微生物生态学

摘要： 学习微生物生态学课程有助于生态学专业本科生形成以解决生态环境问题为核心任务的科学研究思维。文章从该门课程在生态学专业本科生培养目标中的作用和重要性两个方面阐述锻炼科研思维的重要性。无法产生“联系”是制约在该门课程中培养本科生形成科研创新思维的因素。文章强调,加强该门课程与其他课程内容的联系和加强互动教学是培养生态学专业本科生创新科研思维的有效方式,且该方式对培养西华师范大学第二届生态学专业本科生科研创新思维成效显著。研究结果可以激发生态专业本科生科研兴趣,为社会培养符合生态文明建设要求的高质量人才。

摘要： 填埋场是世界范围内广泛使用的城市固体废弃物管理工具,而微生物则是填埋场固体废弃物生物降解的核心。文章讨论了填埋场微生物学的研究发展,重点介绍了填埋场微生物分类学、多样性及功能,以及其对环境生态因素的响应。分析城市固废填埋场微生物群落功能多样性以及影响生物降解的关键因素,对提高城市固废填埋场作为废弃物管理工具效率具有重要意义,有利于更好的将城市固体废弃物作为生物资源加以利用。

摘要： 哺乳仔猪胃肠道的生长和发育直接影响仔猪的成活率,而仔猪的成活率是决定养猪业生产效率的主要因素.为探究不同日龄八眉仔猪(Sus scrofa)肠道微生物群落的发展,分别收集八眉哺乳仔猪出生1～3 d初乳(colostrum,COL)和8～10 d常乳(ordinary milk,ORD)粪便样品,所有仔猪在相同条件下生长并且健康.使用二代Illumina HiSeq2500测序方法对16S rRNA V3+V4高变区进行微生物数据分析.乳酸杆菌属(Lactobacillus)和梭杆菌属(Fusobacterium)1～3 d的相对丰度显著高于8～10 d(P<0.05),乳汁摄入量在8～10 d显著高于1～3 d(P<0.05),乳汁摄入量与乳酸杆菌属和梭杆菌属的相对丰度均成强负相关(r<-0.6,P<0.01),KEGG功能预测发现环境适应途径、排泄系统途径、免疫系统途径、氨基酸代谢途径显著富集在8～10 d(P<0.05).本研究探讨仔猪早期的肠道菌群变化,为哺乳期仔猪饲养管理提供数据参考.

摘要： 为明确微生物菌剂拌土对玉米农田土壤细菌群落多样性的影响.对玉米农田土壤细菌的总DNA提取后,采用微生物多样性测序技术对玉米农田土壤细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了2种微生物菌剂拌土后玉米农田土壤细菌群落多样性和结构特征.微生物菌剂M1和M2拌土增加玉米农田土壤中全磷、硝态氮、有效磷和速效钾的含量;对玉米土壤细菌群落多样性有一定程度的影响,丰富度增加,多样性和均匀度降低,检测样本序列数量和细菌群落的OTU(operational taxonomic units)数量显著增加;对土壤细菌群落组成有影响,变形菌门(Proteobacteria)的丰度下降,放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)的丰度增加,优势菌属放线菌和芽孢杆菌的丰度增加;降低了土壤中引起人类疾病、参与细胞转化的微生物丰度,增加了参与代谢通路的微生物丰度.微生物菌剂拌土会影响玉米农田土壤细菌群落多样性和结构组成,改善土壤营养,增加有益微生物的丰度,进而改善玉米农田生态环境.

摘要： 火后生态恢复是21世纪恢复生态学的重要研究内容,土壤微生物作为森林生态系统的关键组成部分,开展火干扰下土壤微生物的研究是非常有必要的.本文通过综合分析现有文献对火后森林土壤微生物的研究结果,发现不同火强度和维持时间下土壤微生物活性、群落组成变化及影响火干扰强度的主要因素是已有研究的主要内容,在火后土壤微生物群落的恢复时间、多样性变化、演替规律等问题上尚存在争论,对火干扰下的土壤微生物研究的重要性也尚未得到足够重视.未来研究应在综合应用现有微生物研究技术并继续改进创新的基础上,采用野外调查和田间模拟控制实验相结合的手段,分别从种群、群落和生态系统等多个层次上开展火干扰下的森林土壤微生物研究,解析地下与地上生态系统的相互关系,探究土壤微生物在火干扰下的变化规律和演替机制,丰富火生态学理论;确定火后土壤微生物恢复中的功能类群,分析功能类群在火后恢复过程中的作用,比较分析不同恢复方式下土壤微生物的变化规律,以指导火后生态系统的恢复实践.

