微生物多样性

摘要： 目的从微生物角度探究重度低龄儿童龋(severe early childhood caries,S⁃ECC)患儿一次完成龋病治疗前、治疗后3个月内菌斑微生物群落构成和多样性的变化及治疗对于远期无龋状态维持的作用。方法S⁃ECC患儿在全身麻醉下一次完成龋病治疗,采集治疗前(C)、术后7 d(C⁃7D)、1个月(C⁃1M)、3个月(C⁃3M)无龋牙面集合菌斑,并纳入无龋儿童(CF)为对照组,分析治疗前后菌斑微生物群落短期内的动态改建过程。结果S⁃ECC组和CF组菌斑群落组成高度相似;组间α多样性指数差异无统计学意义(P>0.05);从相对丰度值分析,纤毛菌属、聚集杆菌属等在治疗后较术前下降(P<0.05),C⁃7D组血链球菌较C组上升并在3个月内逐渐下降;治疗前韦荣菌属、放线菌属、拟普雷沃菌属、二氧化碳嗜纤维菌属、变异链球菌在C组和CF组间存在显著差异(P<0.05),其中变异链球菌经治疗后的C⁃7D、C⁃1M组与CF组未存在显著差异,而C⁃3M组较CF组出现上升(P<0.01)。结论S⁃ECC患儿在接受治疗后菌群结构的迅速改变,并在治疗后1~3个月逐渐开始建立新的无龋状态下的平衡。核心微生物群的存在使得菌斑群落保持稳定,韦荣菌属、拟普雷沃菌属、变异链球菌等具备作为龋病菌斑微生物标记物潜能。

摘要： 为分析猕猴桃根际土细菌群落结构随连作时间的变化,选取种植1年、3年、4年、5年、8年和12年的猕猴桃植株,对其根际土细菌16S rRNA V4—V5区进行高通量测序和群落结构分析,并对各年份梯度土壤理化性质进行测定,探究连作年份和土壤理化性质对细菌群落结构的影响。结果表明:(1)细菌OTU数、特有OTU数及多样性指数(ACE、Chao1、Shannon、Simpson)均随连作年份的增加呈下降趋势。(2)连作年份显著改变细菌群落组成。检测出的13个细菌门中优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、蓝藻门(Cyanobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes)。对这6个优势菌门和相对丰度>5%的7个优势属分析发现,Xanthomonadales_uncultured、酸杆菌属(Acidibacter)、Cyanobacteria_norank 3个属和蓝藻门的相对丰度随连作年份的增加显著增加,浮霉菌门的相对丰度则随连作年份的增加显著减少。(3)细菌群落组成的改变与土壤理化性质显著相关。对13个优势细菌门和属的相对丰度与土壤理化性质进行Pearson相关性分析发现,其中有11个与土壤电导率(SEC)、氨态氮(AN)、全磷(TP)、速效磷(AP)和速效钾(AK)含量中至少一个指标呈显著正相关或负相关,而与土壤pH、有机质(SOM)、全氮(TN)和硝态氮(NN)含量均无显著相关性。非度量多维尺度分析(NMDS)也表明,土壤AN和AK含量对细菌群落结构有显著影响。综上,连作严重影响了猕猴桃根际土细菌群落结构,不仅改变了土壤理化性质,还通过影响土壤理化性质降低了细菌多样性和特有类群的数量。

摘要： 通过对比有无种植风车草情况下人工湿地不同深度基质表面生物膜的群落组成差异,探究风车草对人工湿地基质微生物多样性的影响效应。结果表明:有无种植风车草,人工湿地基质中均以变形菌门、绿弯菌门、厚壁菌门为优势菌群;种植风车草不仅提高人工湿地基质表面微生物群落的α多样性,并导致其群落组成与无风车草种植情况相比差异显著,进一步的群落组成差异比较分析显示,门水平放线菌门和衣原体门、属水平红游动菌属在有无种植风车草情况下差异显著。本研究结果揭示了种植风车草对人工湿地基质微生物多样性的影响,可为风车草在人工湿地中的应用提供部分理论支持。

