遗传差异

摘要： 2022年2月,北京市农林科学院植物保护研究所食用菌研究室在《Journal of Fungi》发表题为“Haplotype-Resolved Genome Analyses Reveal Genetically Distinct Nuclei within a Commercial Cultivar of Lentinula edodes”的研究论文。该研究基于HiFi测序和Hi-C辅助组装,构建了迄今最完整的香菇单倍型基因组。

摘要： 心房颤动(Atrial fibrillation, AF)作为临床上最常见的心律失常性疾病,其治疗方式多种多样,但发病机制目前仍未完全明确阐明。近年来学者们发现遗传因素在房颤的发生发展中也发挥着重要的作用,越来越多的房颤相关基因被发现。研究显示不同人群中房颤相关基因对房颤风险的影响尚不完全一致。现对房颤相关基因在不同人群中的研究做一综述。

摘要： 本研究利用单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)分子标记技术对内蒙古36份马铃薯品种进行基因组扩增分析。结果表明,供试的11对引物共扩增出70条条带,其中多态性条带66条,多态性百分率94.2%,平均扩增片段数和扩增多态性均呈现较好的效果。聚类分析结果表明,按不同聚类方法可分别将36份材料聚为4个大的类群,不同聚类群之间存在一定的遗传差异,充分证明供试马铃薯品种间存在丰富的遗传多样性,为内蒙古地区马铃薯的育种亲本和杂种优势提供理论依据,初步构建36份马铃薯材料的指纹图谱。

摘要： 为明确内农薯1号(NNS-1)、内农薯2号(NNS-2)、内农薯3号(NNS-3)、内农薯4号(NNS-4)、内农薯5号(NNS-5)、内农薯6号(NNS-6)、红彩5号(HC-5)、紫彩1号(ZC-1)、紫彩2号(ZC-2)、紫彩3号(ZC-3)等10个马铃薯新品种在DNA分子水平上的遗传差异性,提取10个马铃薯新品种基因组DNA,并利用SSR分子标记技术对其进行了遗传差异性和聚类分析。结果表明,筛选出SSR适宜引物10对,PCR扩增实验得到多态性条带位点117个,多态性位点数占总位点的84.17%。聚类分析显示,10个马铃薯品种的遗传距离(GD值)变幅在0.1264~0.7143之间。以GD值0.55为基准,将10个材料划分为四类:NNS-1、NNS-2和HC-5为第一类;NNS-3、NNS-4和NNS-5为第二类;ZC-1、ZC-2和ZC-3为第三类;NNS-6为第四类;2个特异性引物S 189和S 25扩增的SSR指纹图可明确识别10个马铃薯新品种在DNA水平上的遗传差异。

摘要： 为了揭示罗非鱼"粤闽1号"母本——尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus的遗传背景及其选育群体世代间的遗传变异,采用13对荧光标记微卫星引物分析了罗非鱼"粤闽1号"母本3个不同选育世代(F2、F4和F6世代)的遗传多样性和遗传结构,并进一步分析了它们与高要(GY)、惠州(HZ)、茂名(MM)和无锡(WX)4个尼罗罗非鱼地理群体之间的遗传关系.结果表明:F2、F4和F6 3个选育世代的等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度、Shannon指数和多态性信息含量等遗传多样性参数均呈现出随着选育世代增加而降低的趋势,但仍表现为高度多态性(PIC>0.5);4个尼罗罗非鱼地理群体的遗传多样性依次为GY群体>MM群体>HZ群体>WX群体,其中GY群体、MM群体和HZ群体的遗传多样性显著高于3个选育世代;随着罗非鱼"粤闽1号"母本的选育世代增加,世代间遗传距离(Da)逐渐增大(F2～F4的Da = 0.155 6,F4～F6的Da=0.375 7),遗传分化系数(FST)也逐渐升高(F2～F4的FST = 0.036 4,F4～F6的FST= 0.111 1);在UPGMA系统进化树中,3个选育世代群体与HZ群体、GY群体聚为一支,说明它们的遗传背景相近;罗非鱼"粤闽1号"3个选育世代母本的与4个地理群体中的GY、HZ和MM群体之间遗传分化中等,与WX群体之间遗传分化较大.研究表明:罗非鱼"粤闽1号"母本的选育群体在选育过程中遗传多样性出现下降趋势,遗传分化不断加剧,F6与F2、F4遗传分化中等,但仍保持着较高遗传多样性,具有进一步选育潜力;4个尼罗罗非鱼地理群体中GY群体的遗传多样性最高,与选育群体F6的遗传距离适中(Da<0.54),可作为潜在的引种群体与罗非鱼"粤闽1号"母本的选育群体进行杂交,从而提高其遗传多样性.

