组织表达谱

摘要： 实验旨在探究OC-116(Ovocleidin-116)基因在山麻鸭蛋壳形成过程中的作用,应用SMART-RACE技术克隆获得了长度为2129 bp的山麻鸭OC-116基因cDNA全长序列,运用生物信息学软件对该基因和蛋白的特征进行分析,结果显示:该基因编码蛋白的分子式为C2710H4331N865O927S12,属于不稳定蛋白,其编码的蛋白中甘氨酸(16.5%)、丙氨酸(11%)、丝氨酸(10.2%)含量较高。蛋白的二级结构中,α螺旋(Hh)占比0.47%、β折叠(Ee)占比17.64%、无规卷曲(Cc)占比81.89%,且包含肽信号,不含跨膜结构;系统进化树显示山麻鸭与绿头鸭、黑天鹅和棕硬尾鸭的亲缘关系最近;在mRNA的水平上,OC-116基因在山麻鸭14种组织中均有不同程度的表达,其中在垂体、子宫部和峡部中的表达量极显著高于其他组织。子宫部和峡部分别是蛋壳矿化形成和蛋壳膜形成部位,表明OC-116基因在山麻鸭蛋壳的形成过程中扮演着重要的角色。

摘要： 【目的】本研究旨在阐明暗黑鳃金龟Holotrichia parallela UDP-N-乙酰氨基葡萄糖焦磷酸化酶(UAP)基因HpUAP的序列特征和功能。【方法】通过PCR方法从暗黑鳃金龟2龄幼虫中扩增HpUAP全长cDNA序列,并进行生物信息学分析;构建pET30a-HpUAP重组表达载体,转化大肠杆菌Escherichia coli BL21(DE3),IPTG诱导蛋白表达;利用qRT-PCR检测HpUAP在暗黑鳃金龟幼虫不同发育阶段(1-3龄幼虫)和3龄第2天幼虫不同组织(体壁、中肠、直肠、回肠、马氏管和脂肪体)中的表达量。利用RNAi沉默暗黑鳃金龟2龄幼虫体内HpUAP基因后,观察其生长发育和存活情况,并测定RNAi 72 h后其HpUAP表达量和体壁几丁质含量。【结果】PCR扩增获得暗黑鳃金龟HpUAP全长cDNA序列(GenBank登录号:MW676788),开放阅读框长1461 bp,编码486个氨基酸残基,蛋白分子量约为53.9 kD。系统进化分析发现HpUAP与似牛嗡蜣螂Onthophagus taurinus UAP的氨基酸序列以较高的置信度聚为一个分支。经IPTG诱导可表达53.9 kD的HpUAP蛋白,与预期大小一致。发育表达谱结果表明HpUAP在1龄第1天和3龄第1天暗黑鳃金龟幼虫中表达量较高,组织表达谱结果表明HpUAP在暗黑鳃金龟3龄第2天幼虫中肠和体壁中表达量较高。HpUAP RNAi导致暗黑鳃金龟2龄幼虫生长与行动缓慢,体表颜色加深并皱缩;RNAi处理72 h后,与对照组(dsGFP注射组)相比,dsHpUAP注射组HpUAP表达量下降了93.06%,死亡率增加了40%左右,表皮几丁质含量下降了约29%。【结论】结果说明HpUAP参与几丁质代谢,在暗黑鳃金龟幼虫的生长发育过程中起关键作用。

