X射线晶体学

摘要： 分子筛是一类具有规则孔道或笼结构的晶态微孔材料,在吸附、分离和催化中都表现出了优异的性能.为了探索其结构与性质的关系,在原子尺度上研究分子筛的微观结构是十分必要的.本综述介绍了一系列与X射线晶体学和电子晶体学相关的表征技术(倒易空间和正空间)在分子筛结构表征中的应用.随后,基于分子筛的结构表征方法和化学组成,对2007年之后发现的85种新分子筛进行了系统总结,对其中9种具有独特合成方法或结构特征的分子筛进行了详细介绍.

摘要： 已有研究表明蚊子进食或感染黄病毒时蚊子体内的AEG12蛋白水平会上调,然而人们对AEG12的功能与作用机制的研究较少。近日,美国国立卫生研究院(NIH)的国家环境健康科学研究所(NIEHS)的研究人员使用X射线晶体学方法揭示了AEG12蛋白的三维结构,发现AEG12结构中大的中央疏水腔内的酰基链配体的结合作用具有特异性。研究的相关结果于2021年3月16日发表在《PNAS》期刊上。

摘要： 以三苯基膦(PPh3)为共配体,合成了2种新的铜(Ⅰ)和铜(Ⅱ)与菲啶(Phend)的配合物,其组成为[Cu(κ1-Phend)2Cl2] (1)和[Cu2(κ1-Phend)2(κ1-PPh3)2(μ-Cl)2] (2).这些配合物的结构通过元素分析、摩尔电导率、FT-IR、UV-Vis和单晶X射线衍射进行了研究.典型配合物1的X射线衍射分析显示,Cu(Ⅱ)配位构型为扭曲的平面四方形,而双核配合物2的Cu(Ⅰ)中心为含μ-Cl-离子的不规则四面体构型.FT-IR谱、元素分析以及UV-Vis谱证实了它们的成分、几何形状和配体相互作用.2种配合物的结构通过密度泛函理论(D FT,)计算进行了优化,以解释电子光谱特性.

摘要： 抗生素的广泛使用使得肺炎链球菌耐药性问题日趋严重。国际学术期刊《科学进展》刊登一项研究发现,利用抗体药物“饿死”病原体可有效对抗肺炎。澳大利亚国立大学化学研究所等研究机构的研究人员基于X射线晶体学确定了转运蛋白的三维立体结构运作方式。尽管从肺炎链球菌中提取转运蛋白难度很大,但研究人员使用一种“洗涤剂”将转运蛋白从细菌细胞膜上洗脱下来。

摘要： 冷冻电镜技术突破了硬件和三维重构软件面临的诸多壁垒,不断改进并完善,提高了样品分辨率,揭示了众多生物分子细节。2013年年底,结构生物学经历了一场“分辨率革命”,许多生物大分子的神秘面纱纷纷被揭开。冷冻电子显微镜(以下简称“冷冻电镜”)是结构生物学的重要研究工具、重要突破,其结构解析的分辨率已从纳米尺度进入埃尺度(即原子尺度),成为可以与X射线晶体学相媲美的结构解析方法。其中,单颗粒冷冻电镜技术大大降低了结构解析的难度,提高了结构解析的速度。通过冷冻电镜技术,研究人员可以揭示许多之前未能知晓的生物分子细节,帮助人们揭秘众多的生物学现象。

摘要： X射线晶体学技术目前仍然是解析生物大分子结构的最主要手段,获得尺寸足够大的大分子晶体仍然是晶体学技术的难点.小晶体相对于大晶体较容易获得,而且晶格堆积较好,但小晶体容易受到辐射损伤,即使在低温下进行数据采集也很难从一颗晶体获得完整的结构信息.利用激光光刻技术制作用于多颗晶体上样的芯片,实现高通量的多颗晶体衍射数据收集,将多套数据进行合并,获得无明显辐射损伤的生物大分子结构信息.石英芯片背景散射低,上样效率高.基于芯片的晶体上样技术为晶体学研究者提供了一种利用微聚焦光束线站进行小晶体衍射数据收集并获得无明显辐射损伤高质量衍射数据的高效手段.%[Background] X-ray crystallography is still the most important means of obtaining atomic resolution structure of biological macromolecules. Obtaining protein crystals of sufficient size is the bottleneck of crystallography. Small crystals are easier to obtain than large crystals, and lattice packing is better. But small crystals are susceptible to radiation damage, and it is difficult to obtain complete structural information from a crystal even when data collection is performed at low temperatures. [Purpose] This paper aims to propose a method for acquiring small crystal data based on chip techniques at a microfocus beam line station of synchrotron radiation light source. [Methods] First of all, the chip was fabricated by laser lithography technology, and crystal was able to be deposited in the groove of the chip. Then, high-throughput data collection for diffraction of multi-crystals on the chip was achieved on the chip, and collected multiple chips data sets were emerged to get structure information of biological macromolecules. Finally, the feasibility of chip-based sample delivery method was verified by using the lysozyme crystal at the microfocus beamline (BL18U1) of SSRF. [Results] The quartz chip has low background scattering and high sample delivery efficiency. The structure of lysozyme with high resolution of 0.139 nm was obtained by chip loading and data acquisition. [Conclusions] The chip-based polycrystalline data acquisition method can obtain complete biomacromolecule structural information without obvious radiation damage by merging multiple data sets.

