群体遗传学
群体遗传学的相关文献在1979年到2022年内共计284篇,主要集中在遗传学、基础医学、人类学
等领域,其中期刊论文265篇、会议论文19篇、专利文献24710篇;相关期刊156种,包括法医学杂志、中国法医学杂志、生物多样性等;
相关会议18种,包括2014年中国畜牧兽医学会养猪学分会学术研讨会、2013全国高性能计算学术年会、2010年全国养羊生产与学术研讨会等;群体遗传学的相关文献由738位作者贡献,包括余跃生、李生斌、陆玉炯等。
群体遗传学—发文量
专利文献>
论文:24710篇
占比:98.86%
总计:24994篇
群体遗传学
-研究学者
- 余跃生
- 李生斌
- 陆玉炯
- 王身立
- 赵兴春
- 宋国琴
- 宋土生
- 张庆忠
- 张建
- 李卫民
- 袁育康
- 许健
- 陈雪玲
- 黄辰
- 万立华
- 丛斌
- 付育红
- 原梅
- 吴晓林
- 常洪
- 应斌武
- 张立岭
- 戎聚全
- 施启顺
- 李万水
- 李颖
- 杜若甫
- 江丽
- 王克松
- 相大鹏
- 董丙君
- 董玲玲
- 蔡颖
- 许业莉
- 邱祥智
- 马温华
- 马骏
- 高基民
- 黄海荣
- 龙友国
- 乔传令
- 于佳琳
- 于博洋
- 于蛟
- 何戎华
- 侯一平
- 侯鑫
- 俞理辉
- 刘俊娥
- 刘健
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王飞;
王萌;
张兴华;
宇克莉;
郑连斌;
杨亚军
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摘要:
中国西南地区分布着众多少数民族,同时也包含许多地理和遗传隔离的人群,然而这些族群的遗传结构,特别是父系遗传结构缺乏深度解析。本研究采用Y染色体捕获及Illumina测序技术,对西南地区3个隔离人群男性无关个体样本,包括四川平武县的白马人、石棉县的木雅人及云南景洪市空格人,通过定点复合扩增检测,直接计数法计算相关单倍群频率,应用Past3.0软件进行PCA(principle component analysis,PCA)主成分分析并绘制群体聚类树,研究了3个族群的父系遗传结构,并探讨其遗传亚结构关系。本研究共观察到云南空格人三种Y染色体单倍群、四川白马人四种Y染色体单倍群以及木雅人五种Y染色体单倍群。结果表明,空格人与佤族的父系遗传关系最近;而白马人和木雅人主要集中在D单倍群及其下游,研究提示着白马人和四川羌族的父系遗传关系最近;木雅人与昌都地区藏族和林芝地区藏族父系遗传关系最近。本文对不同族群遗传结构的分析,丰富了我国隔离人群遗传关系的研究成果。
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吴昊天;
李亚琳;
王军;
陈晓雯;
陆颖;
王成辉
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摘要:
【目的】了解新疆和西藏地区棕鳟养殖群体的遗传多样性状况,解析两地棕鳟的亲缘关系和遗传差异,为棕鳟的分子辅助育种打下数据和方法基础。【方法】采用第二代高通量测序技术对来自新疆达坂城和西藏亚东的2个棕鳟群体各12个个体进行基因组重测序,利用鉴定得到的多态性信息位点进行群体结构、群体遗传多样性和群体间的选择消除分析。【结果】全基因组重测序在2个棕鳟群体中共获得4694474928条Illumina测序序列(reads),参考棕鳟基因组,共鉴定出8559684个单核苷酸多态性(SNP)位点,根据获得的SNP进行计算后发现,新疆和西藏棕鳟群体的遗传多样性指标相似,西藏棕鳟的遗传多样性略高于新疆棕鳟。个体系统发育进化树、群体结构分析和多态性位点主成分分析均显示,2个群体的亲缘关系相近,而连锁不平衡衰减分析表明,西藏棕鳟群体受到的选择压力较大。基于群体分化指数(FST)和核苷酸多态性(Pi)计算的选择消除分析发现,主要在新疆群体的第5号和第19号染色体上,以及西藏群体的第17号和第18号染色体上的较大区域内存在强烈的选择信号,位于这些区域里的共94个基因可能受到较强的选择压力,其中有21个基因与免疫或疾病相关(17个来自于西藏群体,4个来自新疆群体)。【结论】新疆棕鳟和西藏棕鳟源于同一种源,2个群体的遗传多样性差异较小。西藏棕鳟受到的环境选择压力更加明显,受到选择的基因以免疫相关基因为主。
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王晶;
马温华;
董颖强;
刘星雨;
谢颖;
江丽;
李万水;
赵兴春;
张建
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摘要:
对贵州回族、苗族、彝族开展29个Y-STR基因座遗传多态性及群体遗传结构分析,并与其他7个群体进行遗传关系比较研究,探讨其在法医学和群体遗传学中的实际应用价值.应用DNATyperTMY29试剂盒对309名贵州苗族、331名贵州彝族和291名贵州回族无关个体进行检测,统计29个Y-STR基因座的等位基因频率及基因多样性等群体遗传学参数,采用YHRD在线软件进行AMOVA分析.在贵州回族、苗族和彝族3个民族的931个无关个体中观察到816种单倍型,其单倍型多样性分别为0.9955、0.9989和0.9991.基因多样性(GD)值分别为0.2899~0.8747、0.2523~0.9155和0.3162~0.9479,10个人群间的遗传距离在0.0078~0.1389.研究表明,这29个Y-STR基因座在贵州回族、苗族和彝族3个人群中有较高的多态性分布.本研究所得数据可为上述人群的法医学和群体遗传学研究提供基础数据支撑.
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文子龙;
赵毅强
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摘要:
动物驯化是将野生动物改变为能够长期稳定饲养的家养动物的过程.作为新石器时代农业革命的内容,驯化是人类社会文明进步的重要标志之一.由于和人类的密切关系,驯化不仅改变了动物的野生状态,也改变了人类的生活习性和文明进程.动物驯化研究的关键问题包含驯化祖先是谁、驯化所产生的改变及驯化时间地点等.随着高通量基因组技术和对应分析方法的发展,目前研究动物驯化一般基于群体水平,在群体遗传学的框架下研究动物驯化过程中的重要事件.本文总结了群体遗传学下动物驯化研究的相关内容,包括群体动态历史、选择信号、基因交流等,着重介绍了基因选择初始时间和基因交流时间两个新的拓展内容及分析方法,概述了家猪(Sus scrofa f.domestica)、家鸡(Gallus gallus domesticus)、绵羊(Ovis aries)和山羊(Caprine hircus)等几种主要农业动物近期驯化研究的进展,以期为动物驯化研究提供了新的方向和视角.