摘要： 为进一步了解和明确土壤微生物多样性的全球现状和研究热点,基于Web of Science全数据库对1999-2019年土壤微生物多样性领域的所有文献进行计量学分析,利用VOSviewer分析关键词热点分布,探讨此领域的研究热点以及未来的发展趋势.结果表明:在世界范围内发文量总体呈逐年上升趋势,美国的发文量第一,中国的发文量次之;中国科研机构发文量第一,法国次之;其中中国科学院产出的文章总数最多,对我国土壤微生物多样性的贡献最大;来自美国密歇根大学的学者Kozich,JamesJ的文章被引用次数最多.

摘要： 生态文明建设和国家工程教育专业认证的要求下,对《微生物生态学》的教学提出了更高的要求,也对本科学生所要求掌握的知识内容有了更宽、更深以及与应用相结合的要求.在生物信息学和测序技术快速发展的世代,《微生物生态学》有了新的内涵、宽度和深度,而现有并没有形成关于二代和三代测序技术条件下微生物生态学知识的教学体系,该文就国家工程专业知识认证背景下《微生物生态学》的教学改革和提升进行了探讨.

摘要： 微生物是地球上生命的主体之一,拥有极为丰富多彩的代谢途径,在很大程度上塑造了使人类宜居的地球.由于绝大部分环境中的微生物无法被分离和培养,微生物被喻为生命物质中的“暗物质”.近年来,迅猛发展的基因组学技术有力地推动了微生物“暗物质”的研究,使我国微生物生态学科发展从“诞生期”和“启蒙期”跨越式发展到“暴发期”,乐观预测未来可能进入一个具有鲜明特色的“领航期”.

摘要： 面对物种数量繁多、生态分布广泛、生态功能强大的微生物资源,微生物生态学的任务一方面在于不断发现和认识这类生命“暗物质”及其存在机制,另一方面要充分挖掘和利用这些微生物资源.微生物生态学的应用从最早的混合发酵发展到极端微生物资源利用、微生物生态制剂开发逐渐拓展到合成微生物生态等多个领域.2019年10月在湖南省长沙市举行的“中国生态学学会微生物生态专业委员会学术年会”设立了3个与微生物生态学应用相关的分会场,本期《微生物学通报》也开辟了“人工生态系统微生物”栏目,凸显了我国微生物生态学在资源、能源和环境等应用领域的成果,让我们看到了其成为社会与经济“绿色高效发展”重要驱动力的希望.

摘要： 本课题组选取了四种不同类型的湿地生态系统:钱塘江底泥沉积物、西溪湿地、下诸湖湿地和水稻田，对ANAMMOX和N-DAMO进行微生物生态学研究。采用16S rRNA和功能基因克隆文库构建、实时定量PCR技术，结合DOTUR和CANOCO生物统计软件，同位素活性示踪等方法研究了四个生境中ANAMMOX和N-DAMO反应的活性和贡献，以及参与两个反应的微生物种群多样性、种群数量、种群分布及影响的主要环境因子，以期探明这两类微生物在湿地系统中的生态分布特征、作用强度以及在湿地碳氮循环、温室气体减排和氮素污染修复中的作用。

摘要： 植物种子微生物生态学是研究与种子相联合的微生物的组成、功能、演替、它们之间关系及其与宿主之间相互关系的科学.种子中蕴含着丰富的微生物资源,它们对种子以及植物的健康具有重要的影响.不同种类植物种子联合的微生物群落由于受到种子本身及外界环境因素的影响而有所差异.本文论述了种子微生物生态学的概念、主要研究方法、种子微生物生态系统中的微生物种类、相关影响因素,以及种子微生物生态学研究的发展方向.种子微生物生态学的研究对生产实践有重要意义;同时也将丰富种子生物学的内容,对种子科学的发展起到促进作用.

摘要： 丛枝菌根真菌可以与植物根系组成互惠共生体,从而显著地增强宿主植物对矿质元素的吸收利用,促进植物的生长.芦笋(Asparagus officinalis L.)是一种多年生营养保健蔬菜,具有较高的菌根依赖性.本文从丛枝菌根真菌对芦笋的促生效应、侵染过程组织形态学、抗逆抗病性和微生物生态学四个方面综述了丛枝菌根真菌在芦笋上的应用研究进展.

