数量性状

摘要： 羊草(Leymus chinensis)是禾本科赖草属多年生根茎型牧草,是我国北方草原优良牧草之一。较高的遗传多样性是羊草多重抗逆性的遗传基础。全球气候变化和生境破碎化导致草原加剧退化,严重威胁羊草遗传多样性。为评价羊草遗传多样性,本文以66份不同地理来源羊草为试验材料,在同质园栽培条件下,基于17个性状,计算Shannon-Wiener多样性指数,分析羊草遗传多样性地理分布。结果表明:羊草不同性状的遗传多样性差异较大,数量性状的遗传多样性高于质量性状;5个质量性状的遗传多样性指数平均为0.861,其中锈病发生程度遗传多样性最高;17个数量性状的多样性指数平均值为1.257,其中叶长宽比遗传多样性最高;内蒙古中部地区是羊草遗传多样性分布中心,也是遗传多样性保护重点区域。

摘要： 为了解广西乐业野生春兰种质间的亲缘关系,提高其利用效率,对66份春兰种质资源的43个表型性状(13个数量性状和30个质量性状)进行多样性和相关性分析,对乐业县各来源的春兰资源进行聚类分析,并从表型性状主成分分析的基础上对其进行综合评价。结果表明:春兰种质表型多样性丰富。数量性状变异程度较高,变异系数(CV)为11.62%~41.56%,其中花梗长的CV值最高。质量性状变异系数为9.26%~55.7%,以开花习性、唇瓣主色和花瓣形状的CV值居高。说明花梗长、开花习性、唇瓣主色和瓣形都是春兰观赏性状的重点选育方向。相关性分析结果表明,花侧萼片宽(SSW)和花中萼片宽(SMW)、花侧萼片长(SSL)和花中萼片长(MSL)、花侧萼片形状(SSS)和花中萼片形状(MSS)、花瓣内侧主色(PIMC)和花萼片主色(SMC)之间呈显著正相关,相关系数分别为0.7951、0.7648、0.771、0.741;花侧萼片夹角(SSA)和侧萼片先端形状(SSPS)、唇瓣形状(LS)和中萼片先端形状(SSPS)、唇瓣色斑数量(LSN)和叶色(LC)之间则呈显著负相关,相关系数分别是–0.4557、–0.4316、–0.4181。数量性状和质量性状主成分分析分别提取5个和11个主成分,共10个因子,累计贡献率分别为78.193%和73.023%,可反映乐业春兰的总体形态表现;聚类分析结果显示,在欧氏距离为18.77处可将66份春兰种质划分为4组,其中第Ⅰ组只有一个55号品种,第Ⅱ组包含9个品种,主要以来源地相同为主,第Ⅲ组28份种质以红色花为主,第Ⅳ组28份种质,主要特征是花朵较大。研究筛选出19138-38、19138-40、18011、18007、19134-1共5份种质综合评价较高。该结果为了解广西野生春兰种质间亲缘关系及其评价与利用提供理论依据。

摘要： 生物的数量性状遗传受多对等位基因控制,由于控制性状的等位基因较多,依据自由组合定律,会产生多种基因型,进而出现多种表现型。在面对数量性状类遗传试题时,学生会由于基因型和表现型较多而不容易分析、计算。经过对比研究发现,借用“杨辉三角”可以巧解数量性状类遗传试题。

摘要： 以85份性状典型的酸枣种质为样品,对酸枣果实、核壳和仁的20个数量性状的分布、变异系数及其相关性进行了分析。研究结果表明,除了出仁率、双仁率和斯皮诺素含量外,其它数量性状均表现为集中性的正态分布;各数量性状变异系数差异较大,位于0.066~0.571之间,变异系数0.1以上的数量性状有16个,种质资源丰富;果肉重、可食率均与果实重与果实横径正相关,仁重、出仁率与仁厚、果实的纵横径正相关,出仁率与核壳重、核横径负相关,酸枣仁皂苷A含量与斯皮诺素含量二者正相关,与其他数量性状均负相关,斯皮诺素含量与果肉(果实)重、可食率和果实纵径的负相关性达到显著水平。

