蛋白质构象激活和分子识别机制的分子动力学研究

声明

第一章 研究背景与文献综述

1.1 热休克蛋白90的结构与功能

1.2 酪氨酸激酶c-Src及其突变体v-Src

1.3 牛血清白蛋白（BSA）纳米颗粒

1.4 选题意义和本论文工作

参考文献

第二章 分子模拟方法

2.1 分子模拟简介

2.2 分子动力学模拟

2.3 操纵式分子动力学模拟（SMD）

2.4 自由能计算方法

2.5 量子化学计算方法

2.6 泊松-波尔兹曼连续静电计算

参考文献

第三章 热休克蛋白90中ATP水解机理及构象转换

3.1 引言

3.2 模拟方法及建模

3.3 热休克蛋白90中的ATP水解机理

3.4 翻译后修饰或突变对热休克蛋白90的构象及其ATP水解反应的影响

3.5 本章小结

参考文献

第四章 酪氨酸激酶Src的激活机制及其对热休克蛋白90的依赖性

4.1 引言

4.2 模拟方法与建模

4.3 ATP结合和Tyr416磷酸化对野生型激酶c-Src的影响

4.4 野生型激酶c-Src及其突变体的激活机制

4.5 野生型激酶c-Src及其突变体对热休克蛋白90的依赖性

4.6 不活泼状态下野生型激酶c-Src与突变体的比较研究

4.7 本章小结

参考文献

5.1 引言

5.2 模拟方法及建模

5.3 干扰素α-1b在牛血清白蛋白上的作用位点

5.4 干扰素α-1b与牛血清白蛋白的相互作用机制

5.5 干扰素α-1b及小分子药物对牛血清白蛋白的亲和力

5.6 牛血清白蛋白在钛酸锶晶面上的吸附

5.7本章小结

参考文献

第六章 总结与展望

6.1 工作小结

6.2 展望

致谢

博士期间学术研究成果