nt,与GenBank中的Beijing-1、P3,SA14和SA14-14-2株基因组全长相比,在3NTR的1070Int处多一碱基"G",与上述四株病毒的全长核苷酸的同源率都达97.2%以上,而与国外猪源分离株KV1899和EV/sw/Mie/41/2002全长核苷酸的同源率仅迭88.7%,但SH0601株与六株病毒的全长氨基酸同源率均达97.0%以上.以E蛋白基因序列对SH0601作进化分析,该分离株属基因型Ⅲ型.

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来源
《中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第三届猪病防控学术研讨会》|2008年|572-576|共5页
会议地点大连
作者

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作者单位

中国畜牧兽医学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类猪;家畜病毒学;
关键词
猪乙型脑炎病毒; 病毒基因组; 序列分析;

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