双链DNA

摘要： 富G碱基的DNA序列在离子诱导下可形成G-四链体(G4),基于这一构型转化设计了大量的传感检测平台。其中的荧光检测平台是基于G4与荧光小分子的相互作用。但是,G4与荧光小分子的有效结合依赖于G4构型和体系中存在的离子种类和离子浓度,尤其是高Na^(+)浓度(140 mmol·L^(-1))。那么如何实现G4与荧光小分子普适性地有效结合,并不依赖于体系中的Na^(+)和Na^(+)浓度,是一个难题。在本研究中,以最简单的富G DNA序列凝血酶适体链TBA(thrombin binding aptamer)为例,在3’端和5’端分别增加10个碱基(TBA-10 bp),K^(+)诱导TBA-10 bp形成K^(+)稳定TBA(K^(+)-TBA,G4)并衔接含有10个互补碱基对的双链DNA(K^(+)-TBA-10 bp)。相较于K^(+)-TBA,硫磺素T与K^(+)-TBA-10 bp结合后的荧光强度增加了100倍,相互作用强度增加了1000倍,而且与体系中的Na^(+)(5–140 mmol·L^(-1))无关。结合荧光光谱,紫外吸收光谱和圆二色光谱发现硫磺素T特异性的嵌合于K^(+)-TBA和双链DNA衔接处的空腔内。有趣的是,这一结合模式不受G4构型的影响。该研究结果为研究G4与荧光小分子的有效结合提供了新视角,也为拓展G4在生物功能和生化检测领域的应用提供了实验依据。

摘要： 重组酶聚合酶扩增技术(Recombinase polymerase amplification,RPA)是近年来兴起的一种等温核酸扩增技术。RPA引物探针设计要求简单,能在31°C-42°C的温度实现扩增,利用重组酶与引物结合并寻找与引物互补的同源序列,解锁局部双链DNA,不需要对模板高温变性,20-30分钟可获得大量扩增产物。

摘要： 大多数感音神经性聋与基因突变相关(Morton等,2006),基因靶向治疗似乎是一种更精确的治疗方式。CrispR/cas9系统已经超越锌指或TALLEN成为基因编辑首选[1],但是会切除引导RNA配对的双链基因序列,剪切产生的双链DNA粘性断端诱导被编辑的细胞启动基因修复程序来修补这一缺损。然而诸如非同源断端连接或者同源基因引导修复均不能完美地将单碱基突变序列修复为野生型序列[2-5]。

摘要： 铜离子(Cu^(2+))是生物体内一种不可或缺的微量元素,其含量异常易引发严重疾病﹒本文利用阿霉素(Dox)嵌入双链DNA(dsDNA)产生聚集诱导荧光淬灭,构建了一种铜离子核酸荧光探针(Dox/ds DNA),并在芬顿试剂(H_(2)O_(2)+Cu^(2+))作用下产生羟基自由基(·OH)切断dsDNA,实现阿霉素的荧光恢复﹒研究结果表明:当固定(H_(2)O_(2))浓度为0.5 mmol/L、铜离子浓度为1.0~50 mol/L时,体系的荧光信号变化与铜离子浓度呈现良好的线性关系,此时检测限为0.3 mol/L;该探针具有响应速率快(<100 s)、选择性好和灵敏度高的优势.

摘要： mRNA,即Messenger RNA(信使核糖核酸),是把遗传信息从DNA传递到蛋白质的信使。通俗来讲,mRNA复制了细胞核中双链DNA的一条链的遗传信息,随即离开细胞核在细胞质中生成蛋白质。在细胞质中,核糖体沿着mRNA移动,读取其碱基序列,并翻译成其相应的氨基酸,最终形成蛋白质(如图1)。

摘要： 非洲猪瘟病毒是一种多层包被结构,具双链DNA的大型正二十面体病毒,径长约250-260纳米,由基因组、核壳、内层衣壳和外层衣壳组成,含有至少160个基因和超过160种蛋白(目前仅鉴定5个,剩余未标注)。其精巧的结构像一个“俄罗斯套娃”,即像俄罗斯套娃一样层层嵌套,外层衣壳保护着内层蛋白和核酸结构。

摘要： 传染性软疣(molluscum contagiosum,MC)是由痘病毒家族的双链DNA传染性软疣病毒(molluscum contagio-sum virus,MCV)感染所致的常见良性传染性皮肤病[1]。MCV属痘病毒,目前已发现4型及若干亚型,但以MCV-1型最常见[1]。MC是世界上50种常见疾病之一[2],MC的传播是通过人与人之间皮肤的直接接触、间接接触和自我接种进行传播。病毒潜伏期为1周~6个月不等,通常为2~6周。