摘要： 为了揭示罗非鱼“粤闽1号”母本——尼罗罗非鱼Oreochromis niloticus的遗传背景及其选育群体世代间的遗传变异,采用13对荧光标记微卫星引物分析了罗非鱼“粤闽1号”母本3个不同选育世代(F2、F4和F6世代)的遗传多样性和遗传结构,并进一步分析了它们与高要(GY)、惠州(HZ)、茂名(MM)和无锡(WX)4个尼罗罗非鱼地理群体之间的遗传关系。结果表明:F2、F4和F63个选育世代的等位基因数、有效等位基因数、期望杂合度、Shannon指数和多态性信息含量等遗传多样性参数均呈现出随着选育世代增加而降低的趋势,但仍表现为高度多态性(PIC>0.5);4个尼罗罗非鱼地理群体的遗传多样性依次为GY群体>MM群体>HZ群体>WX群体,其中GY群体、MM群体和HZ群体的遗传多样性显著高于3个选育世代;随着罗非鱼“粤闽1号”母本的选育世代增加,世代间遗传距离(D_(a))逐渐增大(F2~F4的D_(a)=0.1556,F4~F6的D_(a)=0.3757),遗传分化系数(F_(ST))也逐渐升高(F2~F4的F_(ST)=0.0364,F4~F6的F_(ST)=0.1111);在UPGMA系统进化树中,3个选育世代群体与HZ群体、GY群体聚为一支,说明它们的遗传背景相近;罗非鱼“粤闽1号”3个选育世代母本的与4个地理群体中的GY、HZ和MM群体之间遗传分化中等,与WX群体之间遗传分化较大。研究表明:罗非鱼“粤闽1号”母本的选育群体在选育过程中遗传多样性出现下降趋势,遗传分化不断加剧,F6与F2、F4遗传分化中等,但仍保持着较高遗传多样性,具有进一步选育潜力;4个尼罗罗非鱼地理群体中GY群体的遗传多样性最高,与选育群体F6的遗传距离适中(D_(a)<0.54),可作为潜在的引种群体与罗非鱼“粤闽1号”母本的选育群体进行杂交,从而提高其遗传多样性。

摘要： 通过多元统计分析和线粒体DNA测序技术,对中华鳖地方特色品种——太湖花鳖雌雄群体的形态和遗传差异进行了分析研究.结果显示,在形态上,对太湖花鳖雌雄群体各项形态参数进行t检验差异分析,发现雄性尾部的生长与其体质量的增加相关显著,呈线性关系;对太湖花鳖雌雄群体形态参数进行主成分分析,并作出主成分1和主成分2的散点图,得出雌雄群体形态差异不明显.对太湖花鳖雌雄群体线粒体D-loop控制区序列进行差异分析,雌雄群体间遗传差异为0.011 4;构建N-J聚类系统树,雌雄群体无单独聚类,群体遗传差异不明显.结果表明,太湖花鳖个体形态差异与其性别存在一定程度的相关性,特别是尾部特征,可用于雌雄性别的初步判断,但雌雄群体在外观形态和线粒体DNA上均没有明显差异.

