肠球菌属

摘要： CRISPR-Cas系统是一种细菌的适应性免疫系统,参与特异性防御不同类型的可移动遗传元件,如质粒、噬菌体、转座子等的入侵。旨在分析肠球菌(Enterococcus)基因组中该系统的基因结构,并探讨其与细菌耐药基因之间的关系。NCBI数据库中下载10种肠球菌的全基因组信息,利用软件对CRISPR-Cas系统的分布、cas1基因、重复序列、间隔序列等进行比对分析;查找耐药相关基因,分析其与CRISPR-Cas系统之间的关系。235株肠球菌中含完整CRISPR-cas系统的有35株(14.9%),含确定CRISPR阵列196个和cas基因簇46个。肠球菌基因组中CRISPR系统主要为II-A型(80.4%),其次是II-C型(15.2%),cas1基因序列的系统发育分析结果与CRISPR-cas系统的分型基本一致。肠球菌CRISPR-Cas系统的分布在不同菌种之间差异较大;CRISPR-Cas系统可能阻碍肠球菌某些耐药基因的水平转移。

摘要： 肠球菌属是除葡萄球菌属以外,造成院内感染的最常见的革兰阳性菌,属于机会致病菌,可造成泌尿道感染、感染性心内膜炎、菌血症、复杂性皮肤及皮肤结构感染等。由于其自身结构的特异性,肠球菌通常对于青霉素类、头孢菌素类、低剂量氨基糖苷类和低剂量克林霉素类等抗菌药具有天然的耐药性。目前临床上治疗肠球菌感染常使用的抗生素为万古霉素。但由于抗生素的不规范使用、细菌基因的突变及新耐药基因的获得,导致耐万古霉素肠球菌(VRE)越来越常见。本文对VRE耐药机制的研究进展做一综述。

摘要： 目的 探讨2396株肠球菌属细菌的临床分布特点及耐药情况,为临床抗感染工作提供有力的参考依据。方法 回顾性分析本院2015—2020年住院患者临床分离的肠球菌资料,梳理出肠球菌临床分布及对不同抗菌药物的耐药情况,运用统计学方法分析并总结。结果 2396株肠球菌中屎肠球菌874株,粪肠球菌1204株,鹑鸡肠球菌123株,铅黄肠球菌76株,鸟肠球菌70株;分离标本来自于尿液1070株(占44.65%),胆汁747株(占31.17%),引流液263株(占10.97%);2396株肠球菌在外科共检出1662株(占69.36%),内科462株(占19.28%)。屎肠球菌对利奈唑胺、喹努普汀/达福普汀耐药率低于10%;对替加环素、替考拉宁、万古霉素耐药率低于5%;高浓度庆大霉素、高浓度链霉素耐药率(P<0.001)均呈现逐年下降趋势。粪肠球菌对环丙沙星、氨苄西林耐药率低于23%;铅黄肠球菌对呋喃妥因耐药率均低于5%。粪肠球菌对四环素、喹努普汀/达福普汀的6年整体耐药率高于屎肠球菌。结论 检出2396株肠球菌以屎肠球菌和粪肠球菌为主,主要来自尿液、胆汁和引流液。6年来粪肠球菌对临床常用抗菌药物的耐药率明显低于屎肠球菌,利奈唑胺、替加环素及万古霉素耐药菌已出现,应引起重视,督促临床合理选择抗菌药物。

摘要： 肠球菌属(Enterococcus)是硬壁菌门(Firmicutes)杆菌纲(Bacilli)乳杆菌目(Lactobacillales)肠菌科(Enterococcaceae)细菌,也是乳酸菌群之一,分布于包括人类、动物和昆虫等生物的消化系统中,在污水、土壤等自然环境中也有分布,甚至在橄榄等植物中也能分离出来。利用DNA-rRNA杂交或16S rRNA基因序列等分子生物学分类方法对肠球菌进行分类,截至目前肠球菌有60个种(或亚种),其中屎肠球菌属(E.faecium)和粪肠球菌属(E.faealis)占肠球菌属总数的95%以上。

摘要： 目的 探讨本院老年患者尿液中肠球菌属的分布及耐药性,为指导临床合理用药提供依据.方法 老年患者尿液中检出的559株肠球菌属,使用WalkAway 96全自动微生物分析仪进行鉴定及药物敏感性试验;将最终的菌种鉴定结果 和药物敏感性数据进行统计分析.分析药敏试验结果 .结果 所有检出的肠球菌属中分离出屎肠球菌399株,占比为71.4％,粪肠球菌158株占比为28.3％,其他肠球菌2株,占比为0.3％;药物敏感性结果 显示,肠球菌对利奈唑胺、万古霉素和达托霉素完全敏感,但对其他抗菌药物均有不同程度的耐药;高浓度氨基糖苷类药物耐药的肠球菌有352株,占总数的63.2％.结论 老年患者尿路感染的肠球菌属中以粪肠球菌和屎肠球菌为主,且多药耐药现象相当严重;及时准确的药物敏感性报告,可以指导临床合理选用抗菌药物,有效降低耐药菌株的产生.