摘要： 【目的】沙棘Hippophae rhamnoides根瘤中拥有丰富的微生物资源,探究根瘤内生菌微生物多样性,比较高通量测序与纯培养方法的优劣。【方法】运用16S rRNA高通量测序技术探究沙棘根瘤内生菌相对丰度和多样性差异,并对根瘤内生菌进行分离纯培养,以完成内生菌株库初步构建。【结果】(1)传统分离方法得到纯培养菌株96株,共4门8纲8目13科19属。在门分类水平上,相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicutes。(2)高通量测序分析6组样品(M1~M6)中共有14门34纲89目148科314属。在门分类水平上,相对丰度较高的主要为放线菌门Actinobacteria和变形菌门,两者相对丰度之和为87.50%~97.10%。在属的分类水平上,弗兰克氏菌属Frankia占绝对优势,相对丰度为20.12%~74.81%,平均相对丰度为51.49%。(3)高通量测序与纯培养方法的结果有明显差异,在科和属的分类单元上差异较大。【结论】2种方法都体现沙棘根瘤内生菌的多样性,但纯培养方法仅能够分离到部分内生菌,难以评估物种组成及相对丰度。高通量测序分析能够更为全面地反映多样性信息,且为优化纯培养条件而分离特定物种奠定基础。

摘要： 目的】连作障碍引起的土壤质量劣变是制约种植业可持续发展的瓶颈问题之一。已有研究表明蚯蚓腐熟粪肥能有效提升连作障碍土壤质量。本研究比较了蚯蚓原位腐熟粪肥和使用异地腐熟粪肥对提高土壤理化和生物学性状的效果,以提出高效可行的蚯蚓堆肥施用模式。【方法】田间试验在宁夏连续种植5年番茄的温室内进行,供试番茄品种为‘粉宴1号’。试验以施用尿素0.69 t/hm^(2)为对照(CK),设置了蚯蚓粪肥异位堆肥(将蚯蚓消解腐熟的牛粪有机肥130.4 t/hm^(2)均匀铺在垄上,T1)和原位堆肥(将牛粪179.4 t/hm^(2)和蚯蚓1.76 t/hm^(2)均匀铺在垄上,T2)处理,共3个等氮处理。异位堆肥处理为每季施用蚯蚓腐熟的粪肥;原位堆肥处理为只在试验开始时引入蚯蚓,之后只施加牛粪。在连续种植3年后,在番茄盛果期测定土壤理化性质、微生物多样性和代谢功能。【结果】1)两个蚯蚓粪处理(T1和T2)的土壤pH和电导率(EC)值均显著低于CK;T2处理的土壤pH和EC值在前两茬显著低于T1,而在第三茬与T1差异不显著;在连续3个茬口,土壤全氮、全磷、全钾、总碳、有效氮和速效钾含量均呈T2>T1>CK的趋势(P<0.05)。2)从土壤微生物多样性指数(OTUs数量、Chao1指数和Shannon指数)看,T1处理在第一茬与CK没有显著差异,从第二茬起显著高于CK,而T2处理从第一茬起即显著高于CK,且在第三茬显著高于T1 (P<0.05);3个处理的Simpson指数无显著性差异。3)相较于CK,T1和T2处理的变形菌门、放线菌门、厚壁菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门和硝化螺旋菌门均显著增加,而酸杆菌门和拟杆菌门显著降低;相较于CK和T1处理,T2处理显著增加了绿弯菌门、芽单胞菌门的相对丰度。4)土壤中全碳、全氮、全磷、全钾、有效氮、速效钾含量与微生物多样性指数和优势度指数之间存在显著正相关关系。【结论】相较于蚯蚓异位堆肥,蚯蚓原位堆肥在提高土壤肥力和增加土壤微生物多样性方面更有效。此外,蚯蚓原位堆肥处理增加了绿弯菌门、芽单胞菌门的相对丰度,降低了与连作障碍相关酸杆菌门和拟杆菌门的数量,因而缓解连作障碍的效果更佳。因此,在实际生产中,推荐使用蚯蚓原位堆肥方法。