摘要： 池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)和三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)的亲缘关系一直存在争议,为了更深入地对淡水珠蚌进行系统发育分析,研究对池蝶蚌及其3个近缘物种三角帆蚌、褶纹冠蚌(Cristaria plicata)和背角无齿蚌(Anodonta woodiana)的转录组进行了比较分析.对它们共有单拷贝同源基因进行多序列联配后计算这4种淡水珠蚌之间的遗传距离,结果表明池蝶蚌和三角帆蚌的遗传距离只有0.00746(小于1％),而其他淡水珠蚌之间的遗传距离几乎是它的10倍(平均大于6％).系统发育分析表明,小方蚌亚科与无齿蚌亚科大约在5144万年前发生分歧,而池蝶蚌和三角帆蚌发生分化的时间大约在424万年前.进一步的遗传差异分析鉴定了池蝶蚌转录组中的特有基因,其中KEGG通路富集的结果表明这些基因主要富集在免疫细胞膜分子和蛋白消化吸收等通路上.同时,GO注释结果表明有很多特有基因与池蝶蚌的优良性状相关,如与发育相关的生长发育、系统发育和动物器官发育等生物学过程,及与免疫相关的免疫系统过程、抗原处理和呈递等生物学过程.以上结果表明,池蝶蚌和三角帆蚌具有更近的亲缘关系,它们可能是同一物种的不同亚种或不同种群,这对淡水珠蚌种质资源的保护和遗传育种具有重要参考意义.此外,相比于三角帆蚌,池蝶蚌可能具有一些与生长发育及免疫相关的特有基因,这为探究相关的分子机制提供了线索.

摘要： 为研究日本囊对虾新品种的选育新技术,试验设置50、100、1 000、1 500 cGy 60Co-γ射线四种照射剂量,对即将产卵的日本囊对虾进行照射;在照射强度为3.4 cGy/sec的条件下,采用AFLP分子标记技术从分子水平对各组诱变子代的遗传相似系数、遗传距离以及遗传多样性影响等差异进行分析;统计了 日本囊对虾诱变子代在室外池塘中生长的体质量数据;单因素方差分析检测其差异显著性.实验结果表明,日本囊对虾诱变子代遗传相似系数在0.873 7～0.894 7之间;从群体水平来看,日本囊对虾诱变子代与对照组相比(P＞0.05),并没有显著的遗传变异出现;在诱变的实验组中发现有单个个体的基因型与其他个体的基因型相比,具有较为明显的差异,而在对照组中并没有发现类似个体的存在;池塘中各实验组和对照组的生长情况具有较为显著的差异.本研究结果可为日本囊对虾的诱变育种工作提供基础数据和科学依据.

摘要： 为研究日本囊对虾新品种的选育新技术,试验设置50、100、1000、1500 cGy ^(60)Co-γ射线四种照射剂量,对即将产卵的日本囊对虾进行照射;在照射强度为3.4 cGy/sec的条件下,采用AFLP分子标记技术从分子水平对各组诱变子代的遗传相似系数、遗传距离以及遗传多样性影响等差异进行分析;统计了日本囊对虾诱变子代在室外池塘中生长的体质量数据;单因素方差分析检测其差异显著性。实验结果表明,日本囊对虾诱变子代遗传相似系数在0.8737~0.8947之间;从群体水平来看,日本囊对虾诱变子代与对照组相比(P>0.05),并没有显著的遗传变异出现;在诱变的实验组中发现有单个个体的基因型与其他个体的基因型相比,具有较为明显的差异,而在对照组中并没有发现类似个体的存在;池塘中各实验组和对照组的生长情况具有较为显著的差异。本研究结果可为日本囊对虾的诱变育种工作提供基础数据和科学依据。

摘要： 分析不同倍性西瓜材料的生理指标与遗传差异,为进一步探究西瓜同源多倍化的机制及西瓜的倍性育种提供理论基础.取不同西瓜品种二倍体,同源三倍体和同源四倍体功能叶,进行生理指标测定,采用AFLP技术分析基因组差异,cDNA-AFLP方法分析基因差异表达情况.结果表明:三倍体和四倍体的抗逆性生理指标均优于二倍体,单位鲜重叶片总叶绿素含量二倍体大于多倍体.基因组DNA水平上不同染色体倍性西瓜之间多态性较低.不同倍性西瓜在RNA水平上有广泛的遗传表达多样性.多倍化后西瓜的抗逆性生理指标得到增强,而单位鲜重叶片叶绿素含量降低;各倍性材料基因组DNA序列变异较小,基因表达水平发生明显变化.