摘要： 目的 探讨肠球菌属细菌感染患者的菌种分布和耐药性.方法 选择经细菌培养与鉴定确诊为肠球菌属细菌感染的687例患者,行多种常用抗菌药物药敏试验.对比各类菌株占比情况及所属样本分布情况,分析各类菌株对不同抗生素的耐药率.结果 687例患者共分离出964株肠球菌属细菌,其中粪肠球菌290株(30.08％),屎肠球菌674株(69.92％).各类送检样本中,粪肠球菌的尿液样本检出率最高(63.79％),其次为分泌物样本(14.83％),显著高于引流液(9.66％)、胆汁(4.14％)、血液(3.10％)、其他样本(4.48％),差异有统计学意义(P0.05).结论 肠球菌属细菌感染以粪肠球菌和屎肠球菌为主,其中屎肠球菌感染率相对较高,其耐药率也更高,应严格遵循细菌培养、鉴定及药敏试验结果,合理选择敏感抗菌药物.

摘要： 目的:了解该地区临床分离的肠球菌属的临床分布及对常用抗菌药物的耐药性.方法:采用全自动细菌鉴定仪及配套鉴定与药物敏感试验试剂,检测临床分离菌的菌种分布、样本来源和构成比及对常用抗菌药物的耐药性及敏感性,并用WHO-NET5.6软件进行统计分析.结果:临床分布前三位分别是重症医学科、肝胆外科及泌尿外科,屎肠球菌比粪肠球菌对多数抗菌药物的耐药率高,但对环丙沙星、左旋氧氟沙星及氨苄西林的耐药率明显高于粪肠球菌,在此次监测中未发现对万古霉素、替考拉宁耐药的肠球菌,发现3株对利奈唑胺耐药的肠球菌.结论:不同种类的肠球菌耐药性差别较大,在治疗时,我们需根据药物敏感试验及耐药特点,合理选择抗菌药物治疗,防止出现替考拉宁、万古霉素耐药的菌株.

摘要： 对本院2009年4月至2009年6月临床分离的158株肠球菌属进行调查与研究,了解其菌株分布和耐药特点,为临床合理用药提供指导.由于肠球菌属是重要的医院感染条件致病菌，其具有固有的、获得性的多重耐药性，以及肠球菌属中各种菌对抗生素的耐药性有差异。本研究发现耐药性相对较低的粪肠球菌比例下降，而耐药性较高的屎肠球菌、鹑鸡肠球菌、铅黄肠球菌比例增高，因此，临床细菌鉴定肠球菌应到种的水平，并对肠球菌菌种感染的状况和耐药性进行长期的检测，为临床及时有效控制肠球菌感染和合理选用抗菌药物提供有力依据。

摘要： 近年来,由于免疫抑制剂的广泛应用,侵入性治疗机会的增多及过渡使用氟喹诺酮类和头孢类药物,使肠球菌的感染逐年增加,并呈现多重耐药性.本文对1998～2003年本院分离之906株肠球菌属细菌对常用抗生素的耐药性进行回顾性分析,以了解本地肠球菌属细菌的耐药状况。

摘要： 目的：了解胆道感染肠球菌的耐药情况,为胆道感染肠球菌的治疗提供参考依据. 方法：2012年1月至2014年12月住院患者胆道感染的胆汁标本,血平板分离到103株肠球菌,其中粪肠球菌58株,屎肠球菌45株,全自动微生物鉴定仪VITEK2-compact进行菌株鉴定,采用K-B纸片扩散法检测9种抗菌药物的敏感性,结果判定按照美国CLSI标准. 结果：粪肠球菌对抗菌药物的敏感率：万古霉素100.0％、利奈唑胺100.0％、呋喃妥因79.9％、氨苄西林87.9％、米诺环素72.4％、高浓度庆大霉素60.3％.屎肠球菌对抗菌药物的敏感率：万古霉素100.0％、利奈唑胺100.0％、高浓度庆大霉素66.7％、呋喃妥因46.7％、氨苄西林55.6％、米诺环素62.2％. 结论：肠球菌属引起的胆道感染,首选氨苄西林,其次为利奈唑胺或万古霉素.临床医师应加强胆道感染病原菌的检测,关注耐药性的变化,同时加强医院感染控制及合理使用抗菌药物.