摘要： 为揭示云南亚热带地区稳定运行的水压式沼气池中微生物多样性的变化,从2019年2-6月每月采集池内微生物样品,采用16S rDNA测序技术对云南亚热带代表性气候区的100 m^(3)的水压式沼气池中微生物多样性进行研究。结果表明:沼气发酵微生物群落结构的物种组成可能随着该地区的气候变化而发生变化,但总体变化不大;在目水平上的优势菌群有梭菌目(Clostridiales,占33.80%)、甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales,占27.70%)、拟杆菌目(Bacteroidales,占18.60%)、厌氧绳菌目(Anaerolineales,占5.38%);产甲烷菌主要由甲烷丝菌属(Methanothrix,占42.00%)、甲烷螺菌属(Methanospirillum,占1.38%)和甲烷八叠球菌属(Methanosarcina,占0.88%)占主导。在云南亚热带代表性气候区水压式沼气池稳定运行的过程中,随时间变化微生物多样性及结构组成差异性不明显,产甲烷菌主要以乙酸型产甲烷菌为主导,甲烷转换途径随着时间变化也未发生显著性变化,同时RDA分析(Redundancy analysis)表明池内温度、进料量均会影响产甲烷菌的生长繁殖,最终影响日产甲烷量。

摘要： 【目的】为研究浏阳洞库3个不同香型陈化烟叶样品微生物多样性和群落组成差异。【方法】利用高通量测序对3个不同香型陈化烟叶样品微生物多样性、群落组成进行显著性差异分析,构建各样品微生物生态网络,并对各细菌群落进行功能预测。【结果】(1)浏阳洞库3个不同香型陈化烟叶样品中细菌物种丰富,在门水平上主要由变形菌门和厚壁菌门组成,在属水平上微生物群落主要由鞘氨醇单胞菌属、丁酸杆菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、不动杆菌属、泛菌属、芽孢杆菌属和短波单胞菌属组成;(2)浏阳洞库3个不同香型陈化烟叶样品微生物多样性和群落组成均存在显著差异,清香型陈化烟叶的微生物群落更为丰富,Buttiauxella、黄单胞菌属、泛菌属、甲基杆菌属、鞘氨醇菌属和Kebplela显著增加,微生物之间相互作用的关系更为复杂,浓香型陈化烟叶的微生物生态网络更稳定。(3)陈化烟叶微生物菌群的化能异养功能、发酵功能占主导地位,这也是微生物在烟叶陈化过程中发挥的主要功能。【结论】陈化烟叶样品细菌物种丰富,不同香型陈化烟叶微生物群落多样性和组成有显著差异,清香型烟叶的微生物群落更为丰富,微生物菌群的化能异养和发酵功能占主导地位。本研究为陈化烟叶的研究提供了微生物信息,为后续作用机制研究、菌种资源开发奠定了基础。

