野生群体

摘要： 【目的】探究山东省野生豆梨种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其种质资源收集、保存以及育种材料的选择提供理论依据。【方法】采用AFLP分子标记技术对山东省分布的6个群体61个野生豆梨单株的遗传多样性进行了分析。【结果】8对引物组合共扩增出清晰条带1344条,平均每对引物组合扩增出168条带,其中多态性条带有1340条,多态位点百分率为99.75%。扩增条带中包含特异性条带179条,通过这些特异性条带可对88.52%的野生豆梨单株进行鉴别。6个野生豆梨群体的多态位点百分率(PPB)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)及Shannon’s信息指数(I)的变化范围分别为24.07%~55.09%、1.2407~1.5509、1.1541~1.2378、0.0905~0.1455及0.1346~0.2271。AMOVA分析显示,12.53%的变异来自群体间,87.47%的变异来自种群内。UPMGA聚类分析得出,61个单株的遗传相似性系数介于0.7378~0.8843之间,平均值为0.8068。在遗传相似系数0.806处可划分为5组,其中部分来源于同一地区的单株并没有完全聚为一组,而在遗传相似性系数0.824处分割时,还可将第Ⅴ组分为8个亚组,且亚组中来源于同一地区的资源倾向于聚为一类,主效应分析结果和UPGMA结果基本一致。【结论】山东省野生豆梨群体间存在一定的基因交流,各群体内遗传分化程度大于群体间,且群体间的地理来源和遗传变异程度并没有严格的相关性。

摘要： 2013年开始,研究团队以长江、淮河、珠江等青虾野生群体为基础群体,以生长速度为目标性状,经连续5代的群体选育,培育了综合性状优于青虾“太湖2号”的新品种青虾“太湖3号”(GS-01-008-2022)。在相同养殖条件下,青虾“太湖3号”与未经选育的长江青虾相比,150日龄虾体重提高28.7%;与青虾“太湖2号”相比,150日龄虾体重提高5.0%,其中雌虾体重提高33.3%。

摘要： 青岛前沿海洋种业有限公司、联合中国科学院海洋研究所等单位,通过细胞工程育种技术、群体选育技术和杂交育种技术,对国内牡蛎种质进行遗传改良,获得生长快速、品质优良的三倍体长牡蛎“前沿1号”(GS-02-009-2022)。三倍体倍化率100%2011年,从青岛鳌山湾海域收集2150粒长牡蛎野生群体作为基础群体,利用SNP标记进行群体分型鉴定,发现该群体的杂合度处于较高水平,具有选育的潜力。

摘要： 为了研究湛江海域日本乌贼野生群体的形态性状对体质量的影响,随机选取捕捞的野生日本乌贼106尾,分别准确测量体长(X1)、胴长(X2)、体宽(X3)、体高(X4)、眼间距(X5)、触腕长(X6)、第一对腕长(X7)、第二对腕长(X8)、第三对腕长(X9)、第四对腕长(X10)与体质量(Y)等11个性状,采用多元回归分析、相关分析及通径分析方法,计算所有性状间的相关系数,获得相关性状的通径系数、决定系数及相关指数,剖分出形态性状对体质量的直接作用与间接作用.结果 表明,10个形态性状与体质量的相关系数极具差异统计学意义(P＜0.01);分析得到胴长(X2)、体高(X4)、第一对腕长(X7)为对体质量影响最大的3个性状,其通径系数达极具差异统计学意义(P＜0.01),分别为0.580、0.310、0.180;胴长(X2)对体质量的直接作用最大,体高(X4)对体质量的间接作用最大;体高(X4)、第一对腕长(X7)对体质量的间接作用大于直接作用,均主要通过胴长(X2)来间接影响体质量;胴长(X2)的单一决定系数最大,其次是胴长(X2)与体高(X4)共同决定系数,3个性状对体质量的决定系数总和达到0.970,表明它们是影响体质量的主要形态性状;应用逐步回归法建立以Y为应变量,胴长(X2)、体高(X4)、第一对腕长(X7)为自变量的多元线性回归方程:Y=-82.025+ 11.232X2+ 14.582X4+ 12.628X7,决定指数R2为0.970,拟合效果较理想.该研究为后期开展日本乌贼选育测量指标的确定提供参考依据.