摘要： 有毒有害微生物一直是引发食品安全问题的重点和难点所在。生物被膜(biofilm BF)是近些年才被发现的微生物在同态表面生存的一种生活方式。当微生物以被膜形式存在时,其生长模式、代谢状态和耐药性等将会发生显著变化,更加复杂和难以对付,危害性更大。本文已有文献及研究基础上,介绍不同生态环境中的生物被膜及其特点,着重讨论生物被膜在食品加工过程中的危害,并从生物被膜形成的环境、菌体自身等多角度出发探讨了环境对被膜形成的作用及被膜形成后对不良环境的耐受性等,提出基于生物安全性的食品机械安全性设计准则,旨防范和减少生物被膜的危害,提高食品安全性。

摘要： 分子生物学的发展为葡萄酒的生产和储存过程中微生物的群体分布带来了新的重大进展.例如,微生物菌种鉴定以大部分利用核糖体基因序列为基础的方法确定葡萄酒接种酵母和细菌种群来代替传统的方法.此外,非培养的分子方法现在能全面和迅速地鉴定葡萄酒中的微生物种群,其中包括目标微生物的定量,从而使生产商能够更好地在生产过程中作出相应的的决定,并且微生物基因组序列越来越多地应用于了解和利用发酵剂以及确定关键遗传因素对葡萄酒败坏的影响提供了较多新的方法.总的来说,分子生物学研究的发展从根本上改变了葡萄酒酿造过程中微生物的评价方法,并在葡萄汁转化为葡萄酒的过程中提供了新的见解.

摘要： 天然生物膜在水环境的净化过程中起着非常重要的作用.人造生物膜是以微生物生态学原理为指导、模拟天然生物膜的新型环保科技成果.本文报道了人造生物膜对蛋白质、淀粉等大分子的降解活性及对亚硝酸盐的转化作用,产品生产和剂型,在污染水体、养殖水体和水净化系统中的应用效果,以及人造生物膜在水环境治理中的优势及其广阔的应用前景.

摘要： 基因芯片(Microarray)技术于1991年首次在Science杂志上被提出,是生物芯片(Biochip)的一种.与传统的核酸检测技术相比,基因芯片技术用于环境微生物研究具有更多优势:DNA或寡核苷酸为基础的基因芯片技术是研究功能基因组学的有力工具,它允许研究者全面地研究不同条件下活细胞的生理学;基因芯片技术不需要知道保守序列,不同种群的同一功能组的所有多态性基因序列可以构建在芯片上,并且以此作为探针来检测它们在环境样品中的的相应分布;基因芯片需要的样品量少,适宜于环境微生物检测;基因芯片具有定量特性.根据探针排列的类型,可以将用于环境研究的基因芯片主要分为3类.首先是含有编码不同生物化学循环过程关键酶(例如硝化和去硝化)和其它功能基因序列的功能基因芯片(FunctionalGeneArrays,FGAs),该技术可以用于检测自然环境中微生物群落的生理地位和功能活动.第二种是由含有源于核糖体核酸(rRNA)基因探针的系统发育的寡核苷酸芯片(PhylogeneticOligonucleotideArrays,POAs),该芯片主要是用于微生物群落组成和结构的系统发育分析.第三种是含有整个DNA基因组的群落基因组芯片(CommunityGenomeArrays,CGAs),该技术可以根据可培养的成分描述微生物群落.目前,基因芯片在环境微生物研究中的应用领域主要可分为基因表达分析、比较基因组分析和混合微生物的群落分析等.因为具有高密度和高通量能力,研究表明基因芯片可以作为分析环境样品的有利工具,预期基因芯片为基础的基因组技术将革命性的分析微生物群落的结构、功能和动力学.在历史上首次可能同时在实验中评估所有的或绝大多数复杂自然环境中的成分.随着进一步的简化,可能开始对微生物群落动力学建立一个全面统一的评价.因此通过基因芯片技术,可以进行微生物生态系统的组成、不同个体间的空间关系、代谢功能活动和种群功能间的相互关系的原位测定研究等,同时还可以对全球气候环境变化进行研究,可以预见,利用基因芯片对微生物生态学研究将为我们展示一个革命性的前景。

摘要： 稳定同位素分析是微生物生态学研究的新方法,许多相关研究论文出现在不同的研究领域.本综述首先介绍生物标记物的稳定同位素分析技术,基本的气相色谱-同位素比例质谱仪的应用,然后介绍一些利用13C标记化合物在环境微生物学研究中的应用.加入标记底物与生物标记物的稳定同位素分析相结合,可以直接鉴定环境中参与特殊底物代谢的微生物类群.该项技术在微生物生态学,尤其是环境微生物学研究中将发挥越来越大的作用.