摘要： 【目的】对32份建兰品种资源的18个主要数量性状进行观测与分析,为建兰品种DUS性状科学判定方法的建立提供支持。【方法】以收集保存的32份建兰品种资源为试验材料,依据NY/T 2441-2013《植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南:兰属》(以下简称《兰属植物DUS测试指南》)中的测试要求,每个品种测量10株,每株取样1个,对建兰植株的大小(高度)和叶片数、叶长度和宽度、假鳞茎大小、花序花数量、花序梗长度和粗度以及花、中萼片、侧萼片、花瓣、唇瓣的长度和宽度共18个主要数量性状进行测量并采集数据,利用Excel和SPSS软件进行数量性状分级与各级分布频率分析、相关性分析、变异情况分析和主成分分析。【结果】根据《兰属植物DUS测试指南》中的分级数并结合实际情况对18个数量性状进行分级,将叶片数由5级改为3级,花序花数量由9级改为5级;根据各级的分布频率结果可知,18个数量性状中除植株大小是偏左的偏态分布外,其余17个数量性状较为符合不同峰度的正态分布。相比植株和叶片性状,花部性状间相关性更高,花长度、花宽度与萼片、花瓣、唇瓣长度呈极显著正相关,萼片宽度与花瓣宽度呈极显著正相关。32份建兰品种资源品种内变异系数均小于15%,稳定性较高,而品种间变异系数较大,变异丰富。通过主成分分析,选择出的分组性状为花长度、植株大小、萼片宽度、花序梗长度和假鳞茎大小,与《兰属植物DUS测试指南》中的分组性状部分吻合,可以增加花序梗长度作为分组性状。【结论】建兰种质资源品种内稳定性较好,品种间变异丰富,为种质资源创新利用提供了更大的选择潜力;DUS测试数量性状具有较大的不确定性,要结合标准品种或实际栽培品种来进行分级,并进行年度间的矫正;数量性状的分组性状可以通过主成分分析进行筛选。

摘要： 目的:分析山东省农业农村厅审定的春白菜、夏白菜和秋白菜品种的表型特征、商品性和推广度,方便农户选种的同时,指导后期育种需求。内容:对审定白菜品种的各个数量和质量性状的最小值、最大值、平均数、标准差和变异系数进行了统计,以描述审定品种总体特性和各个品种的特性。结果:审定品种中以秋白为主;不同性状的差异性在秋白品种中也最显著,但以春白的维生素C含量、秋白的单球重和可溶性糖的变异最大,但不同品种对病毒病和霜霉病抗性变异系数最高,尤其对秋白的病毒病病情的变异系数最高达到107.26%。并且根据春白、夏白和秋白栽培要求,对现有的审定品种进行了分析推荐。

摘要： 利用双亲分离群体数量性状表型值可鉴定其主基因+多基因混合遗传模型,为数量性状遗传基础和作物育种提供参考信息。为全面总结数量性状分离分析的研究成果、添加软件包新功能和矫正以前版本的缺陷,在RStudio-1.4.1103平台和R编程语言框架下,开发了具有交互式图形用户界面的R软件包SEA v2.0。该软件可分析14种双亲分离群体类型,每种群体类型均有数据导入、数据分析、后验概率计算和分布曲线绘制4个模块。为节省计算时间,用doParallel包并行计算、data.table包读写数据和MASS包估计分布参数。用KScorrect、kolmim和shiny包简化程序。只要用户上传*.csv格式数据文件并设置相关参数,可快速显示计算结果。通过大豆结荚习性数据分析和MonteCarlo模拟研究,证实了SEAv2.0软件包的有效性。软件包可从https://cran.r-project.org/web/packages/SEA/index.html下载。

摘要： 为筛选优异小麦种质资源,促进黄淮麦区冬小麦遗传改良和种质创新,本研究运用遗传多样性指数、通径分析、聚类分析方法对620份小麦种质资源的质量性状和数量性状进行评价。结果表明:供试种质资源质量性状中饱满度遗传多样性指数最高(1.1396),粒色遗传多样性指数最低(0.0265);供试种质资源数量性状中变异系数最大的为粒长(37.90%),其次为有效穗数(33.28%)和产量(29.88%),结实小穗数遗传多样性指数最高(2.0916)。通径分析结果表明,千粒重、生物量对产量的正向直接作用最大,通径系数分别为0.3064、0.2513;株高、生育期对产量的负向直接作用最大,通径系数分别为-0.3889、-0.1110。用欧氏距离聚类分析发现,620份小麦种质资源分为10个类群,主要集中在4个类群,各类群特征不同;来自地方品种和现代品种的620份小麦种质资源各具特点,在质量性状和数量性状上具有丰富的遗传多样性,通过综合评价筛选出的91份较为优异的种质材料,可作为亲本材料应用于黄淮麦区小麦品种改良和遗传育种。

