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Current Protocols in Bioinformatics
>2018年第1期
Current Protocols in Bioinformatics
MEDLINE
中文名称:当前生物信息学技术
ISSN:
1934-3396
出版周期:
Quarterly
发文量:17
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1.
Installing, Maintaining, and Using a LocalCopy of BLAST for Compute Cluster orWorkstation Use
机译:
安装,维护和使用Blast的LocalCopy for Compute Cluster OrworkStation使用
作者:
Istvan Ladunga
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
biosequence analysis;
BLAST LINUX;
sequence similaritysearch;
2.
The GWIPS-viz Browser
机译:
Gwips-viz浏览器
作者:
Stephen J. Kiniry
;
Audrey M. Michel
;
Pavel V. Baranov
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
genome browser;
gene expression;
GWIPS-viz;
mRNA-seq;
protein synthesis;
ribosome profiling;
translation;
3.
Using LICHeE and BAMSE forReconstructing Cancer Phylogenetic Trees
机译:
使用Lichee和BAMSE Forconstricting癌症系统发育树
作者:
Camir Ricketts
;
Victoria Popic
;
Hosein Toosi
;
Iman Hajirasouliha
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
cancer phylogeny;
deep sequencing;
next-generation sequencing;
tumor heterogeneity;
somatic variations;
4.
The GWIPS-viz Browser
机译:
Gwips-viz浏览器
作者:
Stephen J. Kiniry
;
Audrey M. Michel
;
Pavel V. Baranov
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
genome browser;
gene expression;
GWIPS-viz;
mRNA-seq;
protein synthesis;
ribosome profiling;
translation;
5.
Analysis and Visualization of DynamicNetworks Using the DyNet App forCytoscape
机译:
使用Dynet App forcytoscape的DyneNetWorks的分析与可视化
作者:
John Salamon
;
Ivan H. Goenawan
;
David J. Lynn
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
Cytoscape 3;
dynamic network;
DyNet;
network analysis;
6.
Investigation of RNA-RNA InteractionsUsing the RISE Database
机译:
RNA-RNA对崛起数据库的关系调查
作者:
Yanyan Ju
;
Jing Gong
;
Yucheng T. Yang
;
Qiangfeng Cliff Zhang
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
interaction;
RISE;
RNA;
RNA-RNA;
RNA structure;
sequencingexperiments;
7.
Lsing LICHeE and BAMSE forReconstructing Cancer Phylogenetic Trees
机译:
失去荔枝和BAMSE重建癌症系统发育树
作者:
Camir Ricketts
;
Victoria Popic
;
Hosein Toosi
;
Iman Hajirasouliha
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
ancer phylogeny;
deep sequencing;
next-generation sequencing;
tumor heterogeneity;
somatic variations;
8.
Improved RNA-seq Workflows UsingCyVerse Cyberinfrastructure
机译:
使用环胞瘤Frastruction改进的RNA-SEQ工作流程
作者:
Kapeel M. Chougule
;
Liya Wang
;
Joshua C. Stein
;
Xiaofei Wang
;
Upendra Kumar Devisetty
;
Robert R. Klein
;
Doreen Ware
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
bioinformatics CyVerse;
differential gene expression;
discoveryenvironment;
pseudo-alignment based transcript quantification;
referenceguided gene expression RNA-seq;
transcript assembly;
tuxedo protocol;
9.
Using geneid to Identify Genes
机译:
使用基因鉴定基因
作者:
Tyler Alioto
;
Enrique Blanco
;
Gen′s Parra
;
Roderic Guigo
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
bioinformatics;
exons;
gene identification;
genes;
genome;
annotation splicing;
10.
Good Citizenship Made Easy: AStep-by-Step Guide to SubmittingRNA-Seq Data to NCBI
机译:
良好的公民身份简单:将ASTEPTEPTRNA-SEQ数据指南逐步指南到NCBI
作者:
Wiebke Feindt
;
Sara J. Oppenheim
;
Robert DeSalle
;
Shaadi Mehr
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
ioinformatics;
NCBI databases;
NGS-data submission;
RNAseq;
sequence read archive (SRA);
transcriptome shotgun assembly (TSA);
11.
SPIN: Submitting Sequences Determinedat Protein Level to UniProt
机译:
旋转:将序列确定为Uniprot的蛋白质水平
作者:
Klemens Pichler
;
Kate Warner
;
Michele Magrane
;
The UniProtConsortium
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
direct protein sequencing;
submission;
UniProt;
12.
SPIN: Submitting Sequences Determinedat Protein Level to UniProt
机译:
旋转:将序列确定为Uniprot的蛋白质水平
作者:
Klemens Pichler
;
Kate Warner
;
Michele Magrane
;
The UniProtConsortium
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
direct protein sequencing;
submission;
UniProt;
13.
Non-Coding RNA Analysis Using theRfam Database
机译:
非编码RNA分析使用Therfam数据库
作者:
Ioanna Kalvari
;
Eric P. Nawrocki
;
Joanna Argasinska
;
Natalia Quinones-Olvera
;
Robert D. Finn
;
Alex Bateman
;
and Anton I. Petrov
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
genome annotation;
non-coding RNA;
Rfam;
RNA family;
Infernal;
14.
Pre-Processing MALDI/TOF MassSpectra by Using Geena
机译:
使用Geena预处理MALDI / TOF MassSpectra
作者:
P. Romano
;
A. Profumo
;
A. Facchiano
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
mass spectrometry;
pre-processing;
spectra alignment;
MALDI/TOF;
15.
Non-Coding RNA Analysis Using theRfam Database
机译:
非编码RNA分析使用Therfam数据库
作者:
Ioanna Kalvari
;
Eric P. Nawrocki
;
Joanna Argasinska
;
Natalia Quinones-Olvera
;
Robert D. Finn
;
Alex Bateman
;
and Anton I. Petrov
期刊名称:
《Current Protocols in Bioinformatics》
|
2018年第1期
关键词:
genome annotation;
non-coding RNA;
Rfam;
RNA family;
Infernal;
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