摘要： 随着分子生物学技术的不断发展,对微生物生态的检测出现了一种的新技术宏蛋白质组学,其定义为:在特定的时间对微生物群落所有的蛋白进行分析研究的技术,目前宏蛋白组学研究展开的比较少.但是在极端环境中功能基因表达、特殊功能蛋白开发以及生态元素循环等领域,显出强大的功能.这项技术就是运用蛋白质组技术对天然环境微生物产生的所有的蛋白质进行大规模研究与分析的技术,本文对宏蛋白质组学的产生、应用现状和策略以及存在的问题和前景进行了展望.

摘要： 随着分子生物学技术的不断发展,对微生物生态的检测出现了一种的新技术宏蛋白质组学,其定义为:在特定的时间对微生物群落所有的蛋白进行分析研究的技术,目前宏蛋白组学研究展开的比较少.但是在极端环境中功能基因表达、特殊功能蛋白开发以及生态元素循环等领域,显出强大的功能.这项技术就是运用蛋白质组技术对天然环境微生物产生的所有的蛋白质进行大规模研究与分析的技术,本文对宏蛋白质组学的产生、应用现状和策略以及存在的问题和前景进行了展望.

摘要： 本发明目的在于从检查对象有效地收集微生物，另外对收集了的微生物进行正确检测、计量。本发明的微生物收集芯片基本构成为除去异物的过滤器和捕集微生物的过滤器。微生物收集试剂盒由上述那样的微生物收集芯片和抽滤手段构成。抽滤手段，例如可以是在口部设置橡皮塞的负压管。还有，微生物收集芯片含有注入液体检体的液体检体注入容器和可使在负压管的口部设置的橡皮塞贯通的中空针。注入到液体检体注入容器的液体检体通过负压管的压力抽滤。异物通过异物除去过滤器除去，微生物被捕集在微生物收集用过滤器上。然后，使用含有微生物收集用过滤器的单元，对捕集到微生物收集用过滤器上的微生物进行检测计量。

摘要： 本发明的目的在于提供一种可抑制侵入的异物的存在且装入大量试样的微生物培养器、微生物检验试剂盒、透析液的检验方法、微生物的培养方法、微生物的检验方法、及微生物培养器的制造方法。本发明提供一种微生物培养器，其包含将片状培养基装入内部并进行密封的附注入口的培养袋。

摘要： 本发明目的在于从检查对象有效地收集微生物，另外对收集了的微生物进行正确检测、计量。本发明的微生物收集芯片基本构成为除去异物的过滤器和捕集微生物的过滤器。微生物收集试剂盒由上述那样的微生物收集芯片和抽滤手段构成。抽滤手段，例如可以是在口部设置橡皮塞的负压管。还有，微生物收集芯片含有注入液体检体的液体检体注入容器和可使在负压管的口部设置的橡皮塞贯通的中空针。注入到液体检体注入容器的液体检体通过负压管的压力抽滤。异物通过异物除去过滤器除去，微生物被捕集在微生物收集用过滤器上。然后，使用含有微生物收集用过滤器的单元，对捕集到微生物收集用过滤器上的微生物进行检测计量。

摘要： 本实用新型公开了一种土壤微生物生态学试验取样装置，包括固定安装底座，所述固定安装底座的下端固定安装有自锁脚轮，所述固定支撑架的内端安装有外框架，所述第一调节杆的上端外部设置有与外框架相连接的调节盘，所述第一调节杆的下端设置有钻孔组件；固定安装限位杆，其单体分别设置在钻孔组件的前后两端并与外框架相连接，所述外框架的前方设置有与固定安装底座相固定安装的第一放置架，所述外框架的后方设置有与固定安装底座相固定安装的第二放置架；限位支腿，其设置在固定安装底座的下端左右两侧。该土壤微生物生态学试验取样装置，有利于根据需要进行深度调节，能够进行稳定的放置，且提高了该装置的实用效果。