摘要： 【目的】为了解施用不同梯度氮磷钾推荐用量下对烟田土壤细菌群落的物种多样性的影响。【方法】从云南省澄江县烟区采集不同推荐施肥用量处理中的土壤样品,提取土壤总DNA并利用16S rRNA高通量测序技术及生物信息学分析法进行统计分析。【结果】在烟田中不同施肥处理条件下土壤细菌域有7个优势种群,依次为变形菌门(Proteobacteria),酸杆菌门(Acidobacteria),放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes),绿弯菌门(Chloroflexi),厚壁菌门(Firmicutes),这些优势群落占所有有效序列的90%以上。相对于不同氮、钾梯度施用量,不同磷梯度的养分用量对烟田土壤细菌群落的多样性具有显著影响。在磷施用量为67.5 kg/hm^(2)处理条件下,土壤微生物3个α多样性指数最低即OUT=1494(P=0.067),Shannon=5.98(P=0.016)和Simpson=0.9891(P=0.043)。通过不同养分互作条件下优势种群变形菌门α多样性的比较发现,在N=90 kg/hm^(2)的处理中,磷钾不同养分梯度组合可显著改变土壤优势种群变形菌门的多样性,其中当磷的施用量为45 kg/hm^(2),钾的施用量为405 kg/hm^(2)时,变形菌门的Shannon指数和Simpson指数最低,分别为4.640(P=0.049)和0.967(P=0.053),其中当磷的施用量为22.5 kg/hm^(2),钾的施用量为270 kg/hm^(2)时,变形菌门的Shannon指数和Simpson指数最高,分别为4.87(P=0.049)和0.976(P=0.053)。在P=45 kg/hm^(2)的处理中,不同氮、钾组合梯度下,未发现显著改变土壤优势种群变形菌门的α多样性指数的效应,但是当氮和钾(N_(2)K_(3))施用量分别为90和405 kg/hm^(2)时,变形菌门的Shannon指数和Simpson指数分别为4.640(P=0.370)和0.967(P=0.444),相对低于其他处理组。【结论】不同施肥制度能够通过改变土壤性质影响土壤微生物群落的结构和功能特征。

摘要： 为了解青枯病与黑胫病混发烟株茎秆组织的微生物菌群组成,该文采用Illumina Miseq高通量测序技术研究了青枯病与黑胫病混发烟株发病茎秆和健康烟株未发病茎秆组织的真菌、细菌群落结构与多样性。结果表明:(1)发病茎秆组织中真菌群落丰富度与多样性较健康茎秆组织低,细菌群落丰富度与多样性较健康茎秆组织高。(2)健康茎秆组织中的优势真菌属为隐球菌属(Cryptococcus)、链格孢属(Alternaria)和镰刀菌属(Fusarium),三者相对丰度之和>80%。(3)发病茎秆组织中的优势真菌属为隐球菌属、链格孢属、镰刀菌属和unclassified_f_Davidiellaceae。(4)norank_c_Cyanobacteria和劳尔氏菌属(Ralstonia)为发病茎秆组织的优势细菌属。综上所述,青枯病与黑胫病混发能够显著改变烟株茎秆真菌、细菌群落结构与多样性,破坏其微生物群落的稳定。

摘要： 为深入挖掘和利用传统发酵大豆制品微生物菌种资源,采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析了不同地区5类传统发酵大豆制品(纳豆、豆豉、大酱、霉豆渣、天贝)的细菌多样性。结果表明,5类产品菌落总数都在7.0~10.1 lg(CFU/g)之间。5类产品中共鉴定出相对丰度大于1%的细菌58个属,其中相对丰度大于10%的主要优势菌属有杆菌属(Bacillus)、枝芽孢菌属(Virgibacillus)、变形杆菌属(Proteus)、依格纳季氏菌属(Ignatzschineria)、四联球菌属(Tetragenococcus)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、解脲芽孢杆菌属(Ureibacillus)、泛菌属(Pantoea)和片球菌属(Pediococcus)。主成分分析和聚类分析发现,纳豆1、纳豆2和豆豉1菌群结构相似,霉豆渣1和霉豆渣2菌群结构相似,霉豆渣3和大酱1菌群结构相似,天贝1与其他4类产品菌群结构差异较大。本研究结果为传统发酵大豆制品微生物资源的挖掘及其工业化利用提供了理论基础。

摘要： 南水北调工程已经通水一年,水源水从湖北经过1400多公里的重力流抵达北京,长距离输水过程中对于水质或微生物种群的影响很大.本研究采用了分子生物学技术构建分子克隆文库,对南水北调沿途微生物多样性进行了分析,从而评估长距离输水对于微生物多样性和水质带来的风险.研究表明在南水北调沿途并未检测出现致病菌,且大多数检测到的微生物在世界各地的水源地、湖泊、河流检出过.沿程微生物呈逐步变化的趋势,并无大幅度变化,在南水输送至北京过程中,微生物多样性相对稳定,可以认为水质一直保持较好的水平,没有出现水质恶化的现象.