摘要： X射线晶体学是一门研究物质晶体结构的科学,X射线衍射技术已成为当今化学、材料、生命等众多科学领域中对物质结构研究的必要手段与方法.本文从X射线晶体学的诞生、发展和迅速普及的角度,谈谈X射线晶体学的发展历程对人类文明的贡献,以及X射线晶体学在当今高等教育中的重要性,从而阐述在高等学校通识教育中加强与推广X射线晶体学的必要性与可行性.

摘要： 据复旦大学生命科学学院官网2019 年1月25日报道,1月23日,复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室甘建华课题组与李继喜课题组合作的关于非洲猪瘟病毒来源的DNA 连接酶的研究成果在线发表在《自然·通讯》杂志,题为Structure of the Error-prone DNA Ligase of Africanswine Fever Virus IdentifiesCritical Activesite Residues。该文章的主要成果是用X-射线晶体学方法解析了非洲猪瘟病毒的DNA 连接酶与不同类型DNA 复合物的结构,揭示了该DNA 连接酶结合和催化底物连接的分子机制。

摘要： 本文合成一种新的双膦连接Ag60纳米团簇[{Cl@Ag12}@Ag48(dppm)12],并通过X射线晶体学进行表征.二十面体的银处于核心位置,里面是中心氯化物组成,外面有48 个银原子/离子的包裹,顶端是12个双(二苯基膦基)甲烷(dppm)配体.同时利用密度泛函理论对阳离子[{Cl@Ag12}@Ag48(dppm)12]+进行计算,以确定该结构是否对应于核心数n=58的超原子. DFT计算的优化结构与X射线一致,但是HOMO-LUMO的能差并不能保证其超级稳定性.

摘要： 建立了具有快速化、多样化、高效化优势的X射线晶体学平台.平台针对蛋白质晶体学研究特点,拥有蛋白晶体筛选系统、晶体生长观察系统、衍射数据收集系统、蛋白结构解析系统4大功能模块,使其不仅具有科学研究和提供测试服务的功能,而且成为培养高素质生命科学人才的重要基地.%The X-ray crystallography platform with the advantages of rapidity , variety and efficiency is established . Arming at the characteristics of protein crystallography research , this platform has the four functional modules such as the protein crystal screening system ,the crystal growth observation system ,the diffraction data collection system and the protein structure analysis system ,which not only has the functions of the scientific research and providing the testing service ,but also becomes an important base for cultivating high-quality life science talents .

摘要： 本文简要描述了X射线小角散射法的基本原理,数据处理方法和结果的实验验证;并对该分析方法的特点和应用范例进行了介绍.

摘要： 本文简要描述了X射线小角散射法的基本原理,数据处理方法和结果的实验验证;并对该分析方法的特点和应用范例进行了介绍.

摘要： 本文简要描述了X射线小角散射法的基本原理,数据处理方法和结果的实验验证;并对该分析方法的特点和应用范例进行了介绍.

摘要： 本文简要描述了X射线小角散射法的基本原理,数据处理方法和结果的实验验证;并对该分析方法的特点和应用范例进行了介绍.

摘要： 本文扼要介绍了X射线粉末衍射的主要特点与粉末衍射仪的基本构造;在多晶聚集态结构、晶体结构与分子结构、晶体的微结构三个不同层次的结构测定中的主要应用;高低温环境与原位测量装置、微区衍射装置及能量色散装置等数种特殊的粉末衍射装置;还有数种粉末衍射仪的延伸应用,包括X射线散射、小角度散射与衍射、单晶体定向、表面与薄膜(多层膜)结构测定、倒易空间作图(maping)等.

摘要： 本文扼要介绍了X射线粉末衍射的主要特点与粉末衍射仪的基本构造;在多晶聚集态结构、晶体结构与分子结构、晶体的微结构三个不同层次的结构测定中的主要应用;高低温环境与原位测量装置、微区衍射装置及能量色散装置等数种特殊的粉末衍射装置;还有数种粉末衍射仪的延伸应用,包括X射线散射、小角度散射与衍射、单晶体定向、表面与薄膜(多层膜)结构测定、倒易空间作图(maping)等.

