构象

摘要： 以假肠膜明串珠菌Leuconostoc pseudomesenteroides PC胞外多糖(Expolysaccharides,EPS)为研究对象,运用X射线衍射光谱技术和刚果红、圆二色光谱、β-消除反应方法分析PC EPS构象特征,并对其水溶解性、Zeta电位、特性黏度、乳化性和体外益生性进行综合分析。结果表明,PC EPS总体结晶度较低,主要以大量无定型态形式存在,且呈单股无规则线团形式,其链构象不受浓度影响;该多糖糖肽键连接键型为O型,多糖水溶解指数为96%。当PC EPS浓度从0.125增大至2mg/mL时,其Zeta电位值从-2.7±0.1mV变为-7.3±0.2mV,绝对值增大、溶液的稳定性逐渐增强。另外,PC EPS在双蒸水中的特性黏度为238.27mL/g;2.0mg/mL PC EPS对大豆油和葵花籽油的乳液活性分别为(57.57±0.13)%和(54.17±0.06)%,72h后其对大豆油、葵花籽油和花生油的乳化能力仍保持最初活力的50.6%、54.2%和52.1%。体外益生性实验显示,在添加2g/L PC EPS培养基中,Lactobacillus delbrueckii与Lac.paracasei的最大生长量较对照组分别增加约25.5%和19.8%;Lac.casei的生长对数期提前约12h;Lac.plantarum的最大生长量增加、延滞期缩短。综上所述,PC EPS具有极高水溶解性、较强的植物油乳化性、溶液体系稳定性,为其在食品工业中用作增稠剂、稳定剂和益生成分添加剂提供了理论依据。

摘要： 目的汉防己甲素衍生物是一类双苄基异喹啉类化合物,具有明显的抗肿瘤活性。研究汉防己甲素衍生物HL-49对Bloom DNA解旋酶(bloom DNA helicase,BLM)构象和生物学活性的影响对于探索其抗肿瘤作用机制具有重要意义。方法采用紫外光谱扫描研究药物HL-49对BLM DNA解旋酶构象的影响,荧光偏振技术和孔雀绿-磷钼酸铵比色法分析HL-49对BLM解旋酶的DNA结合活性、DNA解链活性、ATPase活性。结果紫外光谱扫描结果显示,HL-49对BLM DNA解旋酶的三维构象影响不明显。荧光偏振法结果显示,HL-49对BLM解旋酶的DNA(dsDNA/ssDNA)结合活性的影响不明显,但随浓度的增加,与DNA相互结合的能力越强(P<0.01)。随着HL-49浓度的增加,BLM DNA解旋酶的DNA解链能力下降,K_(obs)值逐渐降低。孔雀绿-磷钼酸铵比色结果说明,随着HL-49浓度的增加或作用时间延长,HL-49能明显抑制BLM DNA解旋酶的ATPase活性。结论汉防己甲素衍生物HL-49通过与DNA的可逆性结合,抑制BLM DNA解旋酶的ATPase活性和DNA解链活性。

摘要： 通过圆二色光谱、紫外光谱、荧光光谱以及等温滴定量热等技术研究了蜂毒肽(Mel)与小牛胸腺DNA(CT⁃DNA)之间的相互作用以及构象变化。结果表明Mel可以与CT⁃DNA形成复合物。复合物的形成使得Mel的构象发生变化,由无规卷曲转变为α⁃helix,Mel中色氨酸残基处于更加疏水的环境。同时,CT⁃DNA的结构发生变化,解链温度(T_(m))从64.3°C增加到66.2°C。Mel与CT⁃DNA的结合常数(K_(a))约为10^(5) L·mol^(-1),复合物的形成是吸热的过程,主要依靠静电作用,其次是疏水作用。

摘要： 为了探究热处理条件下不同pH对乳铁蛋白(LF)-乳糖复合物的结构与理化特性的作用,对LF-乳糖复合物的浊度、粒径、微观结构和构象进行测定。结果表明:在不同pH(2~10)条件下,LF-乳糖以不同的结构存在。在pH为2和4的酸性环境中,LF和乳糖处于共溶状态,热处理前后溶液浊度没有明显变化,其粒径维持在10 nm左右。在弱酸性和碱性环境中(6~10),LF和乳糖形成复合物,其溶液浊度明显增大,其粒径也从约10 nm增加到约460 nm。扫描电镜(SEM)显示了其结构从零散分布到线性聚集,再到团状聚集的过程。红外光谱(FT-IR)显示了复合物形成后的酰胺带和890 cm^(-1)处β-糖苷键的特征峰的变化。圆二色谱(CD)显示α-螺旋随pH增加从20.62%减少到18.23%,β-折叠则逐渐从33.35%增加到37.17%。SDS-PAGE图谱表明,碱性条件下生成了以非二硫键为主要作用力的聚集体。研究结果拓展了乳铁蛋白在食品中的应用。