摘要： 本实用新型公开了水体微生物生态学试验用取样装置，包括箱体，所述箱体的内壁固定连接有挡板，挡板将箱体分为抽水区和存放区，箱体的上端螺纹连接有旋转杆，旋转杆的上端固定连接有固定块，旋转杆的表面转动连接有活塞，活塞的表面开设有凹槽，凹槽的内壁滑动连接有支撑杆，支撑杆的下端与挡板的上端固定连接，挡板的下端固定连接有出水管。该水体微生物生态学试验用取样装置，通过设置安装箱、辊筒、把手、绕线轮、牵引绳、抽水管和配重块，可以抽取不同深度的水，旋转固定块，活塞向上移动，能够将水通过抽水管和连接管进入箱体，水经过出水管和电磁阀，能够把不同深度的水排放到不同的量杯中。

摘要： 本实用新型公开了一种土壤微生物生态学检测培养皿，包括培养皿本体，培养皿本体的一侧设有一对安装板，一对安装板的之间连接有转轴，转轴的一侧连接有连接板，转轴通过连接板活动连接有第一密封盖，且第一密封盖的一侧设有拉手，培养皿本体的一侧设有通孔，培养皿本体通过通孔连接有出水管，且出水管的一端连接有第二密封盖，第一密封盖的内壁设有密封垫，且密封垫的一侧与培养皿本体的外壁相互贴合。该种土壤微生物生态学检测培养皿，能有效避免培养皿在日常存储中，密封盖容易丢失的情况发生，且结构简单合理，设计新颖，具有较高的实用价值。

摘要： 本实用新型公开了一种土壤微生物生态学检测培养皿，包括培养皿本体，培养皿本体底部设置有底板，培养皿本体一侧圆周外壁上开设有辅助区域，培养皿本体的顶端圆周外壁上开设有螺纹条，培养皿本体顶部配合设置有皿盖，皿盖的圆周内壁设置有与螺纹条相配合的螺纹槽，皿盖内顶端中部设置有固定柱，固定柱的圆周外部套设有密封本体，培养皿本体圆周外壁开设有若干凸起条。本实用新型结构简单，使土壤微生物在培养皿中能够更好的培养，从而提高培养效率，使得适应工作人员不同大小的手掌与培养皿直接接触，提高了适用性，有效的防止手掌与培养皿接触时造成易打滑的现象，进而提高了安全性。

摘要： 本实用新型公开了一种水体微生物生态学试验用取样装置，涉及微生物试验用具技术领域，包括取样板、固定座和取样组件，固定座顶部通过固定杆连接有套环，套环内活动的穿设有调节杆，调节杆一端焊接有卷线轮，卷线轮上缠绕有调节绳，卷线轮通过调节绳与取样板固定连接，调节杆另一端焊接有转动把手，取样板底部固定设置有气囊，气囊底部固定安装有第一电动伸缩杆，本实用新型结构新颖,使用便捷，通过对称设置且处于不同深度的取样球对水体进行取样，确保取样充分性和准确性，且通过活动式调节杆推动取样组件在水中进行水平移动，从而减少不同深度的水混合对试验结果的影响，使得试验更加精确。

摘要： 本实用新型涉及培养皿设备技术领域，特别涉及一种土壤微生物生态学检测用培养皿，包括壳体，且通过在壳体的内部设有橡胶塞，且放置盒粘贴在橡胶塞的上表面，在盒盖下端设有挡环，挡环的下表面与放置盒的上表面相接触，进而便于对放置盒进行固定和在转运时，进行缓冲，避免转运时，放置盒内部的样品震动较大，通过在盒盖的上表面设有卡接槽，在壳体的下表面设有卡接环，在多个本实用新型之间进行叠放或转运时，将卡接环卡接在卡接槽的内部，避免多个本实用新型之间相互滑动，方便使用，通过设有推板和螺纹筒，便于通过推板将放置盒、橡胶塞和推板从壳体的内部进行推出，方便清洗，便于再次利用。

摘要： 本实用新型公开了一种水体微生物生态学原位实验装置，特点是包括用于培养微生物的实验瓶体以及用于放置若干个实验瓶体的敞开式浮框，实验瓶体的瓶口密封设置有用于实现瓶内微生物与瓶外环境相互隔离且瓶内水体与环境水体相互流通的滤膜，浮框的底部以及其两侧分别设置有若干个开孔，开孔的直径小于实验瓶体的瓶口直径，实验瓶体置于浮框内且实验瓶体的瓶口对准开孔的位置，滤膜的滤孔孔径为0.2μm-10μm，实验瓶体的瓶口设置有穿孔瓶盖，滤膜覆盖在实验瓶体的瓶口且位于穿孔瓶盖的内侧，优点是能实现微生物与实验水体相互隔离，但实验容器内与实验水体的水质保持一致，同时可以进行多组微生物实验培养，提高实验效率。