摘要： 黄姑鱼(Nibea albiflora)是我国重要的经济鱼类.由于受到过度捕捞和环境污染等因素的影响,野生黄姑鱼资源量急剧下降.为了解黄姑鱼野生群体与养殖群体的种质资源现状,本研究扩增了2个野生群体和2个养殖群体的线粒体DNA控制区高变区部分序列,同时结合NCBI数据库中部分已发表序列进行分析.研究显示:173个黄姑鱼个体共检测到62个单倍型,其中养殖群体仅7个;养殖群体和野生群体之间仅存在1个共享单倍型;养殖群体单倍型多样度(0.4160～0.7123)明显低于野生群体(0.9130～0.9926).基于线粒体DNA控制区单倍型构建的网络图未发现明显的谱系结构.群体间遗传分化指数FST显示,黄姑鱼养殖群体间以及养殖群体与野生群体间产生了较大的遗传分化.AMOVA分析结果显示,群体内部遗传变异占绝大部分.黄姑鱼野生群体的历史动态分析结果暗示,其可能经历过近期群体扩张事件.综合上述结果,黄姑鱼养殖群体遗传多样性显著降低,有必要开展黄姑鱼遗传多样性监测工作,并采用科学的人工繁育方法,保护黄姑鱼的优质种质资源.

摘要： 为了较全面了解长江中上游草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的种质情况,本研究基于线粒体Cyt b基因序列特征,比较分析了长江中上游大范围内草鱼3个野生群体和19个养殖群体的遗传多样性水平.结果显示:677个样本共检测到35个单倍型,17个简约信息位点和42个多态位点;野生群体遗传多样性最高(Hd:0.769;Pi:0.00143),原种场群体次之(Hd:0.766;Pi:0.00113),苗种场群体最低(Hd:0.649;Pi:0.00084).野生群体中,万州群体遗传多样性最高(Hd:0.857;Pi:0.00205),中性检验结果表明万州群体曾经历过种群扩张事件;遗传结构分析表明草鱼野生群体间不存在遗传分化,群体间基因交流广泛;对比历史数据,草鱼野生群体多样性水平近10年来未出现下降.苗种场群体中,遗传多样性最高(Hd:0.791;Pi:0.00147)和最低(Hd:0.247;Pi:0.00024)的分别是阳新和蔡甸1群体,部分养殖群体遗传多样性下降;遗传结构分析表明养殖群体间存在大范围的显著遗传分化,群体间缺乏交流.综上,草鱼养殖群体遗传多样性下降明显,在进行草鱼苗种繁育时要注意近交等带来的不利影响.

摘要： 中华鳖是我国重要的名特优水产养殖品种之一,具有较高的食用及药用价值,是深受消费者认可的滋补佳品。为培育适合于我国南方地区养殖推广的中华鳖洞庭品系快速生长新品种,提高我国中华鳖养殖产业的良种覆盖率,增加中华鳖养殖的生产效益,中国水产科学研究院珠江水产研究所、广东绿卡实业有限公司依托国家级广东绿卡中华鱉良种场为育种平台,以中华鱉洞庭湖水系野生群体作为选育基础群,通过连续5代群体选育,获得了快速生长新品种中华鳖“珠水1号”(登记号:GS-01-011-2020)。