摘要： 毛木耳栽培品种颜色主要为紫黑色、紫红色和褐色三大类;在栽培的紫黑色毛木耳品种AHP22中发现白色和浅褐色突变体,对其产量、耳片形态特征和ISSR分子标记分析,结果表明白色突变体和浅褐色突变体在产量上高于野生型,白色突变体APW 11较野生型AHP22的产量高12.4％,浅褐色突变体APfc2较野生型APfcl的产量高5.3％,耳片除颜色不同于野生型外,其它形态特征与野生型相似;ISSR标记分析表明白色突变体与野生型之间遗传相似系数为0.636,浅褐色突变体与野生型之间遗传相似系数为0.788,突变体与野生型之间遗传差异较大.

摘要： 以课题组选育的10个茶树品种及福建5个参照品种为材料,利用SSR分子标记进行遗传差异分析并建立分子指纹图谱,旨在进一步明确这些品种相互之间的遗传差异,为开展茶树良种鉴定及知识产权保护提供参考.实验结果表明,筛选出的6对核心引物具有较高的多态性;不同核心引物之间的Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)的差异随参试材料数目的增加而减小;10个自育品种遗传多样性水平与全部15个参试材料相当,高于5个参照品种,但剔除早春毫、朝阳后,剩余8个品种遗传多样性水平低于5个参照品种;参试材料遗传相似系数变化范围为0.35～0.91,平均0.65,其中,朝阳与大红袍之间的遗传相似系数最小(0.35),紫牡丹与铁观音之间的遗传相似系数最大(0.91);选用W08、D7、L11引物组合建立了参试材料的分子指纹图谱,特征条带大小在210～630bp之间,可将参试材料逐一鉴别.

摘要： 本文以出菇期易感病的秀珍菇菌株与正常菌株作为供试菌株,通过菌株间拮抗实验表明,易感病菌株与正常菌株间具有弱拮抗反应.进一步实验发现各菌株间ITS片段大小相同,采用RAPD、ISSR、SRAP等标记分析发现各菌株间遗传差异不明显.比较了不同菌株的最适温度和pH的菌丝生长速度,易感病菌株菌丝生长速度较正常菌株偏慢.出菇验证实验结果也反应出易感病菌株菌丝吃料速度较慢,产量也较低.

摘要： 采用AFLP分子标记技术对翘嘴红鲌(♀)、黑尾近红鲌(♂)及杂种F1三个群体各12个个体进行遗传差异分析.结果表明:9对引物共扩增出257条带,多态性比例为51.36％;三个群体间特异条带共24条,其中黑尾近红鲌群体和杂种F1群体共有特异带15条、翘嘴红鲌群体和杂种F1群体共有特异带2条、翘嘴红鲌群体特异带7条;黑尾近红鲌群体、翘嘴红鲌群体及杂种F1群体的Shannon's信息指数分别为0.2326、0.0794和0.1774,Nei's基因多样性指数分别为0.1602、0.0537和0.1229,期望杂合度分别为0.1582、0.0464和0.1062;杂种F1群体和黑尾近红鲌群体及翘嘴红鲌群体遗传距离分别为0.0523、0.2165,遗传相似系数分别为0.9490、0.8053,遗传数据表明杂种F1更接近于父本黑尾近红鲌.

摘要： 目的：2011年8月在辽宁省海城地区发生了炭疽疫情的暴发流行，对采集的动物样品进行炭疽芽孢杆菌分离鉴定和溯源研究。方法：对采集的牛肉标本分离培养炭疽芽胞杆菌，进行噬菌体裂解、青霉素敏感试验及PCR试验鉴定，并结合近年东北地区炭疽流行株进行遗传进化分析。结果：从牛肉中分离出炭疽芽孢杆菌，噬菌体和青霉素敏感试验为阳性，PCR试验结果表明该菌株携带荚膜基因、保护性抗原基因和S层蛋白基因。2011年海城疫情与乌兰浩特疫情分离株16S rDNA序列有1个碱基不同，海城株与公主岭株亦有单碱基的差异，而2011年乌兰浩特株与2009年松原株序列100%同源。结论：海城疫情牛肉样品中分离到炭疽芽孢杆菌强毒株，遗传学分析溯源上与近年周边地区流行株有所差异。

摘要： 长角血蜱是我国常见的一种硬蜱,在自然界存在孤雌生殖和两性生殖的种群.本研究通过对分离的长角血蜱孤雌生殖上海株、孤雌生殖安徽株和孤雌生殖山东株的线粒体细胞氧化酶Ⅰ(COI)基因部分序列进行测定,与国内其他单位所测定的两性或孤雌生殖的多株长角血蜱COI基因序列进行比对.结果发现,长角血蜱孤雌生殖种群与两性生殖种群的COI基因序列存在特征性差异;COI基因序列测定可应用于长角血蜱的孤雌生殖种群和两性生殖种群的快速鉴定.

