泛素化

摘要： 背景:骨髓间充质干细胞作为成骨细胞的前体细胞,探索其分化机制对于预防和治疗骨质疏松症具有重大意义。杜仲能够诱导骨髓间充质干细胞成骨分化,但是杜仲对骨髓间充质干细胞增殖、分化以及Nur77/MDM2/p53通路的影响尚不明确。目的:探究杜仲水提物对骨髓间充质干细胞增殖和分化的影响并探讨其作用机制。方法:杜仲水提物处理人源和鼠源骨髓间充质干细胞,采用CCK-8法和Annexin V-FITC/PI法分别检测细胞增殖和凋亡情况,Western blot检测增殖、凋亡相关蛋白的表达,Nur77及其下游MDM2、p53相关蛋白的表达及泛素化前后的蛋白水平。成脂、成骨定向诱导分化后,Western blot检测脂肪细胞和成骨细胞的标志蛋白表达来评估其分化程度。转染Nur77 siRNA进入10 mg/mL杜仲水提物处理的骨髓间充质干细胞,检测细胞增殖、凋亡和分化情况。最后,敲低Nur77之后,使用p53抑制剂Pifithrin-α处理骨髓间充质干细胞,检测细胞增殖、凋亡和分化情况以明确其作用机制。结果与结论:①杜仲水提物可促进2种骨髓间充质干细胞的增殖和成骨分化,抑制凋亡和成脂分化;②杜仲水提物可上调Nur77、MDM2蛋白表达,促进p53蛋白泛素化;敲低Nur77基因则抑制MDM2蛋白表达及p53蛋白泛素化,促进p53蛋白表达,抑制2种骨髓间充质干细胞增殖和成骨分化;③p53抑制剂可逆转Nur77 siRNA的作用,促进2种骨髓间充质干细胞的增殖和成骨分化,抑制凋亡和成脂分化;④结果表明,杜仲水提物可以通过Nur77/MDM2/p53途径促进2种骨髓间充质干细胞的增殖和成骨分化,为杜仲在骨相关疾病方面的研究提供理论参考。

摘要： 背景:黄芪多糖对骨关节炎有确切疗效,但其作用机制还不清楚.目的:探讨黄芪多糖调控包含WW域的E3泛素蛋白连接酶2(WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2,WWP2)介导的Notch受体1泛素化对骨关节炎的影响.方法:①体内实验:30只C57BL/6小鼠随机分为假手术组、模型组、黄芪多糖组,每组10只.除假手术组外,构建小鼠骨关节炎模型,黄芪多糖组给予黄芪多糖干预,干预4周后麻醉小鼠取膝关节组织,番红O染色法、国际骨关节炎研究协会评分评估小鼠关节软骨损伤情况.②体外实验:采用5μg/L白细胞介素1β培养C28/12细胞24 h建立骨关节炎细胞模型,分为对照组、白细胞介素1β组、50 mg/L黄芪多糖处理组、黄芪多糖联合Notch受体1过表达或WWP2干扰组.MTT法检测细胞增殖,流式细胞术测凋亡,蛋白质免疫共沉淀实验用于验证WWP2和Notch受体1的结合,泛素化实验分析黄芪多糖对WWP2介导的Notch受体1泛素化水平的影响,酶联免疫吸附法检测小鼠膝关节组织和C28/12细胞中蛋白聚糖、Ⅱ型胶原、基质金属蛋白酶3和基质金属蛋白酶13水平,免疫印迹法检测小鼠膝关节组织和C28/12细胞中WWP2、Notch受体1、锯齿状Notch配体1和Notch胞内域1蛋白的表达.结果 与结论:①体内实验结果证实,黄芪多糖干预缓解了小鼠软骨损伤,抑制了膝关节组织基质金属蛋白酶3和基质金属蛋白酶13水平,增加了蛋白聚糖和Ⅱ型胶原表达水平;②体外实验结果证实,黄芪多糖干预促进了细胞增殖、蛋白聚糖、Ⅱ型胶原及WWP2的表达,抑制了细胞凋亡、基质金属蛋白酶3和基质金属蛋白酶13水平、Notch受体1、锯齿状Notch配体1和Notch胞内域1蛋白的表达,Notch受体1过表达和WWP2干扰逆转了黄芪多糖的作用;③黄芪多糖促进了WWP2介导的Notch受体1的泛素化水平;④结果表明,黄芪多糖通过提高WWP2介导的Notch受体1泛素化水平,抑制Notch信号通路,对小鼠骨关节炎起到一定的治疗作用.