摘要： 从化学吸收-生物还原集成系统内的混合培养物中分离得到一株高效还原Fe(III)Cit（Cit: 柠檬酸）的菌株，对其进行分子生物学鉴定，归属为肠球菌属，命名为Enterococcus sp. FR-3。同时，考察了碳源种类和浓度、氮源种类和浓度、菌种接种量以及pH 等因素对FR-3 生长及Fe(III)Cit 还原性能的影响，优化微生物生长及还原Fe(III)Cit的条件。结果表明，葡萄糖为FR-3 生长和Fe(III)Cit 还原的最佳碳源，其最适添加浓度为1000 mg·L-1。NH4Cl 作为氮源时菌种 FR-3 生长和Fe(III)Cit 还原效果明显优于NaNO2，且 NH4Cl只要维持100 mg·L-1 左右即可。菌种接种量在 150 mg·L-1时Fe(III)Cit 还原率达到最大。过量碳源、氮源用量以及或接种量对还原过程没有促进作用。适合Fe(III)Cit 还原的pH 值范围为6.6~7.0。

摘要： 根据GenBank公布的基因序列，分别针对肠球菌属及其毒力基因cylA、esp和As设计合成了4对引物。 通过改进模板DNA提取方法和优化反应条件，建立了可以同时测定肠球菌和其携带的3种主要毒力基因的多重PCR方法。经过对不同来源的疑似肠球菌分离株进行检测，该多重PCR方法具有快速、可靠的特点。在不同来源的疑似肠球菌菌株中，临床感染分离株携带上述3种毒力基因的比例均高于鲜肉分离株和粪便分离株(分别为84.2%、55.7%和27.1%);而且在各种来源肠球菌菌株中这3种毒力基因的携带率以cylA最高。

摘要： 本发明涉及一种鉴定革兰氏阳性致病菌的方法，包括(a)使用至少第一组扩增引物进行的扩增步骤，所述扩增引物能够扩增致病性革兰氏阳性菌的第一预定亚组中的预选核酸序列区；(ab)使用至少第一种杂交试剂进行的检测步骤，所述杂交试剂能够特异性检测所述致病性革兰氏阳性菌第一预定亚组中的预选核酸序列区，所述检测步骤包括下列步骤：(aba)无论在预选温度下是否发生杂交，监测杂交的发生，所述杂交的发生指示存在于样品中的致病性生物的至少一个属，和(abb)监测杂交的温度依赖性，所述温度依赖性指示致病性革兰氏阳性菌的至少一个物种。

摘要： 本发明公开了一种检测肠球菌属细菌中五种糖肽类药物耐药基因vanC、vanE、vanG、vanL和vanN的特异性引物组合和探针组合，包括对五种糖肽类药物耐药基因进行特异性扩增的引物组合，还包括检测五种糖肽类药物耐药基因的特异性探针。本发明还同时公开了利用该特异性引物和探针组合进行检测五种糖肽类药物耐药基因的方法。本发明具有高特异性和涵盖度，不仅可用于对人体感染样本中vanC、vanE、vanG、vanL和vanN耐药基因的检测，提示对万古霉素等的耐药程度；还可用于动物及环境样本中五种糖肽类药物耐药基因的分布及转移情况的监测。

摘要： 本发明公开了一种检测肠球菌属细菌中四种糖肽类药物耐药基因vanA、vanB、vanD和vanM的特异性引物组合和探针组合，其包括对四种糖肽类药物耐药基因进行特异性扩增的引物组合，还包括检测四种糖肽类药物耐药基因的特异性探针。本发明还同时公开了利用该特异性引物和探针组合进行检测四种糖肽类药物耐药基因的方法。本发明具有高特异性和涵盖度，不仅可用于对人体感染样本中vanA、vanB、vanD和vanM耐药基因的检测，提示对万古霉素、替考拉宁的耐药程度，为临床抗感染治疗用药提供参考依据，同时对糖肽类药物耐药的发展进行监测；还可用于动物及环境样本中四种糖肽类药物耐药基因的分布及转移情况的监测。

摘要： 本发明的技术方案公开了一种肠球菌属及毒力基因多重PCR检测引物，它包括肠球菌属引物的序列、聚集物质引物的序列和溶血素引物的序。本发明建立了一种快速准确鉴定肠球菌属及其主要毒力基因的多重PCR方法。本方法特异性高；敏感性实验表明该方法最低能检测到100pg DNA。为肠球菌感染的分子流行病学调查，研究肠球菌致病机制机制、早期预防提供了一种新的快速检测方法，同时构建的标准质粒也为未来建立实时荧光定量PCR方法提供了基础。