摘要： 暴露于自由基或亲电试剂下的DNA 容易产生双链断裂和碱基损伤，这些损 伤与生物体机能的衰老以及癌症等疾病密切相关。8-OxodG 作为DNA 氧化损伤的一种主要产物，对其定量检测常常是判断一个细胞癌化状态和DNA 氧化胁迫的指标。当前对8-OxodG的检测主要是通过质谱和免疫荧光等方法，而这些方 法具有仪器设备昂贵、前处理过程复杂、费时费力等缺点。因此，发展一些简便、 快速、特异性的DNA 损伤检测方法是非常有必要的。

摘要： 暴露于自由基或亲电试剂下的DNA 容易产生双链断裂和碱基损伤，这些损 伤与生物体机能的衰老以及癌症等疾病密切相关。8-OxodG 作为DNA 氧化损伤的一种主要产物，对其定量检测常常是判断一个细胞癌化状态和DNA 氧化胁迫的指标。当前对8-OxodG的检测主要是通过质谱和免疫荧光等方法，而这些方 法具有仪器设备昂贵、前处理过程复杂、费时费力等缺点。因此，发展一些简便、 快速、特异性的DNA 损伤检测方法是非常有必要的。

摘要： 暴露于自由基或亲电试剂下的DNA 容易产生双链断裂和碱基损伤，这些损 伤与生物体机能的衰老以及癌症等疾病密切相关。8-OxodG 作为DNA 氧化损伤的一种主要产物，对其定量检测常常是判断一个细胞癌化状态和DNA 氧化胁迫的指标。当前对8-OxodG的检测主要是通过质谱和免疫荧光等方法，而这些方 法具有仪器设备昂贵、前处理过程复杂、费时费力等缺点。因此，发展一些简便、 快速、特异性的DNA 损伤检测方法是非常有必要的。

摘要： DNA 因其高度专一性而成为重要的识别单元，并广泛用于基因检测[1]；适 配子的发现使DNA 识别对象扩展到蛋白、小分子、甚至无机离子[2]。电化学发 光（ECL）兼具有电化学的微型化、智能化和集成化及化学发光的高灵敏等优点， 广泛应用于传感领域[3, 4]。近期，我们利用Ru(phen)3 2+可以稳定嵌入到双链DNA的特性构筑了系列高灵敏的ECL 传感技术。

摘要： DNA 因其高度专一性而成为重要的识别单元，并广泛用于基因检测[1]；适 配子的发现使DNA 识别对象扩展到蛋白、小分子、甚至无机离子[2]。电化学发 光（ECL）兼具有电化学的微型化、智能化和集成化及化学发光的高灵敏等优点， 广泛应用于传感领域[3, 4]。近期，我们利用Ru(phen)3 2+可以稳定嵌入到双链DNA的特性构筑了系列高灵敏的ECL 传感技术。

摘要： DNA 因其高度专一性而成为重要的识别单元，并广泛用于基因检测[1]；适 配子的发现使DNA 识别对象扩展到蛋白、小分子、甚至无机离子[2]。电化学发 光（ECL）兼具有电化学的微型化、智能化和集成化及化学发光的高灵敏等优点， 广泛应用于传感领域[3, 4]。近期，我们利用Ru(phen)3 2+可以稳定嵌入到双链DNA的特性构筑了系列高灵敏的ECL 传感技术。

摘要： 一直以来，DNA与金属离子之间的相互作用受到人们的广泛关注，并被广泛用于分子 水平逻辑门的构建、金属离子的高灵敏检测和DNA功能化的调控[1]。由于金属离子调控形成的双链DNA (M-dsDNA )具有与正常dsDNA相似的二级结构，人们尝试研究并证明M-dsDNA 在其相应的金属离子存在的条件下，具有与正常dsDNA相似的催化、复制等功能。例如， Dong等报道Ag+调控的DNAzyme只有在形成C–Ag+–C碱基对的的条件下，才具有催化活性， 并实现了对Ag+高灵敏检测[2]。Park等证明DNA聚合酶可识别引物3'端的末端碱基T(C)与模 板DNA的末端碱基T(C)形成的T–Hg2+–T (C–Ag+–C)碱基对，实现了引物的生长[3]。

