亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析

孙润润; 王园园; 郭新磊; 秦腾飞; 张金宝; 金翠萍; 董涛; 王清连

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亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析

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cqvip:为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因(GaKNOX1-GaKNOX23)。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HOX 4个典型结构域。GaKNOX基因进化聚类形成两大分支:ClassⅠ和ClassⅡ。转录组数据分析显示,GaKNOX12在开花后20 d的纤维和胚珠中的表达量最高,说明它可能参与调控棉纤维次生壁形成过程。本研究在亚洲棉全基因组水平上鉴定KNOX基因家族并进行生物信息学分析,为进一步研究KNOX基因在棉花中的调控作用奠定基础。

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来源
《中国棉花》 |2019年第12期|15-22|共8页
作者
孙润润; 王园园; 郭新磊; 秦腾飞; 张金宝; 金翠萍; 董涛; 王清连;
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作者单位

河南科技学院现代生物育种河南省协同创新中心河南新乡453003;

中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
亚洲棉; KNOX基因; 进化分析; 基因结构; 组织表达;

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