摘要： 长角血蜱是我国常见的一种硬蜱,在自然界存在孤雌生殖和两性生殖的种群.本研究通过对分离的长角血蜱孤雌生殖上海株、孤雌生殖安徽株和孤雌生殖山东株的线粒体细胞氧化酶Ⅰ(COI)基因部分序列进行测定,与国内其他单位所测定的两性或孤雌生殖的多株长角血蜱COI基因序列进行比对.结果发现,长角血蜱孤雌生殖种群与两性生殖种群的COI基因序列存在特征性差异;COI基因序列测定可应用于长角血蜱的孤雌生殖种群和两性生殖种群的快速鉴定.

摘要： 长角血蜱是我国常见的一种硬蜱,在自然界存在孤雌生殖和两性生殖的种群.本研究通过对分离的长角血蜱孤雌生殖上海株、孤雌生殖安徽株和孤雌生殖山东株的线粒体细胞氧化酶Ⅰ(COI)基因部分序列进行测定,与国内其他单位所测定的两性或孤雌生殖的多株长角血蜱COI基因序列进行比对.结果发现,长角血蜱孤雌生殖种群与两性生殖种群的COI基因序列存在特征性差异;COI基因序列测定可应用于长角血蜱的孤雌生殖种群和两性生殖种群的快速鉴定.

摘要： 长角血蜱是我国常见的一种硬蜱,在自然界存在孤雌生殖和两性生殖的种群.本研究通过对分离的长角血蜱孤雌生殖上海株、孤雌生殖安徽株和孤雌生殖山东株的线粒体细胞氧化酶Ⅰ(COI)基因部分序列进行测定,与国内其他单位所测定的两性或孤雌生殖的多株长角血蜱COI基因序列进行比对.结果发现,长角血蜱孤雌生殖种群与两性生殖种群的COI基因序列存在特征性差异;COI基因序列测定可应用于长角血蜱的孤雌生殖种群和两性生殖种群的快速鉴定.

摘要： 本发明公开一种在外周血游离DNA中检测P53基因表观遗传学修饰差异的引物对组及试剂盒。本发明首先公开了在外周血游离DNA中检测P53基因表观遗传学修饰差异的引物对组由序列表SEQ ID No.1至SEQ ID No.10所示的核苷酸序列组成。本发明进一步公开了包含上述引物对组的试剂盒。本发明在外周血游离DNA中检测P53基因表观遗传学修饰差异的引物对组及试剂盒，该检测具有高敏感性和特异性，对肿瘤风险预测以及疗效评估具有重要的价值。

摘要： 本发明公开一种基于表观遗传学修饰差异的靶基因的检测方法，包括：抽提不同组别样本的外周血游离DNA；针对不同待测靶基因和/或同一靶基因的不同待测区域片段分别设计引物对组；利用引物对组分别对不同组别样本外周血游离DNA在高温变性条件下和低温变性条件下进行实时荧光定量PCR扩增，得到待测靶基因xn和/或同一靶基因待测区域片段xn的△Ctxn；进一步利用回归分析对△Ctxn进行加权计算并得到阈值，据此鉴别或溯源表观遗传学修饰差异的靶基因所在的组别或不同的来源。本发明通过对不同靶基因/或同一靶基因不同区域表观遗传学修饰差异的分析，为鉴别或溯源靶基因的不同来源提供了新的更加便捷的方法。