摘要： 利用青贮原理,将干玉米秸秆与废弃白菜混合贮存,研究乙酸对混贮品质及微生物多样性的影响.设置对照ME组(无乙酸添加)和AA组(乙酸添加量0.3％)2个处理组,密封贮存30d,分析其化学组分和发酵品质,并利用Miseq高通量测序分析微生物多样性.结果表明,AA组中ADF、NDF、HC、CL及HOC均显著性降低(P＜0.05),而ADL、wsc及CP均显著性增加(P＜0.05);AA组的乙醇及乙酸含量均显著高于ME组(P＜0.05),乳酸、丁酸及AN/TN含量均显著低于ME组(P＜0.05),且pH值也显著性降低(P＜0.05).从微生物茵群动态分析看出,乙酸的加入大大降低了有害茵肠杆菌属(Enter-obacter)的相对丰度,并提高了乳杆菌属的相对丰度,由20.7％提升至83.8％.总之,乙酸的加入改善了贮存品质,提高了发酵质量.

摘要： 在不同培养条件(出发菌种、Eh和T)下获得驯化污泥(AB-M、AB-F)降解三氯酚,三氯酚降解途径和特性不同,AB-M仅能将三氯酚降解为4-CP,AB-F可使氯酚完全脱氯并使苯环开环.利用16S rRNA高通量测序考察微生物多样性发现,两种污泥含有不同种类和丰度的脱氯菌和共营细菌.另一明显差异为AB-M污泥中不包含Ignavibacteriae,这类菌可使苯环开环,在AB-F污泥中丰度较高,为8.4％.厌氧反应器长期运行结果显示,在低氯酚负荷时,低温运行和高温运行效果差异不明显;高氯酚负荷时,高温运行对有机物去除、氯酚脱氯和苯环开环有利.

摘要： 宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学.它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能.它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质的新理念和新方法.对肠道宏基因组学的研究发现,有很多因素会影响其组成,并且发现肠道的菌落组成与多种疾病如肥胖、糖尿病等都有很大联系.本文对宏基因组学做了一个简单的介绍,总结了其研究现状,并叙述了影响肠道菌群组成的因素.

摘要： 长庆油田华庆地区位于鄂尔多斯沉积盆地陕北斜坡南部,具低孔、超低渗储层,其原油密度低、粘度低、凝点高.单井采油水样共31瓶,采出液初始为极少见的金黄/卵黄色,见光和空气后,迅速呈墨绿色,而静置后部分原油又分层显色,据此将本区原油分为两种:一种原油未分层,大多黑色/墨绿色(原油Ⅰ,10瓶）;另一种明显分层,上层多为墨绿色(原油Ⅱ）,下层为浅黄/深棕色(原油Ⅲ）,共21瓶,下部为水层.本文初步探讨这种特殊颜色变化的原油性质,且其可能包含油藏微生物生长代谢和生物多样性(李磊等,2016).原油密度与族组分百分含量存在明显的相关关系。原油Ⅰ和Ⅱ（图2a-d）与原油Ⅲ的密度都随着饱和烃含量的增加而降低，随着芳烃、非烃、沥青质的含量增加而升高。原油Ⅲ的密度一族组分相关系数要大于原油Ⅰ和Ⅱ的相关系数，可能是由于原油I和II密度变化较小(Ap=0.021)而原油Ⅲ密度变化较大(Ap=0.169)导致。综上，长庆油田华庆地区特殊金黄／卵黄采出液中原油存在两中基本类型：一类为墨绿色，密度较小，饱和烃含量相对较高而非烃、沥青质含量相对较低；另一类为浅黄／深棕色，密度较大，饱和烃含量相对较低而非烃、沥青质含量相对较高。该地区原油密度与饱和烃含量存在负相关关系而与芳烃、非烃、沥青质存在正相关关系。不同微生物以不同类型原油为碳源，因此该地区不同原油类型可能会导致不同的微生物多样性和丰度。

