基因诊断

摘要： 目的 探讨以主成分分析(principal component analysis,PCA)法分析口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)数据库构建的OSCC诊断模型的价值,为临床诊疗提供参考.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中获取OSCC和正常对照样本的RNA-seq表达数据,通过R软件对表达数据进行归一化和差异表达分析,以筛选出DEGs,并同时对DEGs行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,以发现主要生物学特征.随机选取RNA-seq中DEGs表达数据的70％作为训练集以及30％作为测试集后,应用PCA法对训练集数据进行分析,提取与诊断OSCC相关的主成分(principal compo-nents,PC)构建PCA模型,再分别绘制训练集和测试集PCA模型的受试者工作特征(receiver operating characteris-tic,ROC)曲线并计算曲线下面积(area under curve,AUC),以评估PCA模型对OSCC诊断的准确性.结果 从TCGA数据库中获取OSCC和正常对照样本的RNA-seq表达数据分别为330例、32例.以错误发现率(false discovery rate,FDR)4为阈值,共筛选出159个下调和248个上调DEGs,主要富集在中间纤维、黑素体膜等细胞成分,以及色素和唾液相关的生物过程;主要参与唾液分泌、酪氨酸代谢等通路(P.adjust<0.05和Q<0.05).将DEGs拟作为诊断OSCC的肿瘤标志物,对训练集行PCA分析显示,主成分前3位PC1、PC2、PC3方差的贡献率分别为0.873、0.100、0.023,三者累计方差的贡献率为0.996,主成分前3位PC1、PC2、PC3包含颌下腺雄激素调节蛋白3B(submaxillary gland androgen regulated protein 3B,SMR3B)、富含脯氨酸27(proline rich 27,PRR27)、组蛋白3(histatin 3,HTN3)、抗凝素(statherin,STATH)、胱抑素D(cys-tatin D,CST5)、包含A族成员2的BPI折叠(BPI fold containing family A member 2,BPIFA2)、富含脯氨酸的蛋白质HaeⅢ亚家族2(proline rich protein HaeⅢsubfamily 2,PRH2)、角蛋白35(keratin 35,KRT35)、组蛋白1(histatin 1,HTN1)、淀粉酶α1B(amylase alpha 1B,AMY1B).进一步结合三者的特征向量构建OSCC的PCA诊断模型,在训练集和测试集ROC曲线中显示该模型的AUC值分别为0.852、0.844,均高于其他基因.结论 基于PCA法和DEGs构建的以SMR3B、PRR27、HTN3、STATH、CST5、BPIFA2、PRH2、KRT35、HTN1和AMY1B表达水平为基础的OSCC诊断模型有较高的诊断优势,可为OSCC的早期基因诊断以及PCA模型在临床诊断中的应用提供理论依据.

摘要： 目的分析X连锁慢性肉芽肿病(X⁃CGD)的临床特征与实验室诊断方法。方法分析郑州大学附属儿童医院河南省儿童医院血液肿瘤科2015年10月至2019年5月间收治的11例X⁃CGD患者的临床资料,对患者与家系成员进行中粒细胞呼吸爆发及基因检查。结果患者中性粒细胞呼吸爆发试验显示中性粒细胞活化率均<10%,其中6例患者母亲及3例患者姐姐呈现双峰表型;所有患者经Sanger测序均显示为CYBB基因突变,其中5例为自发突变、6例为X连锁突变;家系分析显示CYBB基因突变来自母亲,由母亲X染色体遗传,其中女儿为携带者,男性多发病;随访结果显示控制感染可延长存活,造血干细胞移植治疗可恢复中性粒细胞呼吸爆发功能。结论X连锁慢性肉芽肿病临床起病早,反复感染常见;可采用流式细胞术行中性粒细胞呼吸爆发实验有助于疾病的快速筛查,但临床确诊仍依赖基因诊断,同时基因诊断有助于明确患者家系成员基因型,明确遗传方式,为遗传咨询及产前诊断提供依据。

摘要： 子宫内膜是否具有容受性是胚胎着床成功与否的关键因素之一。为了把握这个时机获得更高的胚胎移植成功率,必须寻找一个准确高效的手段来验证它。随着基因检测技术的进步,FOXA2已经被证实为是子宫内膜容受性相关基因,其主要通过激活E-钙黏着蛋白(E-CDH1),募集糖皮质激素受体(GR),促进白血病抑制因子(LIF)分泌等机制来提高子宫内膜容受性。而FOXA2表达又可以被孕激素、Dlx5和Dlx6、Wnt信号通路激活,被雌激素抑制。FOXA2可能成为子宫内膜容受性的标志基因和治疗子宫内膜容受性相关疾病的新靶点。本文就FOXA2结构作用以及其影响子宫内膜容受性的上下游机制进行综述。