摘要： 基于网格与差异替换改进多目标遗传算法的电影推荐方法，针对NSGA‑II中存在的分布性和收敛性两方面的不足而提出了改进算法GDNSGA‑II，可以用于求解多目标组合优化问题。该算法设计多目标网格划分方式初始化种群，避免了个体不均匀而导致分布性缺失；并运用聚类选择与差异替换算子维护种群进化过程，选择适当数目的劣质个体局部搜索，保持了种群的收敛性和分布性。结合用户行为与电影属性的挖掘，将该算法应用于电影个性化推荐这一实际问题，通过和现有的算法进行测试对比说明了算法的通用性和有效性，得到了更为优良的推荐结果，提高了推荐的F调和率、多样性和新颖性，并提供了更为丰富的推荐方案组合，有利于充分挖掘用户的兴趣提供更为可靠的推荐服务。

摘要： 本发明属于种植作物基因工程技术领域，具体涉及一种基于不同基因型玉米种氮效率差异遗传特性的评价方法，并进一步公开其在玉米作物种植领域的应用。本发明所述基于不同基因型玉米种氮效率差异遗传特性的评价方法，通过研究不同基因型玉米杂交种及其亲本自交系氮素吸收、转运与分配能力的差异，进而分析不同基因型品种氮效率相关基因的表达水平，从分子机制和溯源角度探析其氮效率差异的遗传特性及生理机制，为不同基因型玉米品种的高质量种植提供理论指导。

摘要： 本发明公开了一种基于差异进化遗传算法的WSN节点定位方法。本发明步骤：步骤1、建立节点定位优化模型并设计定位优化目标函数；步骤2、初始化种群；步骤3、种群经过初始化赋值后，利用差分变异操作产生变异矢量；步骤4、在进行变异操作之后，需要将目标向量与变异向量进行二项式交叉生成最终的试验向量；步骤5、试验向量与对应的目标向量之间执行一对一的锦标赛选择；步骤6、利用成功概率更新个体；步骤7、重复步骤3‑步骤6，当达到最大迭代次数，输出最佳的位置值。本发明基本GA算法的基础上，提出了差异进化机制，以此兼顾算法的迭代次数和定位误差；能够兼顾网络实时性和高精度定位性能，具有有效性和实用性。

摘要： 本发明公开的一种针对群体重要功能突变比较遗传变异差异的方法，利用预测软件或实际功能验证试验对突变功能的评估获得功能突变的集合后给予这些功能突变更高的权重值，利用二代测序技术或基因分型技术如SNP芯片获取某群体中各个个体的基因型信息后计算群体某多态性位点的基因频率，利用本方法所述的计算公式可批量计算以基因为单位的遗传多态性在种族之间的差异程度。所述方法将遗传单元从单个多态性位点上升到单个基因，从而可以比较某基因的全部功能突变在不同群体间的差异程度，以预测某些基因相关表型在不同群体间的差异及指导基因相关遗传研究在不同群体间的开展。

摘要： 本发明涉及一种选择性扩增受试者样品中至少一种微生物和/或病毒的至少一种核酸序列的方法，其中应用k‑聚体(3)，与受试者的基因组(1)相比，该k‑聚体(3)在该至少一种微生物和/或病毒的基因组(2)中显示出频率和/或背景的差异。

摘要： 本发明公开了一种基于遗传算法的高海拔地区换流变压器差异化运维方法，其特征在于：具体按照以下步骤实施：S1：进行种群初始化，选择一个个体的集合b

摘要： 本发明公开了一组用于检测黍子抗旱性遗传差异的五碱基重复基序分子标记，是具有序列表SEQ ID No.1～SEQ ID No.5所示碱基序列的一组微卫星标记。本发明提供的一组五碱基重复基序分子标记可以应用于检测抗旱性黍子的遗传差异，进行抗旱性黍子种质资源遗传多样性评估、黍子作物进化研究和分子标记辅助育种，重复性好，是一种可靠有效的分子标记。

摘要： 本发明公开了一组用于检测黍子耐盐性遗传差异的五碱基重复基序分子标记，是具有序列表SEQ ID No.1～SEQ ID No.5所示碱基序列的一组微卫星标记。本发明提供的一组五碱基重复基序分子标记可以应用于检测耐盐性黍子的遗传差异，进行耐盐性黍子种质资源遗传多样性评估、黍子作物进化研究和分子标记辅助育种，重复性好，是一种可靠有效的分子标记。