摘要： 通过加入琥珀酸酐对大豆分离蛋白(soybean protein isolate,SPI)进行改性,探究琥珀酰化调控SPI电荷密度引起的构象改变和乳化性改善之间的关系。通过荧光光谱、紫外光谱、傅里叶变换红外光谱分析不同酰化程度SPI的构象变化,采用扫描电子显微镜、电位、表面疏水性、分子柔性及乳化性等手段表征琥珀酰化对SPI理化性质的影响。结果表明:琥珀酰化反应发生,琥珀酰基基团成功接枝于SPI上,SPI等电点下降,电负性增强;SPI微观结构产生变化,光滑无规则片状结构的表面出现小孔穴,分子质量增加;电荷密度的增加导致SPI三级结构展开,色氨酸暴露,酪氨酸被包裹,荧光光谱和紫外光谱出现红移现象,证明酰化后的SPI处于更亲水的环境中;SPI游离氨基与琥珀酰基基团反应使得其中N—H键变为C—N键,导致酰胺III带改变;酰化后的SPI表面疏水性下降,分子柔性增加,乳化活性与乳化稳定性得到改善。该研究证实,琥珀酰化SPI电荷密度的增加可以影响SPI的空间构象从而使乳化性明显改善。

摘要： 随着挤压技术的发展,以大豆蛋白为主要原料经过挤压加工制成具有明显组织化结构的素肉制品技术以及蛋白组织化结构形成机制越来越受到学者的关注。近几年的研究表明大豆蛋白微观结构的变化对大豆素肉的宏观组织化结构具有至关重要的作用。本文对挤压过程中大豆蛋白构象及其对组织化结构影响的研究进行综述,概述大豆蛋白分子构成,并总结了挤压对大豆蛋白构象和功能性的影响,重点阐述了挤压参数对大豆蛋白分子结构和功能性的影响和大豆蛋白挤压组织化形成机制,并概括了挤压大豆蛋白构象表征手段,旨在为大豆蛋白挤压组织化的工业应用提供理论支撑。

摘要： 本试验旨在研究酵母硒和枣粉对白羽肉鸡肌原纤维蛋白构象、功能及消化特性的影响。选用1日龄、体重相近、健康的白羽肉鸡180只,随机分成6组,每组3个重复,每个重复10只。6个组分别为CK组(基础饲粮)、J组(基础饲粮+8%枣粉替换8%玉米)、0.3S组(基础饲粮+0.3 mg/kg酵母硒)、0.6S组(基础饲粮+0.6 mg/kg酵母硒)、0.3S+J组(基础饲粮+0.3 mg/kg酵母硒+8%枣粉替换8%玉米)和0.6S+J组(基础饲粮+0.6 mg/kg酵母硒+8%枣粉替换8%玉米)。试验期42 d。试验结束时,取鸡胸肉,以肌原纤维蛋白为对象,测定肌原纤维蛋白的结构(二级、三级结构)、功能特性(溶解度、浊度、乳化及起泡特性)、凝胶特性(强度、弹性及持水力)及体外模拟消化(消化率、粒径)等指标。结果表明:1)与CK组相比,0.6S组、0.3S+J组和0.6S+J组肌原纤维蛋白中α-螺旋含量显著增加(P<0.05),β-折叠含量显著降低(P<0.05)。2)与CK组相比,J组、0.3S组、0.6S组、0.3S+J组和0.6S+J组肌原纤维蛋白浊度显著降低(P<0.05),0.3S组、0.6S组、0.3S+J组和0.6S+J组肌原纤维蛋白溶解度、乳化性和乳化稳定性显著升高(P<0.05),0.3S+J组和0.6S+J组肌原纤维蛋白起泡性显著增加(P<0.05),J组、0.3S组、0.6S组、0.3S+J组和0.6S+J组肌原纤维蛋白泡沫稳定性显著增加(P<0.05),0.6S组、0.3S+J组、0.6S+J组肌原纤维蛋白凝胶硬度和凝胶弹性显著升高(P<0.05),0.6S+J组肌原纤维蛋白凝胶持水力显著升高(P<0.05)。3)与CK组相比,J组、0.3S+J组和0.6S+J组的肌原纤维蛋白肠消化率显著增加(P<0.05),0.3S组、0.6S组、0.3S+J组、0.6S+J组的肌原纤维蛋白体外消化粒径均显著降低(P<0.05)。由此可见,饲粮中添加酵母硒和枣粉可以维持鸡肉宰后肌原纤维蛋白结构稳定,使其表现出良好的功能特性,同时改善其消化特性。