摘要： 本文扼要介绍了X射线粉末衍射的主要特点与粉末衍射仪的基本构造;在多晶聚集态结构、晶体结构与分子结构、晶体的微结构三个不同层次的结构测定中的主要应用;高低温环境与原位测量装置、微区衍射装置及能量色散装置等数种特殊的粉末衍射装置;还有数种粉末衍射仪的延伸应用,包括X射线散射、小角度散射与衍射、单晶体定向、表面与薄膜(多层膜)结构测定、倒易空间作图(maping)等.

摘要： 本文扼要介绍了X射线粉末衍射的主要特点与粉末衍射仪的基本构造;在多晶聚集态结构、晶体结构与分子结构、晶体的微结构三个不同层次的结构测定中的主要应用;高低温环境与原位测量装置、微区衍射装置及能量色散装置等数种特殊的粉末衍射装置;还有数种粉末衍射仪的延伸应用,包括X射线散射、小角度散射与衍射、单晶体定向、表面与薄膜(多层膜)结构测定、倒易空间作图(maping)等.

摘要： X射线衍射微结构分析方法就是一种基于衍射峰型和半峰宽的分析方法.这是因为,X射线衍射线形可以表达为仪器宽化线形(包括仪器几何,光学系统和样品位置偏移等所造成的宽化)以及样品自身宽化线形(包括晶粒尺寸,应变以及微缺陷等所造成的宽化)的卷积.本文主要就X射线衍射全谱拟合分析微结构的基础理论进行了论述.

摘要： X射线衍射微结构分析方法就是一种基于衍射峰型和半峰宽的分析方法.这是因为,X射线衍射线形可以表达为仪器宽化线形(包括仪器几何,光学系统和样品位置偏移等所造成的宽化)以及样品自身宽化线形(包括晶粒尺寸,应变以及微缺陷等所造成的宽化)的卷积.本文主要就X射线衍射全谱拟合分析微结构的基础理论进行了论述.

摘要： 对于未知是靶生物分子配体的化合物，可应用X-射线晶体学方法筛选它们结合靶生物分子的能力。此方法包括：获得靶生物分子的晶体；将此靶生物分子晶体暴露于一个或多个待测样品；以及获得X-射线晶体衍射图形，以及确定是否形成了配体/受体复合物。可通过存在一个或多个待测样品时共结晶生物分子，或者通过在一个或多个待测样品的溶液中浸泡此生物分子的晶体，而使此靶分子暴露于待测样品。在另一个实施方案中，应用来自配体/受体复合物的结构信息设计配体，此配体结合更紧密，更特异性地结合，具有更好的生物活性，或者具有更安全的分布。本发明进一步的实施方案，包括借助于这种直接的方法鉴别或设计生物活性部分。在还有一个实施方案中，是通过使此生物分子与一个可降解的配体共结晶，并使此配体降解而形成具有易接近的活性位点的生物分子晶体。

摘要： 本发明提供一种精确表征晶体三维取向和晶体学取向的方法。本发明方法，包括如下步骤：获取所述晶体材料待测区域内的二维组织形貌和EBSD花样；将其通过三维图像分析软件进行三维图像合成，获取三维形貌；提取特征形貌在三维形貌所在坐标系中的三维取向；通过三维取向转换到EBSD获得的晶体学坐标系中，获得所述特征形貌的晶体学取向。本发明可以精确地同时解析各种材料特征组织结构的取向和晶体学取向，对材料晶体生长取向和生长行为研究具有重要意义。

摘要： 通过适当地相对于硅层(102)之结晶特性(crystallographiccharacteristic)而定向沟道长度方向，应变硅/碳材料(109)之应力引发效果在与传统的技术相比较可有明显的增进。在一个例示实施例中，该沟道(103)可沿着方向予以定向以用于(100)表面定向，因此提供了大约1/4的电子迁移率的增加。

摘要： 本发明提供一种同步辐射串行晶体学静电纺丝上样装置以及一种基于同步辐射的串行晶体学实验方法。该上样装置包括：微流注射泵；与微流注射泵连接的四通管，样品母液和子液经过四通管被制备成同轴纺丝液；真空腔，包括：真空腔本体，入射窗口和衍射光出射窗口，电源电极针头和电源负极针头；高压电源；以及真空泵；其中，同轴纺丝液被输送到真空腔内，在高电压作用下形成静电纺丝射流，实现稳定可控的串行晶体学上样。根据本发明，为同步辐射光束线站上的串行晶体学实验提供稳定连续的上样，通过抽真空大幅降低空气电离对腔内电场的影响，解决了静电纺丝上样装置在同步辐射线站X射线作用下空气电离干扰的问题，大幅提高了静电纺丝射流的稳定性。