摘要： 宫颈癌是女性中常见恶性肿瘤之一,病死率较高,全球死亡女性超过88%发生在发展中国家,其中以宫颈鳞癌最为常见。三方基序蛋白(tripartite motif-containing protein,TRIM)家族大多数具有E3泛素连接酶活性,且与多种生理过程有关,包括细胞增殖、DNA修复、信号转导和转录。近年大量研究发现TRIM家族通过多种通路参与宫颈癌的发生和发展。

摘要： 背景与目的低氧诱导因子(hypoxia-inducible factor 2α,HIF2α)活性增高常见于肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)的进展过程。HIF2α在ccRCC中的功能和作用机制仍不清楚。本研究阐释了连结桥粒斑珠蛋白(junction plakoglobin,JUP)和HIF2α在ccRCC中的作用。方法采用亲和纯化联合质谱(affinity purification and mass spectrometry,AP-MS)、谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione-s-transferase,GST)沉降和免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,Co-IP)法筛选和鉴定出可与HIF2α相互作用的蛋白质。采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)和Western blotting法检测人ccRCC样本中JUP的表达情况。采用荧光素酶报告基因、染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)、环己酰亚胺追踪实验、泛素化检测研究JUP对HIF2α活性的调节。采用细胞计数试剂盒-8(Cell Counting Kit-8,CCK-8)检测、集落形成实验、transwell迁移实验、异种移植瘤模型研究JUP敲减或过表达对肾癌细胞致瘤活性的影响。结果我们的研究发现,JUP是一种新的HIF2α结合蛋白,通过将VHL(von Hippel-Lindau,VHL)和组蛋白去乙酰化酶1/2(histone deacetylases 1/2,HDAC1/2)招募到HIF2α并调节其稳定性和转录活性来发挥重要作用。在体内和体外实验中,敲减JUP可促进肾细胞癌的致瘤活性;相反,JUP过表达则可抑制肾细胞癌的致瘤活性。另外,在ccRCC临床样本中JUP低表达,而且其低表达与低氧评分升高及预后更差相关。结论本研究表明JUP在ccRCC进展过程中通过调节HIF2α信号通路发挥重要作用,JUP可作为一个潜在的治疗靶点。

摘要： 泛素蛋白酶体系统(ubiquitin proteasome system, UPS)和自噬是细胞内蛋白质降解的两大主要机制,主要通过及时降解折叠、损伤和不需要的蛋白质来维持细胞内蛋白质稳定。在这两个系统中泛素化都是降解信号,但是泛素化蛋白质能够精确地被定位于其中一个路径去降解。细胞是如何调控泛素化蛋白质在这两个系统之间穿梭的,引起了众多学者的关注。泛素化链不同的类型和结构最初被认为在这一过程中发挥了关键作用,但是越来越多的研究表明,还存在其他因素影响泛素化蛋白质的降解路径选择,如泛素受体的寡聚形式、蛋白质的翻译后修饰、伴侣蛋白以及N端精氨酸修饰等。本文总结了UPS和自噬两个蛋白降解途径的具体机制,并重点对影响泛素化蛋白质降解路径选择的研究进展进行综述。

