【24h】

Computational tools for structure based drug design

机译:基于结构的药物设计的计算工具

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摘要

This paper presents some methods found to be of utility in Structure Based Drug Design. We describe the use of combined molecular mechanics, small molecule conformational search and continuum solvation models to develop semi-quantitative ranking of relative binding free energy for small molecules to proteins. We present results of these types of calculations for several proteins: thymidylate synthase, FK506 binding protein (FKBP), and stromelysin-1 (MMP-3).
机译:本文介绍了一些发现在基于结构的药物设计中的方法。 我们描述了使用组合的分子力学,小分子构象搜索和连续溶剂化模型,为小分子与蛋白质的相对结合能量的半定量排名产生半定量等级。 我们存在几种蛋白质的这些类型的计算结果:胸苷合酶,FK506结合蛋白(FKBP)和基团-1(MMP-3)。

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