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于博洋;
于佳琳;
杨宝田;
周瑜;
董丙君
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摘要:
东北雨蛙在我国主要分布于内蒙古和东北三省,在国外主要分布于朝鲜半岛、日本及俄罗斯等地。本研究对采自辽宁省、黑龙江省、吉林省的东北雨蛙共计77个样品的线粒体DNA细胞色素b基因部分序列进行了相关分析,探究东北地区东北雨蛙的遗传多样性及种群遗传结构。研究结果表明,东北雨蛙77条序列中共发现了30个变异位点,定义了23个单倍型。遗传分化指数F_(ST)值和基因流N_(m)值表明种群间存在不同程度的遗传分化。但遗传距离GD值较小,表明种群间的遗传变异较小。分子方差分析显示,东北雨蛙的种群变异主要来自种群间。中性检验分析和岐点分布分析显示,东北雨蛙种群的大小相对稳定,近期内未发生过明显的种群扩张。东北雨蛙种群呈现较低的遗传多样性,因此,应该加强对东北雨蛙种群的关注与保护。
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于婷;
温有锋
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摘要:
探讨柯尔克孜族人群南北疆地区间的差异及与其他族群的亲缘关系,为柯尔克孜族群体遗传学积累资料。随机抽取北疆(塔城地区)和南疆(克孜勒苏柯尔克孜自治州)健康柯尔克孜族成人为研究对象,获得有效样本1299例(其中南疆1066例,北疆233例)。调查方法与判断标准按照席焕久《人体测量方法》,调查所得数据使用SPSS25.0软件进行处理,采用频数分布、χ^(2)检验、聚类分析等进行性别间和群体间的假设检验。
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龙烟朦;
郑天威;
张巧稚;
苗向南;
田军;
尹良宏;
韩雪
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摘要:
目的 2017—2019年北京维通利华实验动物技术有限公司(以下简称,维通利华)连续三年参与美国Charles River Laboratories(CRL)对全球各地设施CD(SD)大鼠生产群的遗传检测,以评估种群的遗传稳定性、杂交系数及各设施间种群的差异.方法 从大鼠耳部样品中提取DNA,使用荧光标记法检测240个单核苷酸多态性(SNP)基因位点,通过GenA1Ex6.5软件统计分析得到位点多态性(P)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(HE)、近交系数(F)和遗传分化系数(FST)等.结果 位点多态性比例分别为73.6%,76.9%和74.2%,遗传具有多样性且保持稳定;杂交系数分别为-0.02、-0.06和-0.07,符合随机交配特性;遗传分化系数(FST)在0.05上下波动.结论 维通利华的CD(SD)大鼠种群保持稳定的遗传多样性,符合随机交配方式繁殖,与CRL美国基础种群呈低至中等程度的遗传分化,定期的引种措施为保持种群的杂交性和稳定性发挥重要作用.
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于博洋;
于佳琳;
杨宝田;
周瑜;
董丙君
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摘要:
东北雨蛙在我国主要分布于内蒙古和东北三省,在国外主要分布于朝鲜半岛、日本及俄罗斯等地.本研究对采自辽宁省、黑龙江省、吉林省的东北雨蛙共计77个样品的线粒体DNA细胞色素b基因部分序列进行了相关分析,探究东北地区东北雨蛙的遗传多样性及种群遗传结构.研究结果表明,东北雨蛙77条序列中共发现了30个变异位点,定义了23个单倍型.遗传分化指数FST值和基因流Nm值表明种群间存在不同程度的遗传分化.但遗传距离GD值较小,表明种群间的遗传变异较小.分子方差分析显示,东北雨蛙的种群变异主要来自种群间.中性检验分析和岐点分布分析显示,东北雨蛙种群的大小相对稳定,近期内未发生过明显的种群扩张.东北雨蛙种群呈现较低的遗传多样性,因此,应该加强对东北雨蛙种群的关注与保护.