摘要： 目的探讨TRIM21基因在肝癌侵袭表型中的作用及机制。方法利用siRNA敲低肝癌细胞MHCC 97H,HCC LM3中的TRIM21、β-catenin基因,将肝癌细胞分为对照组:转染对照siRNA;TRIM21敲低组:转染siTRIM21 RNA;CTNNB1敲低组:转染siCTNNB1 RNA;双敲低组:共转染siTRIM21 RNA及siCTNNB1 RNA。利用Western blotting验证敲除效率及相关通路的激活或抑制情况。通过Transwell侵袭实验检测肿瘤细胞的侵袭性。通过尾静脉注射敲低TRIM21的HCC LM3细胞构建裸鼠肺转移模型以观测其肺转移能力。在HEK 293细胞中过表达TRIM21,将HEK 293细胞分为对照组:加入转染试剂;过表达组:转染flagTRIM21。并利用Co-IP检测TRIM21蛋白与β-catenin的相互作用及泛素化水平。生信分析TCGA数据库中CTNNB1^(high)TRIM21^(high)和CTNNB1^(high)TRIM21^(low)两种亚型肝癌的预后。结果敲低TRIM21可以显著增强肝癌细胞MHCC 97H和HCC LM3的侵袭能力(P<0.01,P<0.05)和HCC LM3细胞的肺转移能力(P<0.01)。机制研究发现,TRIM21可通过泛素化蛋白酶体途径降解β-catenin以减少其入核,进而降低肝癌细胞的的侵袭性(P<0.0001,P<0.05)。由于TRIM21表达水平降低使肝癌细胞中Wnt信号通路激活,最终使CTNNB1^(high)TRIM21^(high)亚型肝癌患者的生存预后明显优于CTNNB1^(high)TRIM21^(low)亚型肝癌患者(P<0.05)。结论TRIM21能通过泛素化途径降解β-catenin来抑制肝癌细胞的侵袭性,这可能导致了CTNNB1^(high)TRIM21^(low)肝癌患者预后较差。

摘要： 泛素化与去泛素化修饰通过调节细胞内蛋白质水平及活性而广泛参与机体的各类生理活动。正常妊娠过程有赖于母胎界面微环境稳态的建立和维持,涉及滋养层细胞、蜕膜基质细胞和蜕膜免疫细胞的增殖、分化、迁移、侵袭、极化、吞噬、分泌等生理活动的精细调控。已有研究证实,泛素-蛋白酶体系统(UPS)在这些细胞生理活动的调控中发挥着重要作用,其功能紊乱则可能导致复发性自然流产(RSA)、子痫前期(PE)等妊娠相关疾病的发生。本文就母胎界面蛋白质泛素化修饰的作用及其与不良妊娠结局相关性的研究进展进行综述,以期为生殖领域基础医学的研究提供参考。

摘要： 目的探究Sch9对酵母寿命的调控作用与泛素化水平之间的相关性。方法通过荧光染色的方法检测酵母细胞的活性氧(ROS)水平,采用超氧化物诱导剂及雷帕霉素靶蛋白复合物1(TORC1)抑制剂处理细胞,并利用蛋白质印迹技术检测细胞泛素化蛋白的表达水平。结果荧光染色显示,对数期sch9Δ突变体具有较高的超氧阴离子(P<0.01)。进一步用超氧诱导剂甲萘醌处理细胞,随着甲萘醌浓度增加,细胞泛素化水平具有降低趋势,且甲萘醌浓度与超氧阴离子含量呈正相关(P<0.01),与H_(2)O_(2)水平呈负相关(P<0.01)。此外,利用雷帕霉素处理细胞,可降低野生型酵母和sch9Δ突变体的泛素化水平(P<0.05)。结论细胞的泛素化与超氧阴离子含量无关,但超氧阴离子可能作为一种适应性的信号激活胁迫应答基因表达。抑制TORC1活性降低泛素化的调控机制,可能与不依赖于Sch9的信号通路有关,为酵母细胞蛋白质量控制和寿命调控提供新的分子理论基础。