摘要： 【目的】通过分析关中奶山羊αs1-酪蛋白(alpha-s1 casein,CSN1S1)基因组织表达谱及其生物信息学功能,初步探究CSN1S1基因在奶山羊乳成分合成中发挥的作用。【方法】以关中奶山羊为研究对象,利用PCR扩增并克隆CSNIS1-1和CSN1S1-22个突变形态,并利用ProtParam、NetPhos、SingalP 4.1 Server、NPS和Phyre2等多种生物信息软件和在线工具对CSN1S1基因及其突变形态的蛋白质结构、理化性质、磷酸化位点等进行分析,通过实时荧光定量PCR检测CSNIS1-1和CSN1S1-2在关中奶山羊肝脏、脾脏、乳腺、肾脏、子宫、输卵管6个组织中的相对表达量。【结果】关中奶山羊乳腺上皮细胞中存在CSN1S1-1和CSN1S1-22种突变形态。对测序结果比对显示,CSN1S1-1存在3个碱基的突变,CSN1S1-2不仅存在3个碱基的突变,还存在6个碱基的缺失。CSN1S1-1与CSN1S1蛋白相似性为99.07%,CSN1S1-2与CSN1S1蛋白相似性为97.20%。蛋白理化性质分析显示,CSN1S1-1中碱基的突变导致第31位亮氨酸变成脯氨酸、第92位谷氨酰胺变成谷氨酸;CSN1S1-2除上述改变之外,第83位由丝氨酸变成半胱氨酸、第84位由谷氨酸变成谷氨酰胺,还存在第81和82位2个丝氨酸的缺失。实时荧光定量PCR结果显示,CSN1S1-1和CSN1S1-2在关中奶山羊各组织中相对表达趋势基本相同,其中在乳腺、子宫、输卵管中相对表达量较高,在肝脏、脾脏和肾脏中基本不表达,在子宫中CSN1S1-2的表达量显著高于CSN1S1-1(P<0.05)。【结论】关中奶山羊乳腺上皮细胞中存在CSN1S1-1和CSN1S1-22种突变形态,且2种突变形态与CSN1S1的蛋白相似性均达到97%以上。CSN1S1-1在蛋白结构上与CSN1S1已有明显区别,而CSN1S1-2中6个碱基的缺失是导致氨基酸改变、磷酸化位点缺失与移位的直接原因。CSN1S1-2在子宫中表达显著高于CSN1S1-1,其可能在子宫中发挥潜在功能,还有待进一步探索。

摘要： 为了探究小肌肉蛋白(Small Muscle Protein X-link,SMPX)在隆林山羊中的蛋白结构和组织表达水平,本研究克隆隆林山羊SMPX,并进行生物信息和组织表达谱分析。从NCBI查找山羊SMPX基因序列设计引物,根据TRlzol法提取1月龄隆林山羊心、肝、脾、肺、肾、背肌的总RNA,反转录成cDNA,并克隆SMPX,通过qRT-PCR分析SMPX在不同组织中的表达水平,进行生物信息学分析。SMPX基因编码区序列全长253 bp,共编码255个氨基酸,与NCBI上山羊编码区序列同源性达100%。SMPX蛋白的分子质量20.61 ku,等电点为5.29,是酸性蛋白,其在1~22个氨基酸处具有信号肽。SMPX有11个磷酸化位点,在隆林山羊不同组织中的表达量不一样,推测它可能在不同组织中发挥不同的生物学作用。