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刘亚楠;
刘洁;
魏上;
李亚琳;
李明;
肖俊;
邱高峰;
陆颖
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摘要:
【目的】探究克氏原螯虾养殖群体内和群体间的遗传多样性,为引种和群体间杂交以改善养殖群体种质提供参考依据。【方法】以湖北、江西、安徽、浙江和江苏5省克氏原螯虾主产地14个养殖群体的120个个体为研究对象,采用简化基因组测序技术——特定区点扩增片段测序技术(SLAF-seq)进行基因组测序,获得基因组SNP基因型数据,构建群体系统发育进化树,并进行群体结构、主成分和遗传多样性分析。【结果】共鉴定出741147个单核苷酸多态性(SNP)位点,群体系统进化分析表明,14个群体的种源主要来自浙江金华和江苏宿迁,然后再向各地引种迁徙。群体结构分析结果与系统进化分析结果相吻合。主成分分析结果揭示了安徽长丰和滁州群体、湖北荆州龙口及和平2个群体,以及浙江东阳群体等5个群体与其他群体间存在相对较远的亲缘关系,是杂交引种的潜在种源。群体遗传多样性分析显示,14个群体的Ho介于0.2171~0.2801,平均值为0.2476,He介于0.3424~0.3598,平均值为0.3534,PIC介于0.2750~0.2878,群体间相差不大,接近0.25,各群体均接近遗传多样性中等水平的下限。【结论】14个克氏原螯虾养殖群体内的遗传多样性较低,群体间的亲缘关系较接近,品种单一、长期内交迹象明显。通过群体的基因组重测序,能以较低的成本实现对养殖群体遗传多样性的定期监测。
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龙烟朦;
郑天威;
张巧稚;
苗向南;
田军;
尹良宏;
韩雪
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摘要:
目的2017—2019年北京维通利华实验动物技术有限公司(以下简称,维通利华)连续三年参与美国Charles River Laboratories(CRL)对全球各地设施CD(SD)大鼠生产群的遗传检测,以评估种群的遗传稳定性、杂交系数及各设施间种群的差异。方法从大鼠耳部样品中提取DNA,使用荧光标记法检测240个单核苷酸多态性(SNP)基因位点,通过GenA1Ex6.5软件统计分析得到位点多态性(P)、观测杂合度(H_(o))、期望杂合度(H_(E))、近交系数(F)和遗传分化系数(F_(ST))等。结果位点多态性比例分别为73.6%,76.9%和74.2%,遗传具有多样性且保持稳定;杂交系数分别为-0.02、-0.06和-0.07,符合随机交配特性;遗传分化系数(F_(ST))在0.05上下波动。结论维通利华的CD(SD)大鼠种群保持稳定的遗传多样性,符合随机交配方式繁殖,与CRL美国基础种群呈低至中等程度的遗传分化,定期的引种措施为保持种群的杂交性和稳定性发挥重要作用。
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李卫民;
李颖;
付育红;
原梅;
董玲玲;
黄海荣;
高基民
- 《中国防痨协会2016年全国学术大会》
| 2016年
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摘要:
目的:探讨在中国四川盆地流行的结核分枝杆菌群体遗传学特征. 方法:对收集自四川盆地(重庆和四川地区)的413株Mtb行长序列多态性(LSP)谱系鉴定;采用x2检验分析不同谱系Mtb在人群中的分布差异.对上述菌株行15位点数目可变串联重复序列(VNTR)基因分型,评价各位点的分辨力.构建N-J树分析其系统进化;构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构;采用分子方差分析该地区不同谱系菌株的遗传分化;采用贝叶斯模型计算最近共祖年代. 结果:通过LSP可将413株Mtb菌株分为两大谱系,其中北京谱系占56.2%(232/413);欧美谱系占43.8%(181/413).两谱系Mtb在人群中的分布(性别、年龄、民族及耐药性)差异无统计学意义(P>0.05).北京谱系Mtb的N-J树呈放射状分布,最小跨度树中有72.4%(168/232)的菌株被划分到同一"克隆复合群".欧美谱系Mtb的N-J树呈枝状分布,最小跨度树中呈现出多个"克隆复合群".北京谱系Mtb在重庆和四川两地区间有显著的遗传分化(FST=0.01891,P<0.05),而欧美谱系Mtb遗传分化不显著(FST=0.00519,P>0.05).欧美谱系Mtb中最大克隆复合群(共71株)的最近共祖年代为723年(95%CI:517~946年). 结论:北京谱系和欧美谱系Mtb在四川盆地以"互相对抗"形式流行;两谱系Mtb遗传分化存在差异;欧美谱系Mtb的侵入可能与一次历史事件(约720年前的一次战争)有关.