摘要： 目的·筛选食管鳞状细胞癌疾病过程中新的潜在致病基因。方法·通过GEO数据库获取miRNA芯片GSE122497和GSE164174的数据,利用GEO2R分别筛选出食管鳞状细胞癌患者和健康人的差异miRNA,Venn diagram webtool工具取交集;采用Target Scan工具及DIANATOOLS工具预测差异miRNA的靶基因,取2款工具的预测靶基因交集进行基因功能分析;利用STRING工具分析靶基因的蛋白质相互作用并选取Hub基因。结果·①芯片中共计108个差异miRNA。②取Target Scan工具和DIANATOOLS工具的交集后,共有1354个差异靶基因。③基因本体(Gene Ontology,GO)分析结果表明,差异靶基因的基因功能显著富集于DNA模板转录调控、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控等生物过程,RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端序列特异性DNA结合、蛋白结合、金属离子结合等分子功能;主要存在于细胞核、核质、细胞质等细胞成分。按照富集的基因数目降序排列,京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析结果表明上述基因显著富集于肿瘤通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、干细胞多能性调控信号通路等。④蛋白质相互作用网络共有1326个节点,2300条边,平均节点连接度为3.47。筛选出的Hub基因:SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶2(SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2,SMURF2)、β-转导重复蛋白E3泛素蛋白连接酶(β-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase,BTRC)、SMAD特异性E3泛素蛋白连接酶1(SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1,SMURF 1)、泛素结合酶E2 D1(ubiquitin conjugating enzyme E2 D1,UBE2D1)、E3泛素连接酶枯灵素2(cullin 2,CUL2),以往研究表明上述基因与泛素化有关。结论·经GEO数据库筛选出的SMURF2、BTRC、SMURF1、UBE2D1、CUL2基因可能通过靶向调控蛋白的泛素化参与食管鳞状细胞癌的疾病过程。

摘要： 目的探讨环指蛋白5(RNF5)通过介导JNK相关膜蛋白(JAMP)泛素化促进内质网应激和细胞凋亡,参与妊娠期糖尿病(GDM)疾病进展过程的机制。方法采用免疫印迹法检测GDM胎盘组织标本中RNF5蛋白的表达水平,并分析其表达水平与内质网应激标志分子:X盒结合蛋白1(XBP-1)、磷酸化真核翻译起始因子2α(p-eIF2α)、真核翻译起始因子2α(eIF2α)、C/EBP同源蛋白(CHOP)表达水平的相关性。采用高糖环境培养BeWo细胞系建立体外GDM细胞模型,siRNA干扰RNF5表达后测定内质网应激标志(XBP-1、p-eIF2α/eIF2α、CHOP)水平的变化。采用CCK8法与流式细胞仪分别检测细胞活力、凋亡情况。采用体外泛素化实验来观察RNF5对JAMP泛素化的调控作用;采用链脲佐菌素注射的方法构建GDM小鼠模型,同时采用尾静脉注射siRNA-RNF5的方法来进行干预,干预4周后观察小鼠体重变化与胰岛素抵抗情况,并于4周后处死小鼠取胎盘组织,测定内质网应激标志分子水平。结果RNF5蛋白质在GDM组胎盘组织中的表达水平显著高于对照组(P<0.05);内质网应激标志水平在GDM产妇胎盘组织内明显上调(P<0.05),并且RNF5蛋白表达水平与内质网应激标志水平呈正相关(P<0.05)。高糖环境能够促进BeWo细胞发生内质网应激和凋亡、降低细胞活力(P<0.05),而下调RNF5能够通过调控JAMP泛素化逆转以上过程(P<0.05);此外下调RNF5可减轻GDM模型小鼠胰岛素抵抗(P<0.05),降低胎盘中的内质网应激标记水平。结论下调RNF5表达能抑制JAMP泛素化介导的内质网应激并抑制细胞凋亡,从而延缓GDM的进展。

摘要： 为了研究弓形虫毒力因子ROP18与人泛素系统相互作用的机制，利用双分子荧光互补(B iFC)技术筛选与弓形虫TgROP18互作的人细胞蛋白，经生物信息学分析，发现ROP18可以和E3连接酶HECTD3结合。在用RH-WT弓形虫感染SF268细胞时，早期的感染时期，HECTD3蛋白的表达量有上调，而晚期的感染则没有显著的差别;而RH-ROP18感染SF268细胞，在早期或晚期都没有显著的改变。HECTD3在细胞凋亡中起着抑制作用，所以说宿主HECTD3可能使弓形虫效应因子ROP18发生泛素化修饰而降低弓形虫的毒力而保全宿主细胞，使弓形虫在神经细胞得以转化为慢性感染，从而实现其在人细胞的免疫逃避。