摘要： 为分析miR-15a在肉鸡不同组织中的表达情况,并探究过表达miR-15a对体外培养鸡软骨细胞的影响。本研究首先通过倒置显微镜观察、PCR、凝胶电泳和甲苯胺蓝染色对体外分离培养的软骨细胞进行鉴定。通过实时荧光定量PCR检测miR-15a在肢体内外翻畸形(valgus-varus deformity,VVD)组和健康组肉鸡中(各3只)各组织的表达量。之后通过CCK8和EDU方法分析软骨细胞过表达miR-15a后细胞增殖情况。软骨细胞转染miR-15a mimics后,通过qPCR检测软骨细胞的标志基因Collagen-2、Aggrecan、Collagen-10,成熟分化基因Runx2、Sox9、VEGF、MMP9,炎性因子IL-1β、IL-6、IL-8、IL-10、TNF-α、TGF-β3以及凋亡基因Fas、FasL、Bcl-2的表达量。并构建FKBP53′UTR的野生型载体和突变型载体,通过双荧光素酶检测报告检测miR-15a与FKBP5的靶向关系。结果表明,本研究所用的胰蛋白酶、Ⅱ型胶原酶和透明质酸酶联合消化法成功分离得到状态良好的软骨细胞。荧光定量结果显示,miR-15a在各组织中均有表达,与健康组相比,miR-15a在VVD组的肝(P<0.01)、脾(P<0.05)、胸腺(P<0.01)中的表达量显著升高,在心和胸肌组织中的表达量显著降低(P<0.01)。CCK8与EDU分析结果显示,与NC组相比,过表达miR-15a组软骨细胞增殖速度显著降低(P<0.01),增殖细胞数量显著减少(P<0.01)。qPCR结果显示,与mimics NC组相比,miR-15a mimics组的软骨细胞标志基因Aggrecan、成熟分化基因Sox9、Runx2表达量显著降低(P<0.05),Fas基因表达量极显著上升(P<0.01),FasL基因和抗凋亡基因Bcl-2极显著下降(P<0.01)。成功构建了FKBP53′UTR野生型和突变型载体,双荧光素酶检测报告结果显示预测的靶基因FKBP5与miR-15a没有靶向关系。本研究成功分离并鉴定了鸡软骨细胞,过表达miR-15a抑制鸡软骨细胞增殖、成熟和分化并促进细胞凋亡。

摘要： 【目的】了解let-7a-5p的生物学信息,初步探索其在静原鸡肌肉组织中的功能作用。【方法】利用生物信息学方法对转录组测序获得的静原鸡let-7a-5p的成熟序列进行保守性分析,使用miRDB、TargetScan和miRanda在线软件预测let-7a-5p的靶基因,取其交集进行GO功能和KEGG通路富集分析,并利用实时荧光定量PCR检测let-7a-5p在静原鸡公鸡和母鸡各组织中的表达水平。【结果】let-7a-5p的成熟序列在各物种间高度保守,共预测得到38个基因集合。在生物过程、细胞组分和分子功能中靶基因富集较多的GO条目有细胞过程、生物调节、细胞、结合和催化活性;靶基因显著富集于聚酮糖单元生物合成、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、泛素介导的蛋白水解、TGF-β信号通路和加压素调节的水重吸收信号通路,且富集最多的是代谢途径、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、泛素介导的蛋白水解和MAPK信号通路。let-7a-5p-靶基因互作主要通过作用于靶mRNA的3′-UTR抑制表达或使其降解。组织表达发现,let-7a-5p在静原鸡公、母鸡的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胸肌和腿肌组织中均有表达,且在胸肌和腿肌中表达量均较高。【结论】let-7a-5p可能靶向调节靶基因的表达,从而参与静原鸡肌肉生长发育,为进一步探究let-7a-5p的功能和作用机制提供理论依据。

摘要： 旨在对高、低乳脂率奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)转录组测序的mRNA表达谱数据进行深入分析,挖掘影响奶牛乳脂代谢的关键候选基因。本研究采用IlluminaPE150方法对乳脂率具有极端差异的荷斯坦奶牛(高、低乳脂组各4头)的BMECs进行转录组测序,以P<0.05和|log2FoldChange|≥1.5为阈值筛选差异表达基因,并利用KOBAS在线网址进行功能富集分析,最后通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析测序结果的准确性及乳脂代谢相关差异表达基因的组织表达谱。结果表明,在高、低乳脂组之间共发现578个差异表达基因,包括332个上调差异表达基因,246个下调差异表达基因。功能富集分析共确定了包含生物学过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)的366个显著富集的GO条目(P<0.05),其中与脂代谢密切相关的GO条目有长链脂肪酸的运输、脂肪细胞分化的正向调节、乳腺肺泡发育、花生四烯酸的结合等。差异表达基因显著富集到47条KEGG通路(P<0.05),参与脂代谢的通路有15条,分别为脂肪细胞内脂解的调节、磷脂酶D信号通路、河马信号通路等,其中ID2、PRKKA2、FABP4和ADCY5为可能调控乳脂代谢的关键候选基因。组织表达谱分析发现,FABP4在乳腺组织中的表达水平相对最高,ID2、PRKKA2和ADCY5相对于其它组织在乳腺中的表达也均处于较高水平。本研究筛选得到了4个影响奶牛乳脂代谢的重要候选基因,为今后奶牛乳脂代谢的分子调控机制研究提供了重要的理论依据。