摘要： 本发明公开了一种肠球菌属多重PCR检测引物，包括肠球菌属引物的序列、粪肠球菌种引物的序列和屎肠球菌种引物的序列。本发明建立了一种快速准确鉴定肠球菌的多重PCR方法，大大简化了查验程序，可以在很多基层实验室使用。能一次PCR鉴定到肠球菌属及粪肠球菌或屎肠球菌种，能最少检测出1ng的基因组DNA，敏感性高，特异性比较强，有利于肠球菌的鉴别与诊断，并且具有的较好敏感性、重复性和稳定性，为临床中肠球菌的检测提供了一种新的快速检测方法，也为肠球菌感染的分子流行病学调查，研究肠球菌分子发病机制，早期诊断，诊断试剂盒的研制与开发，药物或疫苗的免疫机制提供了试验依据和技术手段。

摘要： 本发明公开了一种检测肠球菌属细菌中五种糖肽类药物耐药基因vanC、vanE、vanG、vanL和vanN的特异性引物组合和探针组合，包括对五种糖肽类药物耐药基因进行特异性扩增的引物组合，还包括检测五种糖肽类药物耐药基因的特异性探针。本发明还同时公开了利用该特异性引物和探针组合进行检测五种糖肽类药物耐药基因的方法。本发明具有高特异性和涵盖度，不仅可用于对人体感染样本中vanC、vanE、vanG、vanL和vanN耐药基因的检测，提示对万古霉素等的耐药程度；还可用于动物及环境样本中五种糖肽类药物耐药基因的分布及转移情况的监测。

摘要： 本发明公开了一种检测肠球菌属细菌中四种糖肽类药物耐药基因vanA、vanB、vanD和vanM的特异性引物组合和探针组合，其包括对四种糖肽类药物耐药基因进行特异性扩增的引物组合，还包括检测四种糖肽类药物耐药基因的特异性探针。本发明还同时公开了利用该特异性引物和探针组合进行检测四种糖肽类药物耐药基因的方法。本发明具有高特异性和涵盖度，不仅可用于对人体感染样本中vanA、vanB、vanD和vanM耐药基因的检测，提示对万古霉素、替考拉宁的耐药程度，为临床抗感染治疗用药提供参考依据，同时对糖肽类药物耐药的发展进行监测；还可用于动物及环境样本中四种糖肽类药物耐药基因的分布及转移情况的监测。

摘要： 本发明涉及一种肠球菌属细菌鉴定试剂盒及该试剂盒的应用，该试剂盒只需要吡咯烷基芳胺酶、精氨酸、蔗糖等10种生化试剂即可对28种肠球菌属细菌的生化反应进行排序，根据每种生化试剂对各肠球菌属细菌的生化反应所呈现的阴阳性结果，通过八进制组成的4位数编码，就能生成肠球菌属细菌的编码手册，或将编码手册输入计算机数据库中，编成计算机程序，通过编码来进行肠球菌属细菌的某一种的鉴定，该技术与现有的技术相比，具有生化试验项目少，设计合理，使用方便，鉴定快键迅速等特点，能鉴定新近发现的肠球菌属细菌，具有良好的经济效益和实际使用价值。

摘要： 本发明公开了一种肠球菌属多重PCR检测引物，包括肠球菌属引物的序列、粪肠球菌种引物的序列和屎肠球菌种引物的序列。本发明建立了一种快速准确鉴定肠球菌的多重PCR方法，大大简化了查验程序，可以在很多基层实验室使用。能一次PCR鉴定到肠球菌属及粪肠球菌或屎肠球菌种，能最少检测出1ng的基因组DNA，敏感性高，特异性比较强，有利于肠球菌的鉴别与诊断，并且具有的较好敏感性、重复性和稳定性，为临床中肠球菌的检测提供了一种新的快速检测方法，也为肠球菌感染的分子流行病学调查，研究肠球菌分子发病机制，早期诊断，诊断试剂盒的研制与开发，药物或疫苗的免疫机制提供了试验依据和技术手段。

摘要： 本发明的技术方案公开了一种肠球菌属及毒力基因多重PCR检测引物，它包括肠球菌属引物的序列、聚集物质引物的序列和溶血素引物的序。本发明建立了一种快速准确鉴定肠球菌属及其主要毒力基因的多重PCR方法。本方法特异性高；敏感性实验表明该方法最低能检测到100pg DNA。为肠球菌感染的分子流行病学调查，研究肠球菌致病机制机制、早期预防提供了一种新的快速检测方法，同时构建的标准质粒也为未来建立实时荧光定量PCR方法提供了基础。