摘要： 兵豆营养丰富,在我国栽培历史悠久,但目前我国对兵豆的相关研究较少,兵豆品种保护的工作更是缺乏。对45份兵豆种质资源的质量性状进行了多样性分析,并对其数量性状进行了相关性分析与分级。结果表明,45份兵豆种质资源所测的7个主要质量性状的多样性指数均小于1;对7个数量性状的相关性分析结果表明,其中4组数量性状呈显著相关。进一步结合国际植物新品种保护联盟(UPOV)指南和我国兵豆种质资源现状对其中5个主要数量性状进行重新分级,种子直径和荚果宽度分为3级,株高、荚果长度和百粒质量分为5级。研究结果可为兵豆种质资源保护和兵豆DUS测试指南的制定提供参考。

摘要： 为鉴定火龙果种质材料的亲缘关系,筛选优良亲本,提高育种效率,采用ISSR分子标记技术,对25份火龙果种质材料进行遗传背景研究,将植株及果实的20个数量性状数据标准化后,采用欧氏距离计算种质间遗传距离进行比较分析。结果显示,7条ISSR引物共检测到97个位点,其中多态性位点数为93个,多态性条带比例为95.88%。基于分子标记的UPGMA聚类分析,在阈值为0.54处可将25份种质材料分为6大组群,各种质材料的相似系数分布在0.41~0.86之间。20个数量性状的变异系数在12.35%~51.66%之间,Ward法聚类分析在欧式距离为5处,可将25份种质聚为6个组群。两种分类结果并不一致,但均显示出火龙果种质丰富的遗传多样性,可根据分类结果及育种目的筛选适宜亲本。

摘要： DUS测试是植物新品种保护的技术基础和授权依据.本研究按照农业部发布的结缕草属(Zoysia)DUS测试指南,对包括两个申请品种及其近似品种和标准品种在内的10份结缕草材料进行了连续两个独立生长周期的DUS测试,并使用代码法和数理统计分析法两种方法对8个数量性状的特异性进行判定,旨在为结缕草申请品种DUS数量性状的特异性判定提供依据.两种方法判定结果比较发现,使用代码法判定有特异性的数量性状不一定在统计学上有显著差异,而判定为没有特异性的数量性状在统计学上却可能有显著差异.为了避免特异性误判,对代码法判定有特异性的数量性状进一步做了数理统计分析.结果表明,广绿结缕草在匍匐茎节间长、叶长和种子千粒重3个数量性状上具备特异性;Z0413-1结缕草在匍匐茎节间长、叶宽和花序小穗数3个数量性状上具备特异性.

摘要： 平榛是我国重要的野生榛属植物资源,为了更好地对平榛种质资源进行评价及描述,本研究以选自全国5 省区14个种源地的99份平榛资源为基础材料,进行了16个坚果数量性状的调查和统计分析.结果表明,平榛坚果数量性状的变异较为丰富,变异幅度在5.77～59.00％.经K-S检验表明,供试性状除果腔系数和壳仁间隙的双侧显著性值小于0.05外,其余均遵从正态分布.对服从正态分布的数量性状统一用概率分级的方法进行分级,据此分级原理,初步建立了平榛种质资源数量性状分级指标体系,为平榛种质资源坚果性状的评价、描述和质量等级的建立提供了参考.