摘要： 本发明涉及X射线多粒晶体学。公开了确定多晶样品的一个或多个单位晶胞并标引3D衍射向量的集合DV的方法。该方法包括：得到特定的未知颗粒的多个候选第一晶格平面法线向量和多个候选第二晶格平面法线向量；使用所述多个候选第一晶格平面法线向量和所述多个候选第二晶格平面法线向量来选择3D衍射向量的集合DV的多个子集SSDV_n，并处理3D衍射向量的所述多个子集SSDV_n以确定由三个晶格向量限定的主要候选单位晶胞PCUC；其中主要候选单位晶胞PCUC通过评估PCUC与3D衍射向量的完全集合DV的拟合度而被验证。

摘要： 对于未知是靶生物分子配体的化合物，可应用X－射线晶体学方法筛选它们结合靶生物分子的能力。此方法包括：获得靶生物分子的晶体；将此靶生物分子晶体暴露于一个或多个待测样品；以及获得X－射线晶体衍射图形，以及确定是否形成了配体/受体复合物。可通过存在一个或多个待测样品时共结晶生物分子，或者通过在一个或多个待测样品的溶液中浸泡此生物分子的晶体，而使此靶分子暴露于待测样品。在另一个实施方案中，应用来自配体/受体复合物的结构信息设计配体，此配体结合更紧密，更特异性地结合，具有更好的生物活性，或者具有更安全的分布。本发明进一步的实施方案，包括借助于这种直接的方法鉴别或设计生物活性部分。在还有一个实施方案中，是通过使此生物分子与一个可降解的配体共结晶，并使此配体降解而形成具有易接近的活性位点的生物分子晶体。

摘要： 对于未知是靶生物分子配体的化合物,可应用X－射线晶体学方法筛选它们结合靶生物分子的能力。此方法包括:获得靶生物分子的晶体;将此靶生物分子晶体暴露于一个或多个待测样品;以及获得X－射线晶体衍射图形,以及确定是否形成了配体/受体复合物。可通过存在一个或多个待测样品时共结晶生物分子,或者通过在一个或多个待测样品的溶液中浸泡此生物分子的晶体,而使此靶分子暴露于待测样品。在另一个实施方案中,应用来自配体/受体复合物的结构信息设计配体,此配体结合更紧密,更特异性地结合,具有更好的生物活性,或者具有更安全的分布。本发明进一步的实施方案,包括借助于这种直接的方法鉴别或设计生物活性部分。在还有一个实施方案中,是通过使此生物分子与一个可降解的配体共结晶,并使此配体降解而形成具有易接近的活性位点的生物分子晶体。

摘要： 本发明提供一种精确表征晶体三维取向和晶体学取向的方法。本发明方法，包括如下步骤：获取所述晶体材料待测区域内的二维组织形貌和EBSD花样；将其通过三维图像分析软件进行三维图像合成，获取三维形貌；提取特征形貌在三维形貌所在坐标系中的三维取向；通过三维取向转换到EBSD获得的晶体学坐标系中，获得所述特征形貌的晶体学取向。本发明可以精确地同时解析各种材料特征组织结构的取向和晶体学取向，对材料晶体生长取向和生长行为研究具有重要意义。

摘要： 通过适当地相对于硅层(102)之结晶特性(crystallographic characteristic)而定向沟道长度方向，应变硅/碳材料(109)之应力引发效果在与传统的技术相比较可有明显的增进。在一个例示实施例中，该沟道(103)可沿着方向予以定向以用于(100)表面定向，因此提供了大约1/4的电子迁移率的增加。

摘要： 本发明涉及单晶金属材料技术领域，特别涉及一种单晶金属材料晶体学取向的快速测定方法。本发明提供的测定方法，利用单晶金属材料金相组织在光学显微镜下形成具有颜色深浅不同的图案，将金相组织的光学显微镜照片转换成灰度图，计算灰度值后，用得到的金相组织光学显微镜照片的灰度的数值代表某一取向的金相组织，将所述待检测金相样品的金相组织灰度值与单一取向的金相样品的金相组织灰度值进行比较，当所述待检测金相样品的金相组织灰度值与单一取向的金相样品的金相组织灰度值相近时，所述待检测金相样品的晶体取向与所述单一取向的金相样品的晶体取向相同。因此，本发明提供的测定方法测定效率高，同时降低实验风险和实验成本。