摘要： 泛素化/去泛素化是一种表观遗传学改变,属于蛋白翻译后修饰过程,参与几乎所有细胞的分化和功能调节.近期研究小组针对在哮喘免疫发病机制起关键作用的几个关键分子的表观遗传学调控，特别是泛素化／去泛素化调控进行了初步研究。

摘要： 病害是影响农作物产量的重要因素之一.植物对于病原菌的防御主要依赖于植物的天然免疫等系统.植物天然免疫系统包含彼此相互关联的两个层面,即PTI和ETI.PTI属于植物的基础免疫反应,对环境微生物有广谱的抗性.它是由病原物中的一些保守的分子结构:病原物相关分子模式PAMP,所诱发的植物免疫反应.植物PTI的信号转导已经被进行了较为广泛的研究,但人们对其精细的调控机制仍知之甚少.E3泛素连接酶和蛋白质泛素化分别是动物天然免疫信号转导的重要组分和调节机制。为了阐明植物天然免疫信号传递的机理及其精细的调节机制，对拟南芥基因组所编码的1400多个E3泛素连接酶基因进行了分析。它们中共有49个基因的表达受到了鞭毛蛋白的诱导或抑制。通过对这些基因的T-DNA插入突变体进行免疫表型分析，发现声fie3-I对于鞭毛蛋白的处理表现出超敏感反应。这表明FIE3-1基因在植物天然免疫中起负调控作用。将对FIE3-I基因调控PTI的机理进行深入研究。

摘要： 本发明涉及包含泛素或泛素样蛋白、膜易位序列和生物活性分子的融合蛋白及其用途。具体地，本发明涉及包含泛素或泛素样蛋白、与该泛素或泛素样蛋白的C-末端连接的膜易位序列、和与该膜易位序列的C-末端连接的生物活性分子的跨膜融合蛋白，编码所述跨膜融合蛋白的多核苷酸，包含所述多核苷酸序列的重组表达载体，由所述重组表达载体转化的细胞，和使用所述跨膜融合蛋白将所述生物活性分子递送至细胞中的方法。

摘要： 本公开的特征为用于靶向泛素活化酶(E1)的结构稳定化肽和/或具有弹头的结构稳定化肽抑制剂。还公开了在治疗表达E1或依赖E1的癌症或疾病中使用所述结构稳定化肽和具有弹头的结构稳定化肽的方法。还提供了用于治疗表达E1或依赖E1的疾病的包括所述结构稳定化肽和/或具有弹头的结构稳定化肽的组合疗法。

摘要： 本发明提供了产生用于评价类泛素或泛素蛋白去修饰酶活性的生化工具的方法，包括：在蛋白酶Lbpro的存在下，使成熟化类泛素或泛素蛋白或其变体与甘氨酰化工具分子接触，从而获得所述用于评价类泛素或泛素蛋白去修饰酶活性的生化工具。

摘要： 一种从蛋白乳中提取泛素及类泛素的方法。？？？？本发明为生物技术领域，是一种从动物或植物的蛋白乳中提取泛素和类泛素的方法：将植物热磨制浆，或者将动物的组织、皮、肉清洗、绞碎后湿磨制浆，离心分离，得到的蛋白乳加热后过滤，得到粗提液和沉淀；将沉淀清洗后再次过滤，所得滤液与粗提液合并，加入活性炭搅拌后除去活性炭，得到的上清液经离心机分离，得到的固相进行喷雾干燥，得到泛素及类泛素，得到的液相与前述蛋白乳合并，再次提取。该方法工艺流程短，操作简单，不引入不安全物质，减少能源消耗，同时综合利用动物或植物，制得的泛素和类泛素可应用在医药、保健品等领域。