摘要： 目的 随着人口老龄化的加剧,老年性耳聋(AHL)的发病率逐渐增加,严重影响了老年人的社会交往和生活质量。长链非编码RNA(lncRNA)在多种年龄相关性疾病起着关键作用。其中,lncRNA在AHL中的重要性引起了人们的广泛关注。本文将对可能参与AHL发病的lncRNA进行综述。方法 在Pubmed, Science,中国知网数据库搜索AHL与lncRNA相关文献并进行分析、归纳、总结。结果 本文共引用了49篇文献,发现AHL病因复杂多样,其中遗传、噪声、疾病因素与lncRNA密切相关。结论 虽然现在已经发现很多AHL相关基因,但lncRNA与AHL的研究仍在起步阶段,研究lncRNA在AHL的发生发展中的作用在AHL防治上有广阔前景。

摘要： 目的:研究产前基因诊断联合健康教育知信行模式在降低地中海贫血患儿出生率中的应用效果。方法:选取我院2020年6月至2021年6月到我院进行地中海贫血筛查的120例孕妇作为观察组,进行产前基因诊断联合健康教育知信行模式护理。另选择2021年6月之前到我院进行地中海贫血筛查的200例孕妇作为对照组,进行常规产检,对比两组地中海贫血患儿出生率、孕妇疾病掌握情况以及护理满意率。结果:观察组地中海贫血患儿出生率显著低于对照组(P<0.05)。观察组孕妇知识掌握率高于对照组(P<0.05)。观察组护理满意率高于对照组(P<0.05)。结论:产前基因诊断联合健康教育知信行模式可有效降低地中海贫血患儿出生率,提升孕妇对于疾病知识了解程度,可更好地做好预防。

摘要： 目的建立阶梯式耳聋基因诊断策略,应用于临床诊疗实践,以提高诊断效率、降低检测成本改善病人管理。方法选取2017年1月至2020年12月广东省妇幼保健院医学遗传中心226例耳聋患者进行基因诊断。阶梯式诊断策略第一阶梯采用微阵列芯片法对受检者进行GJB2、GJB3、SLC26A4及线粒体DNA 12S NrRA基因上中国人群耳聋基因变异热点检测。第二阶梯基因诊断采用Sanger测序法对受检者进行GJB2、SLC26A4等中国人群中较常见的耳聋基因测序。第三阶梯基因诊断采用全外显子测序法,主要用于第一、二阶梯未检出或检出结果不能解释表型的耳聋病患,但对于有急切产前诊断需求等检测时间窗较短的耳聋患者可直接接受高通量测序检测。结果第一阶梯基因检测为14例病患明确分子诊断(诊断率8.5%),第二阶梯基因检测为24例病患明确分子诊断(诊断率15.9%),第三阶梯基因检测额外提高了32.4%的诊断率。而在选择直接接受全外显子组测序检测的人群中诊断率为44.3%。结论本研究建立了一种阶梯式耳聋基因诊断策略,并将其应用于临床诊疗,实践效果显示分层递进式检测更为经济。但对于部分检测时间窗较短的耳聋患者,直接行高通量测序检测,效率更高。明确耳聋患者分子诊断有助于提高病人管理、改善患者预后、规范遗传咨询及再发风险评估。

摘要： 非编码RNA(ncRNA)是指不编码蛋白质的片段RNA,包括“管家”非编码RNA、小RNA和长非编码RNA等,其参与了生物个体的发育与分化、生殖、细胞凋亡和细胞重编程等,且其失控能促进恶性肿瘤的发展。血液肿瘤包括各类白血病、恶性淋巴瘤、多发性骨髓瘤以及骨髓增殖性肿瘤等,其发生发展以及预后与机体的免疫系统功能密切。相关研究发现ncRNA(如miRNA和lncRNA)参与了T细胞发育的不同步骤并调控T细胞的增殖和凋亡。本文将对近几年国内外学者在血液性肿瘤T细胞免疫功能相关的非编码RNA进行总结,为今后对血液性肿瘤疾病的检测及治疗提供一些新思路。

摘要： 假肥大型肌营养不良[杜氏进行性肌营养不良(DMD)/贝氏进行性肌营养不良(BMD)]是最常见的X连锁隐性遗传性肌肉系统疾病,临床特征为进行性加重的对称性肌无力、肌萎缩和小腿腓肠肌假性肥大。DMD预后差,目前尚无治愈方法。抗肌萎缩蛋白基因(DMD基因)为致病基因,DMD基因庞大,突变类型多样,近年来DMD基因突变的检测技术已取得了一定的进展。本文就DMD基因诊断技术进展作一综述。