摘要： 糖原是牡蛎肉质品质首要决定因素。糖原含量不仅与牡蛎肥满度密切相关,还与牡蛎的能量代谢和抗逆性密切相关。为培育高糖原含量的长牡蛎新品种,满足日益差异化、个性化的高端牡蛎市场需求,中国科学院海洋研究所育种团队从河北乐亭长牡蛎野生群体中采集的约1000只个体为长牡蛎“海蛎1号”的基础群体,以糖原含量为目标性状,采用家系选育和基因模块辅助选育技术,具体通过基因模块内主导标记的鉴定,实现了基于少数分子标记的基因模块辅助育种,经连续4代选育成长牡顿“海顿1号”(品种登记号:CS-01-007-2020)。

摘要： 翘嘴鲌是我国重要的淡水名优经济鱼类之一,生长快,肉质鲜嫩,经济价值高,深受消费者喜爱,因此,进行翘嘴鲌的新品种选育具有重要的社会效益和经济效益。湖州是最早突破翘嘴鲌繁殖技术的地区,在翘嘴鲌的苗种供应市场上占有重要地位。浙江省淡水水产研究所于2004年冬季,从太湖湖州段捕捞野生群体进行强化培育,并以此为基础群体开展了翘嘴鲌的选育工作。

摘要： 为评价不同地理日本沼虾野生群体的遗传多样性和遗传分化水平,利用11对微卫星引物对洞庭湖、鄱阳湖、龙感湖的日本沼虾野生群体进行遗传多样性的分析.在三个日本沼虾群体中共获得90个等位基因,各位点平均等位基因为8.182个,各群体的平均等位基因数在(A)32～38之间,平均多态信息含量(PIC)介于0.5907～0.6430,平均期望杂合度(He)0.6577～0.7055、平均观测杂合度(Ho)0.5141～0.5799.群体间各位点Shannon指数均大于1,Fis均为正值,群体间平均近交系数为19％,Fst值显示整个群体分化程度较低,其中遗传变异的5.38％存在于群体之间,94.62％存在于个体之间.结果表明:三个日本沼虾野生群体的遗传多样性较高,分化程度较低,其中鄱阳湖群体遗传多样性最丰富,遗传分化水平最低.

摘要： 本研究利用RAPD-SCAR及ISSR技术，对我国富春江、黄河、滦河和鸭绿江等4个松江鲈鱼野生群体共120尾个体进行分析并寻找特异性的群体分子标记。结果发现：(1)两种方法的分析结果都表明，松江鲈鱼野生群体的遗传多样性较丰富；(2)虽然各群体间存在程度不同的基因交流，但分子方差分析(AMOVA)却显示这些群体间存在显著(p＜0.05)或极显著(p＜0.01)的遗传分化。(3)成功获得两个RAPD-SCAR标记，可作为鉴别松江鲈鱼滦河群体与其它3群体的分子标记。(4)发现滦河群体具有自身的遗传结构特点，推测渤海湾海区内可能存在独立产卵场，值得深入调查。(5)建议对松江鲈鱼野生群体进行不同原产地的保护，以利于该濒危物种的生存繁衍及合理的开发利用。

摘要： 采用17个微卫星标记对团头鲂的2个野生群体(分别来自梁子湖和淤泥湖),3个人工选育良种群体(“浦江1号”选育系F7、F8、F9),以及1个选育奠基群体(F0)进行了群体遗传多样性与遗传分化研究.结果表明,①6个群体的平均等位基因数(A)为5.71～7.65,平均有效等位基因数(Ne)为3.79～5.33,平均观测杂合度(Ho)为0.8170～0.8603,平均期望杂合度(He)为0.7126～0.7805;平均多态信息含量(PIC)为0.6188～0.7226;群体间遗传分化指数(FST)范围为0.0312～0.1229;群体间Nei标准遗传距离(Dn)为0.0928～0.3694.②在He方面,从高到低依次为,梁子湖野生群体、淤泥湖野生群体、选育奠基群体、选育系F7、选育系F8和选育系F9,2个野生群体间差异不显著(p=0.072),3个选育群体问差异也不显著(p>0.05);3个选育群体显著(p0.05).③在FST值方面,2个野生群体间FST值差异不显著(P>0.05),3个选育群体间FST值差异也不显著(P>0.05),但它们与野生群体及奠基群体间的FST值筹异显著(P0.05).④基于Dn值构建的6个群体NJ和LJPGMA聚类图基本一致,6群体分为明显的两大组,野生群体(LZ和YN)和奠基群体聚为一组,不同选育后期世代群体(F7,F8和F9)聚为另一组.⑤研究结果揭示,经历20多年的9代系统选育后,相对于野生群体,团头鲂”浦江1号”良种已产生了明显的遗传分化,性状已相当稳定,但离选育极限尚有一定距离,今后应在继续监测其遗传结构变化的基础上,进一步挖掘选育满力,同时要避免种质混杂、近交衰退及瓶颈效应等的发生.