摘要： 设计并合成了9个可形成三中心氢键和6个可形成二中心氢键的N-芳基芳酰胺模型化合物,基于它们在氯仿和二甲基亚砜(DMSO)中的一维核磁共振波谱,系统地分析了羰基对βH和γH的去屏蔽效应.将Δ(δ_(βH))和Δ(δ_(γH))的值结合在一起,分析了三中心氢键对芳酰胺分子的构象限制效果,发现N-(2-氟苯基)-2-氟苯甲酰胺、N-(2-甲氧基苯基)-2-氟苯甲酰胺和N-(2-氟苯基)-2-甲氧基苯甲酰胺这3个N-芳基芳酰胺在酰胺基团的左右两侧都能展现出很好的构象控制效果,因此认为这3种结构单元在构建折叠体方面具有更大的潜力.此外,本文还发现,当NH与第二个氢键受体形成氢键时,其和第一个氢键受体之间的氢键就被削弱了,即在芳酰胺形成三中心氢键时,2个氢键受体争相与NH形成氢键并取得了某种平衡.

摘要： 近年来,随着“植物基”食品的研究热情高涨,有关大豆基发酵酸奶的研究逐渐受到人们的青睐。在食品工业中常利用高压均质技术对大豆蛋白乳液进行改性,使其表现出优良的加工特性。大豆在高压均质作用下,蛋白聚集体结构展开,多肽链上各亚基发生解离、重排。蛋白质结构的变化导致其表面疏水性增加,溶解度、乳液稳定性增强。高压均质通过改善大豆蛋白的构象,使酸豆乳的持水力增强,感官品质提升。本文主要概述了有关高压均质技术对大豆蛋白质构象及发酵特性影响的国内外研究进展,并分析了该领域的发展趋势,为大豆酸乳的深入研究提供一定的帮助。

摘要： 乙烷分子中相邻的两个氢原子被氟取代以后,它的最优构象就从全交叉式转变为邻位交叉,这就是邻位交叉效应影响分子构象最具代表性的一个例子。本文简要回顾了含氟邻位交叉效应的发展历史与重要应用,重点介绍了物理有机科研前沿的硫-氟邻位交叉效应。结合当前最新的科研成果,验证了通过改变硫原子的电正性可以达到有效调控邻位交叉效应这一重要策略。通过科研反哺教学,有助于进一步加深对硫-氟邻位交叉效应的理解和认识。

摘要： 本文分析了一系列核苷酸酰(含P=O基团)及核苷硫代磷酰(含P=S基团)氨基酸,并用NMR重点研究了它们在溶液中的构象.为生命科学的研究提供参考.

摘要： 本文用圆二色谱研究人血清白蛋白和牛血清白蛋白与六种过渡金属离子结合后诱导的构象改变.

摘要： 本文旨在研究该多糖在一种特殊溶剂-0.2MliCl/DMSO中的链构象,试图得到描述其特征的分子参数.

摘要： 最近我们研究了苯硒基修饰β-环糊精及其一素列同系物对脂肪醇客体的分子识别作用，结果表明环糊精衍生物的取代基在某种程度上影响其对客体分子的键合能力，这可能归结于取代基的电荷密度和其在环糊精空腔的自包结能力。为了进一步探讨苯环上取代基对这一类衍生物配位能力的影响，我们合成了一素列苯胺基修饰β-环糊精，并采用圆二色谱法初步研究了它们在水溶液中的构象。

摘要： 本文应用光相关谱(PCS)的方法研究了在不同的电解质溶液中羧甲基淀粉(CMS),交联聚丙烯酸钠盐(PAS)和交联聚丙烯酸-聚丙烯酰胺(PAA)共聚物铵盐构象的变化.从实验结果来看,在氢氧化钠水溶液和氯化钠水溶液中,随着电解质浓度的增加,溶液的电导率也有较大幅度的增加,聚合物PAS和PAA的水力半经则呈下降趋势,而CMS的变化是不同的.在氯化钠溶液中,CMS的水力半径基本上无大的变化.在氢氧化钠溶液中当氢氧化钠浓度达到0.5﹪时,水力半径开始下降.在醋酸溶液中,三种聚合物的水力半径,不受电解质浓度变化的影响.同时发现,在表观粘度相同时,在相同的电解质浓度下,CMS的水力半径均大于PAS和PAA,只有在高氢氧化钠浓度时除外.

