摘要：大黄鱼属于硬骨鱼纲，鲈形目，石首鱼科，广泛分布于黄海中部以南至琼州海峡以东的中国大陆近海及朝鲜西海岸，是一种重要的经济鱼类。20世纪90年代以后，随着捕捞船大量增加，捕捞手段不断提高，已经造成资源日趋衰退，高密度的人工养殖已经造成大黄鱼免疫力下降，加之养殖区域水质严重恶化，从而导致养殖大黄鱼疾病频繁发生。清道夫受体(Scavenger receptors,SRs)是生物体中极其重要的一类模式识别受体,主要包括8个不同的家族.本研究主要基于大黄鱼全基因组信息,通过基因克隆得到SCARA3,SCARA5和MARCO在内的3个A家族基因(命名为TycSA3,TycSA5和TycMAC),其完整开放阅读框(ORF)长度分别为1 938 bp,1 677 bp和1 218bp(GenBank序列号为KJ467772,KJ467773和KJ467771),编码645,558和405个氨基酸.经序列比对和系统进化分析发现所得到的3个基因与已知的SCARA3,SCARA5和MARCO基因高度同源.进化树显示TycSA3和TycSA5分别与其他硬骨鱼类的相关基因聚成一支,而TycMAC却与爬行动物聚成一支,因此3个基因在进化上存在一定的差异.ClustalW分析显示TycSA3与其他物种的SCARA3的同源性为59％～71％,TycSA5为55％～72％,而TycMAC只有38％左右.在TycSA3,TycSA5和TycMAC中都发现了许多重要的结构域和保守位点,例如,羧基末端的6个半胱氨酸富集区(在TycSA5中有C-482,C-495,C-526,C-536,C-546和C556,在TycMAC有中C-333,C-346,C-374,C-384,C-394和C-404).在TycSA3和TycSA5中还发现了两处与TRAF2结合的结构域和涉及内在折叠的酪氨酸保守区.利用GeneMaper v2.5对3个基因的DNA序列进行分析,TycSA3和TycMAC的外显子都为13个,内含子12个,TycSA5则短一些只有12个外显子和11个内含子.对8种组织差异性表达分析表明,TycSA3,TycSA5和TycMAC均在脾脏出现最高表达,在肌肉,脑和肝脏中都有较高表达.进一步通过溶藻弧菌感染,检测脾脏中3个基因的时序变化情况,结果显示溶藻弧菌可上调3个基因的表达,但最高表达量出现的时间略有差别,相对于TycSA3,TycSA5和TycMAC基因对感染较为敏感且反应较为迅速.上述结果将有助于理解清道夫受体在石首鱼类天然免疫受体中的作用,为今后开展鱼病防治和疫苗研究提供借鉴.