摘要： 在恩施种植125份国外马铃薯种质资源,调查及测定16个质量性状和9个数量性状,通过进行遗传多样性分析和T检验分析,对其进行鉴定评价,为选育南方春种马铃薯新品种及生产利用提供参考.结果表明,种质资源质量性状的遗传多样性指数为0.058～3.730,其中以株型、分枝多少、皮色、叶色、块茎整齐度、块茎大小、薯形的遗传多样性指数较高,均高于1.792,植株繁茂性、植株晚疫病抗性性状遗传多样性指数最低,均低于0.1,USDA×96-56、300046.22、301029.18表现抗病,Dorita5186、Flora、Mittelfruhe、Ottar F6感病,其余材料均表现高感,占94.4％;资源材料的数量性状多样性指数在3.2189～4.8283,资源种类多样性较高,资源材料的茎粗、块茎产量、干物质含量、淀粉含量、维生素C含量、粗蛋白含量、还原糖含量性状与对照相比差异均达到极显著水平,资源材料主要以中高产为主,约占55.2％,其中产量高于45000kg/hm2的有14份,综合性状表现良好,为选育南方春种马铃薯新品种奠定了基础.

摘要： 为探讨实生茶树主要数量性状与单株产量间的关系,对27株实生茶树单株的数量性状进行调查并进行相关性和通径分析.结果表明,幼龄期茶树的叶片数、芽密度与6龄单株产量呈显著正相关关系,相关系数分别为0.517和0.516;单株产量只与株高和树冠面积有显著线性关系,多元回归方程为Y=83.522+0.602x6+0.715x7(r=0.797**);通径分析表明,树冠面积、叶片数、芽密度、百芽重是影响单株产量的重要因素,各性状间的互作效应对单株产量也有重要的影响,分枝数和叶片数,叶片数和芽密度,叶片数和树冠面积、百芽重和芽密度是影响单株产量的4组重要互作因素.株高、茎粗、分枝数不是直接构成产量的主要因素,但间接通过树冠面积、叶片数、芽密度对产量产生影响.

摘要： 种子休眠是植物在长期系统发育过程中所形成的抵抗外界不良环境的适应性,它也是一个重要的农艺性状,影响种子产量,品质和加工表现,与农业生产实践的经济效益密切相关.休眠性过强的种子发芽率低,直接影响到十字花科芸薹种作物直播栽培.因此,分离控制种子休眠的关键基因对芸薹种蔬菜作物的生产和育种有着重要的指导意义.本研究中,利用有强休眠的'四九菜心,品种作为轮回亲本,弱休眠的大白菜自交系'Chiifu'作为供体亲本,构建了一套染色体片段代换系(CSSLs),并对种子休眠性状进行了初步数量性状(QTL)定位,利用染色体插入片段位置的比较,在大白菜染色体A03、A05和A07上找到四个位点.并通过与拟南芥同源区域比对分析,在对应区域找到16个与休眠相关基因,为后续精细定位工作奠定了一定的理论基础.

摘要： 为筛选适宜甘肃省榆中县种植的马铃薯新品系,2014年引进16个马铃薯新品系以"陇薯10号"为对照进行了品种比较试验.结果表明,"L1011-15""L08104-12"植株主要数量性状，以及块茎性状优良,表现突出,"L1011-15"产量达3 249 kg/667 m2,较对照增产8.8％;"L08104-12"产量3 119 kg/667 m2较对照增产4.4％.适宜在榆中县推广种植.

摘要： 对18份甘蔗原种或地方种的14个数量性状进行了调查及统计分析,结果表明:数量性状的遗传变异主要来自甘蔗蔗糖分、单茎重、叶宽、茎径和纤维分;对数量性状进行主成分分析提取了4个主成分,4个主成分因子分别为―品质因子‖、―生长因子‖、―成熟度因子‖和―光合因子‖,累积贡献率达83.482％,;主成分因子综合评价分析,得出数量性状综合表型高于平均水平的10份材料,依次为:Sampana→甜圪塔→合庆草甘蔗→桂林竹蔗→坦桑尼亚→芒戈→古芝蔗→大岛再来→托江红→春尼;聚类分析基于不同的遗传距离可将18份种质聚为5个类别,潜在的杂交组合是Sampana和甜圪塔或Sampana和合庆草甘蔗,表明在甘蔗育种亲本选择上既要考虑各性状主要因子的互补,又要保持一定的遗传距离.本研究认为在甘蔗育种工作中利用因子分析进行表型遗传多样性分析将有助于亲本和杂交组合的选择.