摘要： 以不同发酵阶段的木瓜酵素为研究对象,采用聚合酶链式反应--变性梯度凝胶技术(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)分析木瓜酵素发酵过程中细菌和酵母的多样性,对优势条带进行序列分析,构建系统发育树.结果表明:木瓜酵素自然发酵过程中细菌种类并不丰富,其中假肠膜明串珠菌(Leuconostoc pseudomesenteroides),在第一周之后逐渐消失,植物乳杆菌Lactobacillus plantarum,从第二周开始一直存在,在发酵过程中起主导作用;酵母种类较为羊富,有酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae、单赤酵母Pichia galeiformis、Komagataella phaffii、假丝酵母Candida xestobii、Candida intermedia,其中假丝酵为发酵前期的优势菌,第二周之后逐渐消失,酿酒酵母和毕赤酵母存在于发酵的全过程,为发酵过程中的主要菌种.

摘要： 研究老年人龋病患者和无龋者的唾液和牙菌斑的细菌群落构成,以了解老年人龋病微环境的微生物多样性及群落结构变化,为老年人龋病的病因探究及生态防治提供依据.

摘要： 目的：本试验旨在研究日粮中用荞麦秸秆代替玉米秸秆后对绵羊瘤胃微生物多样性和群落结构的影响. 方法：选取5月龄、体重25土1kg的杜泊羊×小尾寒羊杂交公羊30只,采用完全随机设计平均分为5组.对照组(CK)饲喂基础日粮,试验A、B、C和D组分别饲喂用13.75％、27.5％、41.25％、55％的荞麦秸秆代替基础日粮中部分玉米秸秆配制的试验日粮.预饲期10d,正式期60d.试验结束后进行屠宰取样,从每组中选取4只体重接近的绵羊,去瘤胃液样本,提取瘤胃细菌总DNA,采用Illumina HiSeq PE250高通量测序技术检测瘤胃微生物群落多样性和菌群结构组成. 结果：结果表明:(1)试验组较对照组微生物多样性均有不同程度的降低,试验B、C、D组绵羊瘤胃微生物多样性显著低于对照组,其中试验D组显著最低(P＜0.05).(2)在门的水平上,B组厚壁菌门相对丰度最高,为75％,拟杆菌门相对丰度显著最小,仅为15％.D组厚壁菌门相对丰度最低,为16％,拟杆菌门相对丰度最高,为79％,且变形菌门相对丰度显著高于其他组(P＜0.05);在科的水平上,与对照组相比,B组普雷沃氏菌科相对丰度显著降低,瘤胃菌科、梭菌科和毛螺式菌科相对丰度显著升高(P＜0.05).D组的R24-7相对丰度显著高于其他组,其瘤胃菌科、毛螺菌科、韦荣氏菌科相对丰度显著最低(P＜0.05);在属的水平上,试验组较对照组的琥珀酸菌属显著降低(P＜0.05),A组的普氏菌属最高(P＜0.05),为31.64％,B和C组瘤胃球菌属显著高于其他组(P＜0.05),D组的丁酸弧菌属、粪球菌属和梭菌属相对丰度最低(P＜0.05). 结论：由此可见,日粮中用荞麦秸秆代替玉米秸秆影响了绵羊瘤胃微生物多样性和结构组成,日粮中适量的荞麦秸秆有利于改善绵羊微生物的菌群结构,促进瘤胃有益菌群的生长,而过量的荞麦秸秆可导致绵羊瘤胃菌群发生紊乱,有害菌大量繁殖,不利于有益菌群的生长.