摘要： 利用微卫星分子标记技术对日本囊对虾霞浦野生群体(XP,34尾)和选育群体(G2,34尾)的遗传多样性进行分析.野生群体采自福建霞浦三沙海域,选育群体取自福建省东山县茂鑫水产有限公司养殖的G2日本囊对虾.5个微卫星位点在两个群体中共检测到88个等位基因,多态信息含量介于0.6542-0.9076之间,均为高度多态位点.野生群体与养殖选育群体平均等位基因数为16和8.4,平均有效等位基因数为15.4133和5.7086,平均杂合度为0.7353和0.5529,平均多态信息含量为0.8479和0.7230,群体间遗传分化指数Fst为0.0404.结果表明,日本囊对虾野生群体和养殖选育群体的遗传多样性都较为丰富,尚未发现明显的遗传分化现象.

摘要： 七带石斑鱼(Epinephelus septemfasciatus)，属鲈形目，鲐科，石斑鱼属，主要分布在日本、韩国、中国的黄海、东海沿岸，为石斑鱼在黄海唯一分布的品种，因其能够耐受7°C～8°C的低温冷水，又称为“冷水石斑”。本文以主成分分析和判别分析2种多元分析方法为主，结合t-检验方法，比较和分析韩国群体和日本群体的形态特征差异，以期为七带石斑鱼地理种群的识别、亲缘关系的比较、种质资源的保护提供理论依据，进而为将来利用种群间杂交繁育出七带石斑鱼的优质苗种打下基础。

摘要： ISSR是一种新型的分子标记,本文利用ISSR分子标记技术对我国东北西部野生桑树天然群体遗传多样性进行了研究,对向海1号桑遗传特性进行深入了解,同时,也对今后野生桑遗传资源的保护、重要农艺性状基因的发掘与利用和桑树遗传育种,特别是高抗寒、抗旱桑树新品种的选育都具有重要的理论价值和实践意义.

摘要： 选用6对微卫星标记对螭霖鱼养殖群体、野生群体和麦穗鱼3个群体进行了遗传多样性的研究.在5个位点螭霖鱼养殖群体和野生群体的遗传结构无差异,群体杂合度He皆为零,仅在1个位点野生群体有1等位基因,而养殖群体没有.麦穗鱼在2个位点有很好的多态性.

摘要： 用6个微卫星SSLP标记,研究分配年了野鲤、高寒鲤、荷包红鲤抗寒品系三个群体的遗传变异.从微卫星SSLP标记多态性的结果说明,原种野生鲤的杂合度高于高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系这两个养殖品系,也进一步说明原种野生鲤具有很大的育种潜力.

摘要： 用6个微卫星SSLP标记,研究分配年了野鲤、高寒鲤、荷包红鲤抗寒品系三个群体的遗传变异.从微卫星SSLP标记多态性的结果说明,原种野生鲤的杂合度高于高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系这两个养殖品系,也进一步说明原种野生鲤具有很大的育种潜力.

摘要： 用6个微卫星SSLP标记,研究分配年了野鲤、高寒鲤、荷包红鲤抗寒品系三个群体的遗传变异.从微卫星SSLP标记多态性的结果说明,原种野生鲤的杂合度高于高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系这两个养殖品系,也进一步说明原种野生鲤具有很大的育种潜力.