摘要： 用计算机模拟技术确定了不同温度条件下魔芋葡甘聚糖大分子糖单元的几何构型,并用分子力学方法计算了单元结构的最低能量构象,为葡甘聚糖的几何构型和稳定构象研究搭建了桥梁.还探讨氢键的形成和对结构稳定的影响,以及计算机模拟技术在多糖研究中的发展趋势.实验结果表明:T=368K时,葡甘聚糖单元结构氢键形成数量最多,体系能量最低,结构最稳定.

摘要： 分子运动仿真是计算机辅助药物设计(CADD)的重要研究内容之一.为了通过简化方法来模拟线形生物受体大分子低能构象时存在的形态(瞬时位置,速度,加速度),本文提出了"球-虚弹簧"结构模型来模拟分子的横向伸缩振动和轴向扭转振动,并从理论上探讨了影响线形分子柔性的力学问题.文中的推导对于线形分子的运动仿真具有一定的意义.

摘要： 本文用圆偏光二向色性谱法(CD)研究了N-邻苯二甲酰化壳聚糖、N,O-苄基化壳聚糖.N-邻苯二甲酰化-O-氨基甲酸酯壳聚糖系列和N-烷基壳聚糖系列的胆甾液晶相.对于N-邻苯二甲酰化壳聚糖,观察到存在两种层次的螺旋结构,即胆甾液晶超分子水平上的层片螺旋结构和更微观层次上的分子螺旋构象.这两类螺旋随着浓度的增加相继从左旋变为右旋.对于N,O-苄基化壳聚糖,观察到随着浓度增大,螺距变大.在这些衍生物中还观察到溶剂性质,取代基结构和取代度对螺旋行为的影响.这些衍生物的CD峰都很宽,表明存在着很宽的螺距分布,这点与纤维素衍生物很不相同.

摘要： 本发明涉及对细胞表面受体、泵或蛋白的存在和/或构象改变的检测，此时两种不同的抗体和任选的配体与由所述抗体识别的泵和/或蛋白结合，并且检测抗体结合的改变。可将所述方法用于测定在多药物抗性中有效的细胞抑制药物联合，其中，在体外将所述天然细胞与要测试的药物或药物联合混合，并且用上述方法测试所述样品。所述方法还可用于检测多药物抗性调节剂的效力，其中，本发明的方法是在存在已知调节剂或要测试的调节剂的条件下进行的，并且比较了所得到的活性值。另外，本发明的目的是一种诊断试剂盒，用于检测受体、泵和蛋白的存在和构象改变，用于测定多药物抗性情况下的有效药物联合和/或用于检测包括能够检测所述受体、泵或蛋白，任选其他配体的第一种抗体，和一种用于检测结合的系统的调节剂的效力。

摘要： 蛋白酶nexin‑1(PN‑1)是丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serpin)家族的成员，以凝血酶为主要靶点。当前针对PN‑1的多克隆和单克隆抗体经常与纤溶酶原激活剂抑制剂‑1(PAI‑1，一种结构和功能同源的丝氨酸蛋白酶抑制剂)交叉反应。在本文中，发明人开发了抑制性单域抗体(VHH)，其显示出与人(hPN‑1)和鼠(mPN‑1)PN‑1的特异性结合并且不与PAI‑1交叉反应。重要的是，所有VHH都可以阻断血浆中的PN‑1活性以及从活化血小板中释放的PN‑1，后者是止血过程中PN‑1的主要来源之一。因此，本发明涉及抗蛋白酶nexin‑1(PN‑1)构象单域抗体及其特别是在用于治疗出血性疾病的治疗领域中的用途。

摘要： 本发明公开了基于化学修饰的纳米孔对整合素构象检测的方法，通过共价修饰构建功能化的纳米孔电学检测通道，配置不同浓度不同离子种类条件的整合素缓冲液样品，在外加偏压条件下检测具有不同构象的整合素穿过纳米孔的电学信息，对电学信息进行分析以实现定量与构象区分检测。本方法制样简单、操作便捷、响应灵敏，通过不同条件的电学信息对比，能够更清晰的呈现整合素的单分子构象信息；还能提供整合素的体积、表面电荷属性、浓度等信息；同时也可以进行单分子穿孔速率调控和特异性检测。