摘要： 微生物对水性涂料产品的稳定性起着重要作用,本实验以广东省某涂料厂的水性涂料为研究对象,利用16S rRNA基因高通量测序技术检测其微生物群落结构及多样性.结果表明5个水性涂料样本在97％的相似水平下共获得有效序列总数224801,涵盖了10门16纲30目46科59属的细菌;物种组成与相对多样性由高到低依次分别为A4、A5、A1、A2和A3;水性涂料样本A1、A2和A3微生物群落结构与聚集规律较为相似,优势菌群均为类芽孢杆菌门、芽胞乳杆菌属和固氮菌;水性涂料样本A5中相对丰度为57.3％的产己酸细菌属于特异菌群.本研究解析了水性涂料中微生物群落结构、相对丰度及多样性,为建立和完善水性涂料中微生物防控体系提供理论支撑.

摘要： 微生物对水性涂料产品的稳定性起着重要作用,本实验以广东省某涂料厂的水性涂料为研究对象,利用16S rRNA基因高通量测序技术检测其微生物群落结构及多样性.结果表明5个水性涂料样本在97％的相似水平下共获得有效序列总数224801,涵盖了10门16纲30目46科59属的细菌;物种组成与相对多样性由高到低依次分别为A4、A5、A1、A2和A3;水性涂料样本A1、A2和A3微生物群落结构与聚集规律较为相似,优势菌群均为类芽孢杆菌门、芽胞乳杆菌属和固氮菌;水性涂料样本A5中相对丰度为57.3％的产己酸细菌属于特异菌群.本研究解析了水性涂料中微生物群落结构、相对丰度及多样性,为建立和完善水性涂料中微生物防控体系提供理论支撑.

摘要： 本发明公开了一种用于提高土壤微生物功能多样性的生物有机肥及其制作方法，步骤一：取休耕土调节水分至40％～60％；步骤二：撒上休耕土质量的12％酒糟有机肥、4％蚯蚓有机肥、12％药渣有机肥、8％油枯有机肥和8％牛粪有机肥，混合均匀后建成条垛；步骤三：发酵1～2天，待条垛温度升到60～65°C时进行第一次翻堆；步骤四：过2～3天后，当条垛温度再次升到60～65°C时再进行翻堆；步骤五：再发酵8～10天，当温度不再上升后即完成生物有机肥的制备；本发明可将休耕土中的微生物进行很好的培育及扩增，应用于耕作土壤中能够显著提高土壤微生物的数量和功能性，优化作物的生长环境，进而能够提高作物的产量。

摘要： 在所公开的方法中提供了用于选择性地提高患有可治疗皮肤状况的受试者的皮肤微生物群的多样性的材料和方法，所述方法使用包含锌化合物、生物相容性表面活性剂和脂质的组合物。可治疗皮肤状况包括健康的皮肤和表现出特应性皮炎(具有或不具有损伤)、皮肤菌群失调和/或痤疮的皮肤。

摘要： 本发明涉及一种用于评价动物肠道微生物群落多样性的微生物基因组DNA间接提取方法。该方法在细胞裂解以前先对样品进行前处理，将微生物细胞从它们粪便样品中分离出来，避免了纯化步骤存在污染物去除困难和DNA回收率低的问题。本发明提取过程不使用酚、氯仿，减少了对实验人员的身体健康伤害。所提取的肠道微生物DNA的OD

摘要： 本发明公开了一种评估微生物群落宏基因（或普通生物群落宏遗传）多样性和相似性的概念和方法，包括用Hill numbers度量单基因水平(Metagenomic Gene：MG)和功能基因群(Metagenomic Functional Gene Cluster：MFGC)水平的宏基因多样性及其相似性。其中多样性包括alpha‑宏基因多样性、beta‑宏基因多样性和gamma‑宏基因多样性，相似性用于比较两个或两个以上群落宏基因多样性。宏基因多样性指数能有效评估和监测人体、动物以及环境微生物群落的宏基因多样性和相似性，并为菌群相关疾病的研究和诊断治疗以及环境微生物宏基因监测提供科学依据和技术体系。本发明同样适用于宏遗传多样性(Metagenetic Diversity)，可用于评估和监测任何生物群落的宏遗传多样性和相似性。