摘要： 一直以来，DNA与金属离子之间的相互作用受到人们的广泛关注，并被广泛用于分子 水平逻辑门的构建、金属离子的高灵敏检测和DNA功能化的调控[1]。由于金属离子调控形成的双链DNA (M-dsDNA )具有与正常dsDNA相似的二级结构，人们尝试研究并证明M-dsDNA 在其相应的金属离子存在的条件下，具有与正常dsDNA相似的催化、复制等功能。例如， Dong等报道Ag+调控的DNAzyme只有在形成C–Ag+–C碱基对的的条件下，才具有催化活性， 并实现了对Ag+高灵敏检测[2]。Park等证明DNA聚合酶可识别引物3'端的末端碱基T(C)与模 板DNA的末端碱基T(C)形成的T–Hg2+–T (C–Ag+–C)碱基对，实现了引物的生长[3]。

摘要： 一直以来，DNA与金属离子之间的相互作用受到人们的广泛关注，并被广泛用于分子 水平逻辑门的构建、金属离子的高灵敏检测和DNA功能化的调控[1]。由于金属离子调控形成的双链DNA (M-dsDNA )具有与正常dsDNA相似的二级结构，人们尝试研究并证明M-dsDNA 在其相应的金属离子存在的条件下，具有与正常dsDNA相似的催化、复制等功能。例如， Dong等报道Ag+调控的DNAzyme只有在形成C–Ag+–C碱基对的的条件下，才具有催化活性， 并实现了对Ag+高灵敏检测[2]。Park等证明DNA聚合酶可识别引物3'端的末端碱基T(C)与模 板DNA的末端碱基T(C)形成的T–Hg2+–T (C–Ag+–C)碱基对，实现了引物的生长[3]。

摘要： 一直以来，DNA与金属离子之间的相互作用受到人们的广泛关注，并被广泛用于分子 水平逻辑门的构建、金属离子的高灵敏检测和DNA功能化的调控[1]。由于金属离子调控形成的双链DNA (M-dsDNA )具有与正常dsDNA相似的二级结构，人们尝试研究并证明M-dsDNA 在其相应的金属离子存在的条件下，具有与正常dsDNA相似的催化、复制等功能。例如， Dong等报道Ag+调控的DNAzyme只有在形成C–Ag+–C碱基对的的条件下，才具有催化活性， 并实现了对Ag+高灵敏检测[2]。Park等证明DNA聚合酶可识别引物3'端的末端碱基T(C)与模 板DNA的末端碱基T(C)形成的T–Hg2+–T (C–Ag+–C)碱基对，实现了引物的生长[3]。

摘要： 本发明公开了一种稳定双链DNA的方法，其包括如下步骤：将双链DNA保存于含有氧化石墨烯和金属离子的体系中；所述的金属离子为一价和/或二价金属离子。本发明还公开了与该方法相应的双链DNA稳定剂。本发明首次发现一价和/或二价金属离子可促使氧化石墨烯与双链DNA结合，从而有效的减弱或消除非限制性内切酶、外切酶以及限制性内切酶等多种生物酶对双链DNA的酶切作用。与其他稳定双链DNA的方法比较，本发明的双链DNA稳定方法及稳定剂不需要如硅纳米颗粒或者硅纳米管等特殊的修饰，且水溶性和分散性更好，成本廉价，原料制备工艺成熟，可在需增强双链DNA稳定性的各种生物实验体系得到广泛应用。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，提供一种等温解开双链DNA的方法以及基于该方法制备单链DNA的方法。等温解开双链DNA的技术方案为利用重组酶结合单链DNA探针形成复合物，复合物识别双链DNA中与单链DNA探针同源的序列并侵入双链DNA，从而实现双链DNA的等温开链，随后单链DNA探针和双链中一条链互补配对，而单链结合蛋白结合另一条链稳定开链结构。基于该方案及单链DNA探针3’‑末端可以被连接酶和聚合酶等酶识别的特性，本发明还提出了制备单链DNA的方案，并详细介绍了通过连接酶或延伸酶制备单链DNA的方案。以上技术方案均可在等温条件下完成，且无需ATP循环系统，甚至ATP可被dATP替代，所用酶来源广泛、易于获得，为等温技术以双链DNA作为研究对象提供了一个通用平台。