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丁月云;
朱卫华;
陈伟平;
丁冲;
黄龙;
张晓东;
殷宗俊
- 《2014年中国畜牧兽医学会养猪学分会学术研讨会》
| 2014年
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摘要:
为对安徽地方猪TLR4基因进行多态性分析,本试验采用PCR-SSCP结合PCR产物双向测序的方法研究了皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪及长白猪5个群体共354个样本TLR4基因外显子3部分片段的单核苷核多态性,并对检测到的突变位点进行群体遗传学分析.结果检测到2个突变:G417A、C1027A,其基因型的分布在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪、霍寿黑猪和长白猪5个中外猪种间存在极显著差异(p<0.01),其中G417A仅在皖南黑猪、圩猪和安庆六白猪中检测到;C1027A位点基因型分布在猪品种间的差异,是否与品种抗病性有关,值得进一步研究.
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叶志强;
YE ZhiQiang;
LU Mian;
卢冕;
GUO GuiXin;
郭贵鑫;
LUO Qiong;
罗琼;
WANG BingQiang;
王丙强;
FANG Lin;
方林;
Simon See;
SEE Simon;
朱小谦;
ZHU XiaoQian;
LIU GuangMing;
刘光明
- 《2013全国高性能计算学术年会》
| 2013年
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摘要:
基因组数据的快速增长,为群体遗传学研究积累大量第一手的宝贵信息,同时也对如何快速处理这些信息提出巨大的挑战.本文研究了一种新型群体变异检测方法中的动态规划迭代算法,首先将其转化为一系列的矩阵乘法,利用结合律发掘了并行性,接着设计了面向GPU架构的高效实现,与原先的CPU版本相比速度提升超过两百倍;在此基础上,通过MPI实现数据并行计算,利用天河一号超级计算机的多个GPU计算节点获得了进一步加速.本文说明,通过充分挖掘计算问题本身的不同粒度层次上的并行性,并针对性地予以实现,能够在异构架构的超级计算机系统上获得非常高的加速比.
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付松波;
吴杰;
陈峰;
傅松滨;
孙殿军
- 《中华医学会地方病学分会第6次全国地方病学术会议》
| 2007年
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摘要:
目的:研究砷代谢相关基因GSTO1多态性在中国16个人群样本中的分布特征。方法 采用PCR-限制性片断长度多态性方法(PCR-RFLP)检测16个人群样本中A140D位点基因型分布。结果 在1369个样本中,C/C、 C/A、 A/A基因型分别检出979、365和25个,分别占总样本的71.51﹪、26.66﹪和1.83﹪。总体样本突变型等位基因频率为15.15﹪,低于欧洲人群(30.00﹪~35.00﹪)和澳大利亚人群(33.50﹪),高于非洲(8.10﹪)和日本人群(11.80﹪)。AMOVA分析结果表明,16个人群之间及南方与北方人群之间的遗传变异差别有显著性,南方与西北地区之间的遗传变异显著于西北同东北地区的变异。结论 我国不同地区和人群中GSTO1突变型等位基因频率差别较大,祖先基因可能来自于欧洲,后从我国西北地区流人东北和南方。
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付松波;
吴杰;
陈峰;
傅松滨;
孙殿军
- 《中华医学会地方病学分会第6次全国地方病学术会议》
| 2007年
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摘要:
目的:研究砷代谢相关基因GSTO1多态性在中国16个人群样本中的分布特征。方法 采用PCR-限制性片断长度多态性方法(PCR-RFLP)检测16个人群样本中A140D位点基因型分布。结果 在1369个样本中,C/C、 C/A、 A/A基因型分别检出979、365和25个,分别占总样本的71.51﹪、26.66﹪和1.83﹪。总体样本突变型等位基因频率为15.15﹪,低于欧洲人群(30.00﹪~35.00﹪)和澳大利亚人群(33.50﹪),高于非洲(8.10﹪)和日本人群(11.80﹪)。AMOVA分析结果表明,16个人群之间及南方与北方人群之间的遗传变异差别有显著性,南方与西北地区之间的遗传变异显著于西北同东北地区的变异。结论 我国不同地区和人群中GSTO1突变型等位基因频率差别较大,祖先基因可能来自于欧洲,后从我国西北地区流人东北和南方。