摘要： 单基因糖尿病(Monogenic diabetes,MD)是胰岛β细胞发育、功能发挥或胰岛素信号通路中单个基因或突变异常导致的疾病,是一种特殊类型的糖尿病[1],约占糖尿病患者的1-2%,占儿童糖尿病的1-6%[2]。然而目前单基因糖尿病的诊断仍未得到充分认识,SEARCH研究还发现只有6%的MODY患者被正确诊断[3]。在最近的一项针对50年或更长时间的1型糖尿病患者随访的研究中[4],有27.5%的患者具有单基因突变,其中7.9%被归类为“可能致病”。在对2型糖尿病患者的临床治疗中发现,其中单基因糖尿病的患病率为4.5%[5]。据估计目前约90%的MD病例仍被误诊为1型或2型糖尿病,约70%患者没有得到正确有效的治疗[6]。根据我国的一项大规模调查,在40岁以下的成年人中,报告患有糖尿病和前驱糖尿病的成年人比例分别为5.7%和44%[7]。

摘要： 目的介绍广西南宁市地中海贫血(地贫)预防控制服务网络,并探讨其应用效果。方法总结广西南宁市地贫预防控制服务网络的构建方法和服务流程。选择2017年1月1日至2019年12月31日在南宁市辖区进行婚前医学检查和立卡建档产检的夫妇为研究对象,利用《桂妇儿信息管理系统》收集其地贫筛查、地贫基因诊断、产前诊断、妊娠结局、医学干预等个案信息,并进行相关指标的统计和分析。结果2017~2019年,婚检人群的地贫筛查率为99.83%、婚检双阳夫妇的地贫基因诊断率为91.39%,产检孕妇的地贫筛查率为97.13%、孕阳丈夫的地贫筛查率为88.91%、孕期双阳夫妇的地贫基因诊断率为90.05%,可能生育重型地贫胎儿的高风险孕妇产前诊断率为92.52%,且上述指标均呈逐年上升趋势。2017~2019年,共阻断704例重型地贫儿出生,终止妊娠率为98.60%。结论2017~2019年南宁市地贫防控取得了显著成效,婚检人群和产检人群的地贫筛查率和地贫基因诊断率、可能生育重型地贫胎儿的高风险孕妇产前诊断率均较高且呈逐年升高趋势,重型地贫胎儿的医学干预率也保持在较高的水平。通过实施地贫防治计划,有效减少了重型地贫胎儿的出生。

摘要： 脊髓小脑性共济失调(SCA)是一类以平衡障碍为特征的常染色体显性遗传,属于单基因神经系统变性疾病.探究脊髓小脑性共济失调2型一俄罗斯族家系的临床特征和基因诊断方法,并对家系成员及患者进行基因分析,同时做出基因诊断.

摘要： 目的：对少见单基因皮肤病进行基因诊断;方法：通过直接测序法对少见单基因皮肤病进行致病性突变检测;结果：在毛发上皮瘤、黑斑息肉综合征、遗传性对称性色素异常症、家族性慢性良性天疱疮、念珠状发、结节性硬化症、遗传性肠病性肢端皮炎、色素失禁症中发现错义突变6例、移码突变4例、无义突变3例、剪切位点突变2例、大片段缺失1例;结论：基因诊断是少见单基因皮肤病精准诊断的基础.

摘要： 孤立性纤维性肿瘤(solitary fibrous tumor,SFT)是一种少见的间叶组织来源肿瘤,它起源于CD34树突状间叶细胞,发生部位广泛,可发生在身体各部位,多数为良性,约10％的病例表现为侵袭性.根据组织学特征和CD34表达能够对大多数SFT病例做出准确诊断,但SFT组织学的多样性、偶尔出现意外的免疫表型可能对诊断造成困难.分子分析发现大多数良恶性SFTs均存在特异性NAB2-STAT6融合基因,但基因检测需要专门的设备,花费较高.文章分别讲述病理学CD34与基因检测NAB2-STAT6融合基因在孤立性纤维瘤诊断中的价值和意义.

摘要： 自身炎症性疾病是一组固有免疫缺陷导致的以反复发热、急性关节炎和急性期蛋白增加为特征的复发性非侵袭性炎症性疾病.本研究对我院儿科2008年至今十年中临床疑诊自身炎症性疾病进行基因分析,明确诊断并总结临床特点、疾病谱类型.