摘要： 本实验旨在探究猪NT5C1A基因组织表达特征、遗传多态性及其与胴体和肉质性状的关系,为猪肉质性状的遗传改良提供新的分子标记。利用荧光定量PCR检测了NT5C1A基因在16个组织中的表达特征。采用PCR产物直接测序技术在硒都黑猪群体中对NT5C1A基因的SNPs位点进行筛选鉴定,并利用SAS 8.0软件中的混合线性模型分析SNPs位点与猪胴体和肉质性状的相关性。结果显示:NT5C1A基因在腰大肌表达量最高;在硒都黑猪中存在3个SNPs位点,分别为rs81390049 C>T、rs81390048 A>G和rs339707155C>T突变。性状关联分析表明,3个SNPs位点均与猪胴体或肉质性状显著相关。这3个SNPs位点紧密连锁,形成3种单倍型,并且与猪胴体和肉质性状显著关联。综上,NT5C1A基因3个SNPs位点可作为猪肉质性状遗传改良的分子标记。

摘要： [目的]本研究旨在克隆琥珀蚕Antheraea assama丝腺转录因子基因AaSGF-1,分析其序列特征及表达模式并制备多克隆抗体,为探讨该基因的生理功能奠定基础.[方法]采用RT-PCR和RACE技术从琥珀蚕丝腺中克隆AaSGF-1的cDNA序列,并进行生物信息学分析;利用qPCR检测AaSGF-1在琥珀蚕5龄第4天幼虫不同组织(头、中肠、脂肪体、丝腺、血液、表皮)中的表达模式;构建原核表达质粒载体,在大肠杆菌Escherichia coli BL21中表达AaSGF-1,利用纯化的融合蛋白免疫新西兰兔子,获得高效的抗体.利用免疫荧光技术检测AaSGF-1在琥珀蚕蚁蚕丝腺和表皮及4龄幼虫丝腺中的表达情况.[结果]克隆了琥珀蚕AaSGF-1的cDNA序列(GenBank登录号:MK889510.1),开放阅读框(ORF)序列长1 050 bp,编码349个氨基酸残基,预测蛋白分子质量为38.8 kD,理论等电点(pI)为8.74.qPCR检测结果显示AaSGF-1在琥珀蚕5龄幼虫丝腺组织尤其是后部丝腺中高量表达,而在其他组织中几乎不表达.免疫荧光结果表明AaSGF-1在蚁蚕及4龄幼虫的丝腺中表达.[结论]本研究原核表达了琥珀蚕AaSGF-1,制备了多克隆抗体,证实了AaSGF-1在琥珀蚕幼虫的丝腺中高表达,为进一步研究该基因在琥珀蚕丝腺发育及丝蛋白合成中的作用奠定了基础.