摘要： 本发明提供一种利用cpDNA序列YCF1–RPS15分析野生丹参群体遗传结构的方法，具体步骤如下：（1）选取不同的野生丹参种群，对每株野生丹参幼嫩茎叶进行基因组总DNA的提取；采用引物YCF1–RPS15对野生丹参种群个体进行PCR扩增，获得YCF1–RPS15序列的扩增产物；引物序列为：YCF1：5´CTTGTATGRATCGTTATTGKTTTG 3´；RPS15：5´CAATTYCAAATGTGAAGTAAGTCTCC 3´；根据序列比对和生物信息学分析，获得野生丹参不同地理种群的遗传多样性水平和群体遗传结构。本发明提供的方法能分析野生丹参种群的遗传变异，了解河南省野生丹参群体的遗传多样性和遗传结构情况，结果可为野生丹参资源的合理利用和保护提供科学依据。

摘要： 本发明提供一种利用cpDNA序列YCF1–RPS15分析野生丹参群体遗传结构的方法，具体步骤如下：（1）选取不同的野生丹参种群，对每株野生丹参幼嫩茎叶进行基因组总DNA的提取；采用引物YCF1–RPS15对野生丹参种群个体进行PCR扩增，获得YCF1–RPS15序列的扩增产物；引物序列为：YCF1：5´CTTGTATGRATCGTTATTGKTTTG 3´；RPS15：5´CAATTYCAAATGTGAAGTAAGTCTCC 3´；根据序列比对和生物信息学分析，获得野生丹参不同地理种群的遗传多样性水平和群体遗传结构。本发明提供的方法能分析野生丹参种群的遗传变异，了解河南省野生丹参群体的遗传多样性和遗传结构情况，结果可为野生丹参资源的合理利用和保护提供科学依据。

摘要： 本发明提供了一种野生斑鳜遗传多样性和群体遗传结构的检测方法，包括以下步骤：a)、分别提取不同群体野生斑鳜的DNA；b)分别对步骤a)获得的各野生斑鳜DNA进行第一PCR扩增和第二PCR扩增，获得各野生斑鳜DNA的第一扩增产物和第二扩增产物；c)分别对各野生斑鳜DNA的第一扩增产物和第二扩增产物进行双向测序，将第一扩增产物的Cyt b基因序列和第二扩增产物的D‑loop基因序列拼接组合，获得各野生斑鳜目的序列；d)对所述不同群体各野生斑鳜目的序列进行遗传多样性和群体遗传结构分析。本发明采用双基因序列拼接的组合分析，弥补了单基因序列信息量不足的缺点，更客观真实反映了物种遗传多样性的状况。

摘要： 本发明内容涉及在丰富的序列变体中扩增和检测DNA序列的稀有变体，例如在过量的正常核酸靶序列中检测低水平体细胞突变和少数等位基因。

摘要： 本发明公开一种大麻哈鱼人工放流群体与自然野生群体的鉴别方法，包括以下步骤：样本前处理、电子微探针分析、数据分析和群体辨别；本发明采集大麻哈鱼回归群体样本，挑取矢耳石开展耳石微化学分析，采用电子微探针技术对矢耳石进行定量线分析，计算大麻哈鱼耳石的Rf1、RL以及RC值，以此为主要判断依据，经验证，按照此方法对大麻哈鱼回归群体检验，判别成功率达100％，且本发明基于目前大麻哈鱼放流苗种培育过程与自然群体大麻哈鱼野外孵化条件的不同，不需对大麻哈鱼放流苗种进行额外的标记，即可对人工增殖群体与自然群体进行有效鉴别，能克服大麻哈鱼标记工作的条件的限制以及避免标记工作对大麻哈鱼鱼体的伤害。