摘要： 耐多药结核诊断率低，耐多药肺结核的实验室诊断方法，结合传统诊断方法，分子诊断技术有效提高了结核病诊断的准确性，并为临床治疗提供了重要依据，表型检测同时GeneXpert检测——2小时决速诊断，更多的患者不易检出其传染性和耐药性(手术、穿刺)，外科医生在结核病术前和术后诊断检测意识薄弱，结核分子诊断学改变疾病的认知，术后的化疗方案优化基于术前、术后快速、精准基因检测。

摘要： 原发性远端肾小管性酸中毒(dRTA)是由参与尿液酸化的至少三种基因(SLC4A1、ATP6V1B1和ATP6V0A4)的功能缺失突变引起的一组临床综合征.生长迟缓是这些患儿的常见问题.该病具有遗传异质性，认识其基因突变，将有利于对该群体进行准确诊断、个体化干预和随访。总结分析3例dRTA患儿的临床资料及分子遗传学资料，提高对该病的认识。

摘要： 本文讲述了中毒急危重症精准医学概述，分析了中毒急危重症的精准基础研究，中毒急危重症的基因诊断，总结了中毒急危重症的精准治疗，百草枯中毒齐鲁方案最新研究进展。

摘要： 结核病是临床上发病率和死亡率均较高的全球性传染性疾病,可累及全身多个组织及器官,临床上以肺部感染最为常见.迅速准确的诊断是防控结核病传染的关键环节,同时也是临床有效治疗的基础.本文通过综述方式,探讨近年来结核病实验室诊断技术的发展、价值及意义.

摘要： 结核病是临床上发病率和死亡率均较高的全球性传染性疾病,可累及全身多个组织及器官,临床上以肺部感染最为常见.迅速准确的诊断是防控结核病传染的关键环节,同时也是临床有效治疗的基础.本文通过综述方式,探讨近年来结核病实验室诊断技术的发展、价值及意义.

摘要： 结核病是临床上发病率和死亡率均较高的全球性传染性疾病,可累及全身多个组织及器官,临床上以肺部感染最为常见.迅速准确的诊断是防控结核病传染的关键环节,同时也是临床有效治疗的基础.本文通过综述方式,探讨近年来结核病实验室诊断技术的发展、价值及意义.

摘要： 本发明公开了lncRNA组合物及制备诊断预示Luminal B型乳腺癌骨转移试剂盒的用途。本发明发现，血清lncRNAXLOC_004122、SUMO1P3和NBAT‑1可联合用于诊断预示Luminal A型乳腺癌骨转移，血清lncRNAXLOC_004122、Linc00467和lncRNAAl049452可联合用于诊断预示Luminal B型乳腺癌骨转移，血清lncRNAAK043773和EXOC7可联合用于诊断预示Her‑2过表达型乳腺癌骨转移，lncRNA Lnc01089和HOTAIR可联合用于诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移，准确度高(90％以上)，检测成本低、非介入性、方便快捷。

摘要： 本发明公开了甲基化基因组合物及制备诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移试剂盒的用途。本发明发现，血清甲基化PITX1和甲基化AMOT可联合用于诊断预示LuminalA型乳腺癌骨转移，血清甲基化PTPN1和甲基化SLIT2可联合用于诊断预示LuminalB型乳腺癌骨转移，血清甲基化MYLK2、甲基化EFEMP1和甲基化SOSTDC1可联合用于诊断预示Her‑2过表达型乳腺癌骨转移，血清甲基化MYLK3和甲基化SCARA5可联合用于诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移，准确度达90％以上，检测成本低、非介入性、方便快捷。

摘要： 本发明公开了甲基化基因组合物及制备诊断预示Luminal A型乳腺癌骨转移试剂盒的用途。本发明发现，血清甲基化PITX1和甲基化AMOT可联合用于诊断预示LuminalA型乳腺癌骨转移，血清甲基化PTPN1和甲基化SLIT2可联合用于诊断预示Luminal B型乳腺癌骨转移，血清甲基化MYLK2、甲基化EFEMP1和甲基化SOSTDC1可联合用于诊断预示Her‑2过表达型乳腺癌骨转移，血清甲基化MYLK3和甲基化SCARA5可联合用于诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移，准确度达90％以上，检测成本低、非介入性、方便快捷。

摘要： 本发明公开了lncRNA组合物及制备诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移试剂盒的用途。本发明发现，血清lncRNAXLOC_004122、SUMO1P3和NBAT‑1可联合用于诊断预示Luminal A型乳腺癌骨转移，血清lncRNAXLOC_004122、Linc00467和lncRNAAl049452可联合用于诊断预示Luminal B型乳腺癌骨转移，血清lncRNAAK043773和EXOC7可联合用于诊断预示Her‑2过表达型乳腺癌骨转移，lncRNALnc01089和HOTAIR可联合用于诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移，准确度高(90％以上)，检测成本低、非介入性、方便快捷。