摘要： 本发明属于DNA编码化合物库合成技术领域，主要涉及一种DNA单双链可控转化的DNA编码化合物库合成方法，包括如下步骤：通过构建可逆共价的起始片段用于DNA编码化合物库的合成，实现双链DNA编码化合物库与单链DNA编码化合物库的可控转化；将DNA编码化合物库与多种筛选体系兼容扩大编码化合物库的靶标筛选范围；将单链DNA编码化合物库进行动态组合化合物库的构建，并利用可逆交联基团将动态结构进行平衡锁定；将单链DNA编码化合物库与其它单链化合物库进行组合，进行自组装多药效团库的构建；通过DNA杂交与共价交联将单链DNA编码化合物库与功能化合物DNA偶合物进行结合。本发明方法可实现DNA编码化合物库单双链多次转化，提高了化合物库合成、筛选、应用的灵活性。

摘要： 本发明为一种引物，该引物用于核酸的扩增，具有下述式(1)所示的结构。(这里，B表示碱基，R1表示分解性保护基，R2表示氢或羟基。＊是指与相邻的核苷酸的糖的键。)。本发明还为一种双链DNA的制造装置，具备：具有式(1)所示的结构的正向引物和反向引物；PCR装置，以模板DNA为模板进行多个循环的PCR，生成3’末端凹陷的双链DNA；以及光照射设备，将R1脱保护以形成3’末端突出的粘附末端。

摘要： 本发明提供一种引物，该引物用于核酸的扩增，具有下述式(1)所示的结构。(这里，A1表示－S－、－S－S－或－Se－，B表示碱基，R1表示分解性保护基。＊是指与相邻的核苷酸的糖的键。)。本发明还提供一种双链DNA的制造装置，具备：具有式(1)所示的结构的正向引物和反向引物；PCR装置，以模板DNA为模板进行多个循环的PCR，生成3’末端凹陷的双链DNA；使3’末端成为平滑末端的克列诺片段；以及光照射设备，将R1脱保护以形成3’末端突出的粘附末端。

摘要： 本发明涉及线性双链DNA，其在其非编码链的3'末端偶联到单个支持物或标签，以及制备所述线性双链DNA的方法。本发明还涉及所述线性双链DNA在RNA体外转录反应中的用途，并且还涉及体外制备RNA的方法。本发明还涉及用于RNA体外转录的生物反应器。

摘要： 本发明公开了一种稳定双链DNA的方法，其包括如下步骤：将双链DNA保存于含有氧化石墨烯和金属离子的体系中；所述的金属离子为一价和/或二价金属离子。本发明还公开了与该方法相应的双链DNA稳定剂。本发明首次发现一价和/或二价金属离子可促使氧化石墨烯与双链DNA结合，从而有效的减弱或消除非限制性内切酶、外切酶以及限制性内切酶等多种生物酶对双链DNA的酶切作用。与其他稳定双链DNA的方法比较，本发明的双链DNA稳定方法及稳定剂不需要如硅纳米颗粒或者硅纳米管等特殊的修饰，且水溶性和分散性更好，成本廉价，原料制备工艺成熟，可在需增强双链DNA稳定性的各种生物实验体系得到广泛应用。

摘要： 本发明涉及一种双链DNA抗原的制备方法和检测人血清抗双链DNA抗体的试剂盒。具体而言，本发明提供了一种用于诊断系统性红斑狼疮检测用双链DNA抗原的制备和人血清抗双链DNA抗体体外检测试剂盒的制备方法。通过该方法获得的抗原成本低廉并具有稳定可靠的抗原性能，对于体外检测系统性红斑狼疮患者血清中的抗双链DNA抗体具有很高的敏感性和特异性。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，提供一种等温解开双链DNA的方法以及基于该方法制备单链DNA的方法。等温解开双链DNA的技术方案为利用重组酶结合单链DNA探针形成复合物，复合物识别双链DNA中与单链DNA探针同源的序列并侵入双链DNA，从而实现双链DNA的等温开链，随后单链DNA探针和双链中一条链互补配对，而单链结合蛋白结合另一条链稳定开链结构。基于该方案及单链DNA探针3’‑末端可以被连接酶和聚合酶等酶识别的特性，本发明还提出了制备单链DNA的方案，并详细介绍了通过连接酶或延伸酶制备单链DNA的方案。以上技术方案均可在等温条件下完成，且无需ATP循环系统，甚至ATP可被dATP替代，所用酶来源广泛、易于获得，为等温技术以双链DNA作为研究对象提供了一个通用平台。

摘要： 本发明涉及具有高特异性的巢式PCR。本发明提供扩增目的序列1的方法，该方法可高效扩增单链目的序列，以及可显著抑制非特异性扩增。本发明的一实施方式中，在巢式PCR的第2阶段，混合与外侧正向引物(4of)互补、且不会为所述DNA聚合酶引发的DNA延伸反应提供起点的外侧正向封闭核酸(4ofb)。