摘要： 猪乳头数数量性状是种猪选育的重要指标之一,其数目的多少及对称情况是影响窝仔数、母猪哺育率和仔猪成活率的重要因素.因此,本研究选取乳头数作为研究对象,利用基因池测序和PCR-RLFP方法研究与乳头数数量性状相关的基因——淋巴增强因子(LEF-1)的多态性,并评估其对地方品种(汉江黑猪和八眉猪)与培育品种(关中黑猪)乳头数数量性状的影响.结果表明,在猪LEF-1基因第四外显子(NC_010450.3:g.99514A＞G)和第九内含子(NC_010450.3:g.119846C＞T)中存在着两个突变位点,能够显著影响猪乳头数.因此,99514A＞G和119846C＞T突变位点可作为辅助遗传标记Marker,为提高中国地方猪种高乳头数的选育提供理论依据.

摘要： 玉米淀粉或脱胚玉米中含有一定量的脂类和蛋白质,在挤压过程中,脂类与淀粉会发生复合,本试验通过CI(Complex index)、DSC分析淀粉与脂类和蛋白质发生复合的情况.淀粉/胚芽混合挤出物、淀粉/蛋白粉混合挤出物的CI表明,淀粉与脂类、蛋白均发生复合反应,产生新的物质,使直链淀粉结合碘的能力降低.随着胚芽或蛋白粉添加比例的增加,CI增大.添加中温α-淀粉酶和高温α-淀粉酶脱胚玉米挤出物CI值较高,均大于55.但是淀粉-脂类复合物结构不稳定,可以分离.淀粉与十六酸混合挤出物的DSC分析结果表明,淀粉-十六酸复合物的熔融焓变随着十六酸添加比例的增加而升高,挤压过程中淀粉与十六酸发生复合.产生复合物的数量多,在DSC升温过程中就需要吸收更多的热量,因而导致吸热峰焓变升高,而且复合物的熔融吸热峰尖峰温度均＞10.

摘要： 玉米淀粉或脱胚玉米中含有一定量的脂类和蛋白质,在挤压过程中,脂类与淀粉会发生复合,本试验通过CI(Complex index)、DSC分析淀粉与脂类和蛋白质发生复合的情况.淀粉/胚芽混合挤出物、淀粉/蛋白粉混合挤出物的CI表明,淀粉与脂类、蛋白均发生复合反应,产生新的物质,使直链淀粉结合碘的能力降低.随着胚芽或蛋白粉添加比例的增加,CI增大.添加中温α-淀粉酶和高温α-淀粉酶脱胚玉米挤出物CI值较高,均大于55.但是淀粉-脂类复合物结构不稳定,可以分离.淀粉与十六酸混合挤出物的DSC分析结果表明,淀粉-十六酸复合物的熔融焓变随着十六酸添加比例的增加而升高,挤压过程中淀粉与十六酸发生复合.产生复合物的数量多,在DSC升温过程中就需要吸收更多的热量,因而导致吸热峰焓变升高,而且复合物的熔融吸热峰尖峰温度均＞10.

摘要： 本发明涉及生物信息学中的数据挖掘领域，具体涉及一种基于异构图卷积神经网络的合成致死相互作用预测方法。其发明内容主要包括：(1)收集乳腺癌FPKMRNA‑seq信息、乳腺癌的CNV数据、乳腺癌高置信度风险基因信息；(2)进行基于秩的方法对乳腺癌拷贝数变异(CNV)和mRNA数据进行预处理；(3)建立基于蛋白质相互作用知识和信号通路的基因‑基因相互作用网络，利用网络聚类算法生成高密度子网络；(4)构建基于群稀疏学习模型来描述子网与目标基因的mRNA表达之间的关联关系，使用均方根误差(RMSE)衡量CNVs预测目标基因表达变化的能力，采用k‑fold折交叉验证算法进行交叉验证，使用Speraman相关研究方法，并结合通路富集分析对基因表达与CNV进行相关性分析。

摘要： 本发明涉及植物育种和遗传学领域，具体地讲，本发明涉及大豆属。更具体地讲，本发明涉及含有一个或多个抗病性数量性状基因座的大豆植物的筛选方法、具有这种基因座的大豆品种以及具有这种基因座的大豆的育种和筛选方法。本发明还涉及外来种质在育种程序中的用途。