摘要： 本发明公开了lncRNA组合物及制备诊断预示Her‑2过表达型乳腺癌骨转移试剂盒的用途。本发明发现，血清lncRNAXLOC_004122、SUMO1P3和NBAT‑1可联合用于诊断预示LuminalA型乳腺癌骨转移，血清lncRNAXLOC_004122、Linc00467和lncRNAAl049452可联合用于诊断预示Luminal B型乳腺癌骨转移，血清lncRNAAK043773和EXOC7可联合用于诊断预示Her‑2过表达型乳腺癌骨转移，lncRNA Lnc01089和HOTAIR可联合用于诊断预示三阴性型乳腺癌骨转移，准确度高(90％以上)，检测成本低、非介入性、方便快捷。

摘要： 通过给予内啡肽酶抑制剂或内啡肽酶抑制剂和选择性地一种多巴胺前体或者一种5－羟色胺前体、一种GABA前体或者一种内啡肽或内啡肽酶释放剂或者包括Rhodiola rosea提取物(Pharmaline)和/或石杉碱的某些草药化合物获得了注意力过程的加强。这些成分促进正常神经递质功能的恢复而且联合的成分提高多巴胺在伏核处的释放,而且是非成瘾性的。利用多巴胺前体L－苯丙氨酸、或L－酪氨酸、内啡肽酶抑制剂D－苯丙氨酸、和/或5－羟色胺前体5－羟色氨酸以及天然的乙酰胆碱酯酶抑制剂和铬盐(如吡啶甲酸盐、烟酸盐等)特别优选地,但并不限于,帮助缓解与大脑苯丙氨酸缺陷相关的症状。

摘要： 本发明公开了与眼皮肤白化病1型相关的突变后的TYR基因及其在基因诊断中的用途。本发明通过对一个4代眼皮肤白化病1型家系采集，判断其疾病在家系中为常染色体隐性遗传方式传递。通过阅读文献和在线数据库，选取可能致病的候选基因，然后对先证者及家系其他成员进行PCR扩增和Sanger测序，确认突变基因位点。其中发现TYR致病基因突变c.107G>C为一种新的致病性突变。该新的TYR致病基因突变位点的发现，丰富了致病基因突变谱，可以作为眼皮肤白化病1型这种严重的隐性遗传病的产前诊断筛查位点，用于群体的优生优育的指导。本发明的提出为开发针对该突变类型的产前诊断性芯片的设计提供了数据支持，尤其对严重危害的罕见遗传病的产前基因诊断筛查具有重要意义。

摘要： 本发明公开了与眼皮肤白化病1型相关的突变后的TYR基因及其在基因诊断中的用途。本发明通过对一个4代眼皮肤白化病1型家系采集，判断其疾病在家系中为常染色体隐性遗传方式传递。通过阅读文献和在线数据库，选取可能致病的候选基因，然后对先证者及家系其他成员进行PCR扩增和Sanger测序，确认突变基因位点。其中发现TYR致病基因突变c.107G>C为一种新的致病性突变。该新的TYR致病基因突变位点的发现，丰富了致病基因突变谱，可以作为眼皮肤白化病1型这种严重的隐性遗传病的产前诊断筛查位点，用于群体的优生优育的指导。本发明的提出为开发针对该突变类型的产前诊断性芯片的设计提供了数据支持，尤其对严重危害的罕见遗传病的产前基因诊断筛查具有重要意义。

摘要： 本发明涉及高原病高危人群的基因筛查方法及其相关基因诊断产品。本发明提供通过检测解偶联蛋白基因的-866A/G、45bpI/D和转铁蛋白基因的-740G/A、-552G/A和-35T/G的核苷酸类型对高原肺水肿高危人群进行基因筛查的方法。本发明还提供了检测发生高原肺水肿危险性的组合物、基因芯片、试剂盒等。本发明的方法、组合物、基因芯片、试剂盒等特异性高，应用范围广泛。

摘要： 本发明公开了肿瘤基因诊断标志物、诊断试剂盒。本发明发现，LINC02154与miR‑3147联合用于原发性肝癌的诊断具有较高的准确率，显著优于LINC02154或miR‑3147单独用于原发性肝癌诊断的诊断准确率。因此，二者可以联合用于制备原发性肝癌诊断的血清检测试剂盒。