摘要： 基于形态参数的中华绒螯蟹亲蟹野生与养殖群体鉴别方法，采用头胸甲背面和步足处测量，其特征是雌蟹形态测量参数为L2、L4、L6、F15、F44，雄蟹形态测量参数为L2、L15、F11、F33、F44；利用L2、L4、L6、F15、F44建立雌蟹的鉴别公式：D=66.613L2+31.203L4-43.969L6-159.018F15+34.628F44+2.278；利用L2、L15、F11、F33、F44建立雄蟹的鉴别公式：D=83.669L2-70.977L15-26.518F11+72.540F33+44.416F44+26.146；当D>0时，为野生群体；D<0时，为养殖群体。

摘要： 大黄鱼线粒体分子标记及用于养殖群体与野生种群的鉴别。鉴别大黄鱼养殖群体与野生种群的线粒体分子标记为4个碱基的差异。鉴别步骤为设计合成一对保守引物L14841：5’-CCATCCAACATCTCAGCATGATGAAA-3’；H15149：5’-GCCCCTCAGAATGATATTTGT CCTCA-3’；对养殖与野生种群的线粒体DNA中细胞色素B(cyt b)基因进行PCR扩增；扩增结果经纯化；测序，对比测序结果。由4个群体大黄鱼mtDNA Cytb基因324bp序列排序结果可以看出大黄鱼养殖群体与野生群体存在4个碱基的差异，表现为1个颠换，3个转换。其结果稳定，可重复性强。3个野生群体的扩增结果一致。4个碱基的差异可作为区分养殖与野生群体的分子标记。鉴别方法简单。

摘要： 本发明公开一种大麻哈鱼人工放流群体与自然野生群体的鉴别方法，包括以下步骤：样本前处理、电子微探针分析、数据分析和群体辨别；本发明采集大麻哈鱼回归群体样本，挑取矢耳石开展耳石微化学分析，采用电子微探针技术对矢耳石进行定量线分析，计算大麻哈鱼耳石的Rf1、RL以及RC值，以此为主要判断依据，经验证，按照此方法对大麻哈鱼回归群体检验，判别成功率达100％，且本发明基于目前大麻哈鱼放流苗种培育过程与自然群体大麻哈鱼野外孵化条件的不同，不需对大麻哈鱼放流苗种进行额外的标记，即可对人工增殖群体与自然群体进行有效鉴别，能克服大麻哈鱼标记工作的条件的限制以及避免标记工作对大麻哈鱼鱼体的伤害。

摘要： 基于形态参数的中华绒螯蟹亲蟹野生与养殖群体鉴别方法，采用头胸甲背面和步足处测量，其特征是雌蟹形态测量参数为L2、L4、L6、F15、F44，雄蟹形态测量参数为L2、L15、F11、F33、F44；利用L2、L4、L6、F15、F44建立雌蟹的鉴别公式：D=66.613L2+31.203L4-43.969L6-159.018F15+34.628F44+2.278；利用L2、L15、F11、F33、F44建立雄蟹的鉴别公式：D=83.669L2-70.977L15-26.518F11+72.540F33+44.416F44+26.146；当D>0时，为野生群体；D<0时，为养殖群体。

摘要： 大黄鱼线粒体分子标记及用于养殖群体与野生种群的鉴别。鉴别大黄鱼养殖群体与野生种群的线粒体分子标记为4个碱基的差异。鉴别步骤为设计合成一对保守引物L14841：5′－CCATCCAACATCTCAGCATGATGAAA－3′；H15149：5′－GCCCCTCAGAATGATATTTGT CCTCA－3′；对养殖与野生种群的线粒体DNA中细胞色素B(cyt b)基因进行PCR扩增；扩增结果经纯化；测序，对比测序结果。由4个群体大黄鱼mtDNA Cytb基因324bp序列排序结果可以看出大黄鱼养殖群体与野生群体存在4个碱基的差异，表现为1个颠换，3个转换。其结果稳定，可重复性强。3个野生群体的扩增结果一致。4个碱基的差异可作为区分养殖与野生群体的分子标记。鉴别方法简单。