Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究

李晓晖; 赵俊伟; 滕虎; 西野宪和; 修志龙

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Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究

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采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases, HDACs)中的HDAC1和HDAC8. 通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型, 将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟, 结果表明, HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apicidin-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键, 而在HDAC8中未发现, 这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.

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来源
《高等学校化学学报》 |2010年第2期|374-378|共5页
作者
李晓晖; 赵俊伟; 滕虎; 西野宪和; 修志龙;
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作者单位

大连理工大学环境与生命学院,大连,116024;

大连理工大学环境与生命学院,大连,116024;

大连理工大学环境与生命学院,大连,116024;

日本九州工业大学大学院生命体工学研究科,北九州,808-0196;

大连理工大学环境与生命学院,大连,116024;

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正文语种 chi
中图分类结构化学;
关键词
组蛋白脱乙酰酶抑制剂; 组蛋白去乙酰化酶(HDACs); 分子动力学; 同源模建; 分子对接;

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