摘要： 本发明公开了一种从动物提取泛素及类泛素的方法，包含如下步骤：首先将节肢动物、环节动物、刺胞动物、可食用鱼类或家禽的组织、皮、肉及家畜的组织、皮、肉清洗干净，得到原料；然后将原料绞碎后湿磨，得到浆液；混匀浆液，加入碳酸氢钠或氢氧化钠，搅拌、离心收集上清液；将所述上清液浓缩至原体积的1/10～1/25，得到蛋白浓缩液；加入乙醇，静置后离心收集沉淀；用Tris-Gly缓冲液溶解沉淀配成溶液，将溶液经两次过滤收集分子量在6000～14000之间的截留液，即所述泛素及类泛素。该方法生产工艺简单、成本低，能制得安全性高、营养价值好的泛素及类泛素产品。

摘要： 本发明公开了一种修饰泛素并抑制泛素化通路的方法。该修饰是由革兰氏阴性菌中由III型分泌系统分泌的效应蛋白家族实现的。该家族的效应蛋白是一类二磷酸腺苷(ADP)核糖基转移酶，特异性地对真核生物内泛素分子第66位的苏氨酸残基进行单ADP核糖基化修饰，并且对类泛素蛋白SUMO和NEDD8无修饰作用。这种对泛素的修饰作用不能被真核细胞内去ADP核糖基化修饰的水解酶可逆地去修饰，从而有效破坏了宿主细胞内泛素介导的信号通路，该方法将在杀死肿瘤细胞以及改变细胞信号通路等发挥重要作用。

摘要： 本发明尤其提供了重组工程化的去泛素化酶(DUB)和用于治疗或缓解受试者中的遗传性离子通道病，例如长QT综合征、Brugada综合征或囊性纤维化的方法。进一步提供了用于从导致这类遗传性离子通道病的突变中筛选出可通过本文公开的重组工程化的DUB治疗的运输缺陷突变的方法。

摘要： 本文涉及参与调控去泛素化酶(如USP10多肽)和/或泛素化多肽(如，肿瘤抑制多肽或肿瘤抑制多肽的突变型)的方法和材料。例如，提供增加去泛素化酶(如USP10多肽)表达或活性的方法和材料，降低去泛素化酶(如USP10多肽)表达或活性的方法和材料，稳定肿瘤抑制多肽(如野生型p53多肽)的方法和材料，去稳定肿瘤抑制多肽的突变型(如突变型p53多肽)的方法和材料以及减少癌细胞增殖、增加癌细胞凋亡和/或治疗癌症(如野生型p53多肽水平下降的癌症或突变型p53多肽水平上升的癌症)的方法和材料。本文还提供鉴定介导p53多肽稳定的USP10多肽的激动剂和拮抗剂的方法和材料。

摘要： 本发明公开了一种修饰泛素并抑制泛素化通路的方法。该修饰是由革兰氏阴性菌中由III型分泌系统分泌的效应蛋白家族实现的。该家族的效应蛋白是一类二磷酸腺苷(ADP)核糖基转移酶，特异性地对真核生物内泛素分子第66位的苏氨酸残基进行单ADP核糖基化修饰，并且对类泛素蛋白SUMO和NEDD8无修饰作用。这种对泛素的修饰作用不能被真核细胞内去ADP核糖基化修饰的水解酶可逆地去修饰，从而有效破坏了宿主细胞内泛素介导的信号通路，该方法将在杀死肿瘤细胞以及改变细胞信号通路等发挥重要作用。

摘要： 本发明涉及一种利用泛素结合结构域（Ubiquitin-bindingdomain，UBD）融合蛋白分离和检测泛素化蛋白的方法。其原理是用一个亲和标签与一个泛素结合结构域构建一个融合蛋白。该融合蛋白可在大肠杆菌中表达并通过其亲和标签的配体进行纯化及固定在凝胶颗粒上。带有泛素结合结构域融合蛋白的凝胶颗粒与细胞或组织的裂解液共育，可将裂解液中的泛素化蛋白通过沉淀分离出来。本发明在检测泛素化蛋白上比目前的抗体免疫沉淀检测法具有更高的效率，检测容量和灵敏度。此外，从经济效益角度相比，本发明检测泛素化蛋白的费用远低于昂贵的抗体免疫沉淀法；可应用于蛋白泛素化的基础研究及医疗诊断化验中的泛素化蛋白的测定。