基于转录组的蔗茅CML基因家族鉴定及冷胁迫表达分析

钱禛锋; 谷书杰; 赵雪婷; 饶席兵; 曾丹; 沈庆庆; 张蓉琼; 陈疏影; 何丽莲; 李富生

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基于转录组的蔗茅CML基因家族鉴定及冷胁迫表达分析

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类钙调蛋白（calmodulin-like protein, CML）是植物细胞中的钙离子结合蛋白，在植物生长发育和逆境胁迫的信号转导中具有重要的功能。为探究冷胁迫下蔗茅（Erianthus fulvus） CML家族基因的表达模式，本研究基于转录组数据在蔗茅中鉴定出39个EfCML家族基因，并进行了生物信息学和冷胁迫下的表达分析。蛋白质理化性质分析表明，蔗茅EfCMLs氨基酸残基数目为59～312，分子量大小为6.240 21～34.017 78 kD，等电点为3.99～11.14。亚细胞定位预测结果显示，39个EfCMLs分别定位于细胞质、细胞膜和细胞核中。保守结构域分析发现，EfCML家族蛋白含有1～4个典型的EF-hand结构域。基序（motif）分析表明，EfCML家族蛋白含有1～4个典型的Ca2+结合基序。进化树分析表明，EfCMLs蛋白分为11个组群。冷胁迫表达分析表明，低温诱导EfCML家族基因差异表达，其中EfCML1和EfCML2基因表达持续上调，在72 h冷胁迫下达到峰值，分别为对照的27和35倍（P＜0.01），呈现最活跃状态。本研究为深入解析蔗茅CML基因的冷胁迫调控机理提供基础资料。

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来源
《农业生物技术学报》 |2022年第5期|885-895|共11页
作者
钱禛锋; 谷书杰; 赵雪婷; 饶席兵; 曾丹; 沈庆庆; 张蓉琼; 陈疏影; 何丽莲; 李富生;
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作者单位

1. 云南农业大学农学与生物技术学院 2. 云南农业大学甘蔗研究所;

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正文语种 chi
中图分类甘蔗;
关键词
蔗茅; 类钙调蛋白（CML）家族; 生物信息学分析; 冷胁迫; 表达分析;

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