摘要： 本发明公开了复合微生物菌剂、其制备方法及土壤生物多样性的改善方法，涉及农业技术领域。发明人创造性地采用蜡样芽孢杆菌、黑兰节杆菌和假单胞菌三种菌剂，能够参与草甘膦等除草剂的降解途径，加快除草剂的降解，施用之后显著增加了土壤中微生物的丰度，并增加了土壤中酶的活性。

摘要： 本发明公开了一种用于提高土壤微生物功能多样性的生物有机肥及其制作方法，步骤一：取休耕土调节水分至40％～60％；步骤二：撒上休耕土质量的12％酒糟有机肥、4％蚯蚓有机肥、12％药渣有机肥、8％油枯有机肥和8％牛粪有机肥，混合均匀后建成条垛；步骤三：发酵1～2天，待条垛温度升到60～65°C时进行第一次翻堆；步骤四：过2～3天后，当条垛温度再次升到60～65°C时再进行翻堆；步骤五：再发酵8～10天，当温度不再上升后即完成生物有机肥的制备；本发明可将休耕土中的微生物进行很好的培育及扩增，应用于耕作土壤中能够显著提高土壤微生物的数量和功能性，优化作物的生长环境，进而能够提高作物的产量。

摘要： 本发明属于土壤微生物群落多样性分析技术领域，公开了PCR-DGGE法分析石油污染土壤微生物群落多样性的最佳条件和试剂用量。主要体现在：①取0.4g土样可提取足量的DNA；②取1μL纯化DNA直接用于PCR反应；③取3～5μL PCR产物用于DGGE实验；④制胶时宜用9μL TEMED，40μL 10％APS投加到18mL变性丙烯酰胺胶溶液中；⑤灌胶后在顶端用保鲜膜覆盖，隔夜放置，能获得优良的变性胶；⑥设置电压120V，电泳温度60°C，电泳时间5h，可获得良好的DGGE图谱；⑦银染时终止液可不予使用。本发明主要应用于石油污染土壤生物修复过程中分子生态学研究，也可为其他环境样品的分子生态学研究提供参考。

摘要： 本发明公开一种基于生物云平台的微生物多样性分析方法及系统，能够提高微生物多样性分析的效率。方法包括：从云端数据库中获取用户指定的路径对应的测序数据；利用所述路径和预设的参数生成配置文件和任务执行命令；基于所述任务执行命令，利用所述配置文件对所述测序数据进行基本分析，并在基本分析结束后，将基本分析的结果以报告和/或图表的形式进行展示。

摘要： 本发明公开了一种功能性微生物多样性分析用引物和使用该引物的多重扩增，涉及3对用于功能性微生物多样性分析的针对β-葡萄糖苷水解酶基因的引物。经DNAMAN6.0软件进行序列同源性比对后分别设计β-葡萄糖苷水解酶GH1家族的通用简并引物GH1F，GH1R，GH1R-GC，和β-葡萄糖苷水解酶GH3家族细菌、放线菌的通用简并引物GH3BF，GH3BR，GH3BF-GC，以及β-葡萄糖苷水解酶GH3家族真菌的通用简并引物GH3EF，GH3ER，GH3EF-GC，本发明提供的引物具有很好的通用性和实用性，能良好的反应实验对象中参与降解纤维素的功能性微生物的多样性，可以适用于来源于土壤，沉积物，人畜胃肠道等环境样品的分析。

摘要： 本发明公开一种基于生物云平台的微生物多样性分析方法及系统，能够提高微生物多样性分析的效率。方法包括：从云端数据库中获取用户指定的路径对应的测序数据；利用所述路径和预设的参数生成配置文件和任务执行命令；基于所述任务执行命令，利用所述配置文件对所述测序数据进行基本分析，并在基本分析结束后，将基本分析的结果以报告和/或图表的形式进行展示。