。B、根据生物分子在网络中的拓扑的相似特征，计算生物分子的相似矩阵S。C、构建专家知识字典。D、基于专家知识，以邻居优先策略进行搜索，获得结果子网。E、计算结果子网R（Gr）与目标子网T（Gt）的相似得分。F、计算p值。G、结果子网可视化。与同类方法相比，该方法计算准确度更高，具有更高的稳定性，能更好地处理生物分子网络间的“空隙”（Gap），获得更多的保守边和节点，且能较好地反映生物分子网络之间的变化情况。"/> 基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法（CN201210358669.9）-中国专利【掌桥科研】
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基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法

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摘要

本发明公开了基于专家知识与拓扑相似的邻居优先生物分子子网搜索方法。其步骤如下：A、根据生物分子的序列特征，构建网络T（Gt）和B（GB）中生物分子的初始相似矩阵。B、根据生物分子在网络中的拓扑的相似特征，计算生物分子的相似矩阵S。C、构建专家知识字典。D、基于专家知识，以邻居优先策略进行搜索，获得结果子网。E、计算结果子网R（Gr）与目标子网T（Gt）的相似得分。F、计算p值。G、结果子网可视化。与同类方法相比，该方法计算准确度更高，具有更高的稳定性，能更好地处理生物分子网络间的“空隙”（Gap），获得更多的保守边和节点，且能较好地反映生物分子网络之间的变化情况。

著录项

  • 公开/公告号CN102902896B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2016-02-17

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海大学;

    申请/专利号CN201210358669.9

  • 发明设计人 谢江;谭军;马进;张武;文铁桥;

    申请日2012-09-25

  • 分类号G06F19/24(20110101);

  • 代理机构31205 上海上大专利事务所(普通合伙);

  • 代理人何文欣

  • 地址 200444 上海市宝山区上大路99号

  • 入库时间 2022-08-23 09:35:48

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-09-10

    未缴年费专利权终止 IPC(主分类):G06F19/24 授权公告日:20160217 终止日期:20180925 申请日:20120925

    专利权的终止

  • 2016-02-17

    授权

    授权

  • 2013-03-13

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/24 申请日:20120925

    实质审查的生效

  • 2013-01-30

    公开

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