摘要： 本发明提供了一种基于Richards方程的树木数量性状的QTL定位框架的方法，属于生物信息学分析技术领域。所述方法利用Richards生长方程拟合树木数量性状的生长曲线，得到数量性状的Richards估计参数，根据性状表型随时间的相关关系获得SAD(1)模型的结构参数；根据生长参数在基因型之间的差异进行功能作图，筛选调控树木数量性状生长的显著QTL；计算显著QTL遗传效应值以及遗传力，建立QTL之间的调控结构网络，识别解释树木数量性状生长过程的关键调控QTL。本发明所述方法具有很强的生物学意义且定位精度高，建立的遗传效应调控网络为遗传结构分析提供了有效方法，使性状生长分析更加全面。

摘要： 本发明属于生物医学、基因检测技术领域，具体涉及一组右眼等效球镜数量性状相关的SNP标志物及其应用。本发明提供了检测rs2547319的试剂在判断右眼等效球镜中的应用。

摘要： 本发明公开了一组左眼柱镜数量性状相关的SNP标志物及其应用。本发明采用多个相关SNP联合利用人工智能方法构建风险预测模型。上述研究成果可辅助临床进行近视的提前预测，早期诊断。

摘要： 本发明涉及分子生物学技术领域，公开了大豆异黄酮和蛋白质含量相关的共定位数量性状基因座，包括分别位于大豆6号、8号、9号染色体上的三对数量性状基因座及其任意组合，所述三对数量性状基因座分别为：在6号染色体上共定位的qISO6.2与qPC6.1；在8号染色体上共定位的qISO8.1与qPC8；在9号染色体上共定位的qISO9.1与qISO9.2。所述共定位数量性状基因座能够用于开发同时与大豆的异黄酮含量及蛋白含量协同相关的分子标记及其引物、用于大豆蛋白和异黄酮协同分子标记辅助育种，所开发的大豆新品种用于制备心脑血管疾病相关老年食品和/或婴幼儿、儿童食品。

摘要： 本发明公开了与大豆异黄酮含量相关的数量性状基因座及其应用，提供了基于高密度遗传连锁图谱的大豆分子标记辅助育种方法，择取培大豆品种JD12ZDD23040与野生大豆品种Y9ZYD02739杂交，使用单种子下降SSD法构建由185个F8来源的重组自交系RIL组成的对照群体；通过测序和SNP调用进行基因分型，进行图谱构建和QTL检测及QTL的整合分析；基于统计分析得到与大豆异黄酮含量性状显著相关的整合QTL；基于所得整合QTL进行分子标记及其引物的开发，用于与大豆异黄酮含量性状相关的大豆分子标记辅助育种。

摘要： 本发明公开了一组太行鸡开产日龄相关的数量性状基因座，位于基因组的chr19:6 406 070‑chr19:6 412 735区间内，包括物理距离如下的显著SNP位点当中的一组或多组：19:6381462、19:6382350、19:6382585、19:6382662、19:6382781、19:6406070、19:6406141、19:6406152、19:6406169、19:6406170、19:6406188、19:6406306、19:6408239、19:6412674、19:6412735。本发明开发了一系列与蛋鸡开产日龄相关的SNP位点，能够用于开发与太行鸡开产日龄相关的分子标记及其引物，并进一步用于太行鸡的分子标记辅助选择育种，以获得开产日龄更早的优势太行鸡品种。

摘要： 本发明公开了一种与杨树花青素含量相关数量性状位点分子标记方法，涉及杨树分子遗传育种技术领域；本发明在杨树第17号染色体发现与杨树花青素含量相关的主效QTL，并确定6个与杨树花青素含量相关的SNP。本发明的与杨树花青素含量相关QTL位点分子标记方法，为彩叶杨树创制和选育提供了新的选择，在加速杨树育种进程上有重要应用价值。

摘要： 本发明公开了一种基因网络数量性状定位检测方法和系统，克服现有的表达数量性状基因座方法存在的忽略基因相互作用的不足。其技术方案为：本发明的nQTL模型是检测级联关联为基因型→基因网络→表型，而非传统eQTL方法的基因型→基因表达→表型。本发明在单样本网络的基础上开发了新的nQTL框架，不仅可以识别用于分析复杂生物学过程的边对/网络特征，而且还可以识别表征每种表型及其子类型的边对/网络特征。