摘要： 本发明涉及计算机辅助药物研发技术领域，具体涉及一种高效分子三维构象的表达方法，该方法包括步骤A、建立基础片段库辅助文件；步骤B、构建分子三维构象；步骤C、记录生成分子三维构象的元数据以及步骤D、元数据的压缩存储。本发明避免了显式地记录每个分子构象中各原子的三维坐标，而是记录了高效还原每个构象三维坐标的meta信息，由于meta信息的存储量要比三维构象的显式表达要小100‑1000倍，而meta数据还原三维坐标的速度要比最快的三维构象生成的算法还要快一个数量级以上。由此，该方法突破了超大规模化学分子数据库的分子三维构象的存储限制，为药物分子的三维筛选提供了有效解决手段。

摘要： 本发明涉及活性形式的特异性抗‑Rho GTPase的构象单域抗体及其用途，尤其是在治疗和诊断领域的用途。具体地，本发明涉及其中CDR1‑IMGT、CDR2‑IMGT和CDR3‑IMGT的氨基酸序列与表B定义的H12、B6、4P75、4SP1、4SNP36、4SNP61、5SP10、5SP11、5SP58、5SNP47、5SNP48、5SNP65、B20、B15、B5、B71、E3、A6、G12、NB61、212B、111B或404F(hs2dAb)单域抗体的CDR1‑IMGT、CDR2‑IMGT和CDR3‑IMGT的氨基酸序列具有至少90％一致性的单域抗体。

摘要： 本公开涉及寡聚tau中的构象表位、其抗体以及制备和使用对其具有特异性的免疫原和抗体的方法。所述抗体与tau中的活性中和位点结合。还提供了制备和使用方法，包含用于治疗tau蛋白病的方法。

摘要： 本发明公开了一种获得识别空间构象表位抗体的方法，其包括如下步骤：构建重组质粒；所述重组质粒表达抗原蛋白和表面锚定蛋白形成的融合蛋白；将重组质粒转入真核细胞，获得重组真核细胞；重组真核细胞表面展示抗原蛋白或抗原蛋白片段；采用重组真核细胞免疫动物，获得杂交瘤细胞；从杂交瘤细胞中分离抗体；该抗体即为识别抗原蛋白空间构象表位的抗体。采用该方法获得的识别CCN1蛋白空间构象表位的抗体—单克隆抗体15G7，其仅结合天然CCN1蛋白，不结合变性CCN1蛋白，即只能专一性的识别天然构象的CCN1蛋白。本发明可以获得识别空间构象表位抗体，具有重要的应用价值。

摘要： 本发明提供一种Pyridomycin的衍生物，其大环衍生物保留了天然产物中12元杂环的骨架结构以及N6位的3‑羟基‑2‑吡啶甲酸结构的基础上：(1)将C2位的环外不饱和双键置换为环状氨基酸，所述环状氨基酸可以调控大环的构象；具体利用环大小和羧基alpha‑位手性构型控制大环的构象；(2)利用Pyridomycin分子6‑7位邻二胺结构特征，保留了Pyridomycin中3‑羟基‑2‑吡啶甲酸以及3‑吡啶两个活性相关结构通过调整邻二胺的二面角，使小分子具有Pyridomycin的独特构象。该结构化合物有着更优的活性与应用前景。

摘要： 本发明涉及一种RNA介导的染色质构象捕获方法。该RNA介导的染色质构象捕获方法，巧妙地利用反转录将BrdU引入靶标位点，结合BrdU抗体就能够简便有效地对靶标位点进行富集，并且能够广泛适用于RNA介导的染色质构象的捕获中，不需要针对特定RNA设计特定的带有标记的探针，极大地降低了成本。此外，通过将邻近连接技术引入RNA介导的染色质构象捕获领域，将在同一染色质复合物中与RNA密切相关的DNA位点进行连接，可以获得目标RNA介导的DNA位点的交互信息和互作网络。

摘要： 本发明公开了一种基于多极性油相乳液的界面蛋白构象分析方法，属于乳液界面蛋白分析技术领域。本发明首先将乳液离心并分离乳清层与乳脂层，随后向乳脂层中加入Tween‑20溶液，将界面蛋白充分解吸附后运用光谱技术研究其构象特征。本发明解决了现有界面蛋白回收方法提取率较低的问题，同时为研究油相极性影响界面蛋白构象的机制提供一套可靠且便于实施的方法。本发明的优点为：(1)操作简便，可行性高；(2)采用Tween‑20进行解吸附，对界面蛋白结构影响小；(3)通过对肌原纤维蛋白浓度以及Tween‑20浓度优化从而100％回收界面蛋白；(4)适用于不同极性油相乳液中界面蛋白的构象分析。