摘要： 旨在克隆牦牛Sirtuin7(SIRT7)基因,预测其蛋白结构和功能,并检测其mRNA在牦牛各组织和不同发情时期卵巢中的表达.采集成年牦牛(3～5岁)的肝脏、乳腺、大肠、肾等组织及处于卵泡期、红体期、黄体期的卵巢.提取各组织的总RNA,并通过反转录PCR(Reverse transcription PCR,RT-PCR)扩增获得牦牛SIRT7的基因序列.通过不同的生物信息学软件比对SIRT7基因的序列同源性、构建系统进化树以及预测牦牛SIRT7所编码蛋白的结构和功能.采用实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法检测SIRT7 mRNA在牦牛各组织和不同发情时期卵巢中的表达.结果显示,牦牛SIRT7基因的开放阅读框(Open reading frame,ORF)大小为1203 bp,编码400个氨基酸.牦牛SIRT7基因的核苷酸序列与黄牛、绵羊、山羊的同源性较高.SIRT7蛋白为亲水性蛋白.二级结构由α-螺旋(47.4％)、β-折叠(29.7％)、β-转角(15.7％)及无规卷曲(7.2％)组成.磷酸化和糖基化分析结果表明,SIRT7蛋白有38个磷酸化位点,24个O-糖基化位点.荧光定量结果为,SIRT7 mRNA在牦牛的肾中表达最高.在牦牛卵巢中,卵泡期、红体期、黄体期SIRT7 mRNA的表达量呈持续升高的趋势,其中黄体期表达量最高.为揭示SIRT7在牦牛生长发育,尤其是卵巢发育过程中的调控作用提供一定的基础数据.

摘要： 本实验旨在对山羊高尔基体α-甘露糖苷酶Ⅱ(chGMⅡ)进行生物信息学和组织表达谱分析.采用反转录PCR技术克隆chGMⅡ的cDNA序列,利用荧光定量PCR技术进行组织表达谱分析,并利用生物信息软件对其蛋白结构进行预测.首次获得chGMII的含3432 bp开放阅读框的cDNA序列.生物信息学预测发现,chGMII分了量约130kDa,无信号肽序列,含有1个跨膜结构域,SWISS-MODEL同源建模得到chGMⅡ的三级结构,分子对接获得chGMⅡ与其底物结合的空间结构.组织表达谱分析表明chGMⅡ在脾脏的表达量最高.本实验为探讨GMII的酶的作用机理及后续抗癌制剂的研制打下了提供资料.

摘要： 本实验采用RT-PCR技术克隆家兔DGAT1部分基因片段,并采用半定量RT-PCR技术研究其在齐兴肉兔不同组织中表达谱.研究结果获得了DGAT1基因960 bp的编码序列,共编码320个氨基酸.通过核苷酸和氨基酸序列比对分析发现,家兔DGAT1基因与其他物种的相似性在81.7％～89.2％之间;遗传距离分析表明,家兔与人的亲缘关系最近,与牛的最远.组织表达谱分析表明,DGAT1基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、盲肠、淋巴结、背最长肌、皮下脂肪等多种组织中均有表达,且皮下脂肪中表达量最高,肺脏组织中表达量最低.研究结果为进一步研究DGAT1基因在家兔脂肪代谢中的生理功能提供依据.

摘要： 根据鸡腹脂性状的全基因组关联分析结果筛选出DNAJB6基因作为影响鸡腹脂性状形成的重要基因,对DNAJB6基因进行生物信息学和组织表达谱分析.结果表明,鸡DNAJB6基因编码含有326个氨基酸的蛋白,等电点为8.86,分子量为36.68kD).启动子区有一个长度约为1kb的CpG岛,并有CREB、Sp1、AP2、GATA等结合位点.DNAJB6蛋白包含1个DnaJ结构域,不存在信号肽和跨膜结构,在蛋白分子进化上与欧洲牛的亲缘关系最近.DNAJB6基因在所研究的15种组织中广泛表达,其中在低脂系的腹脂和肌胃周围脂肪中表达量最高.本文的研究结果可为深入研究DNAJB6基因及其对脂肪的影响机制提供有价值的参考.

摘要： KRT71是一种Ⅱ型角蛋白,本文旨在分析KRT71基因在绵羊毛囊生长发育过程中的作用,利用半定量RT-PCR技术对该基因的组织表达谱进行了研究分析.结果表明,绵羊KRT71基因特异性表达于皮肤组织中,在其他组织中均不表达.分析认为KRT71在绵羊毛囊生长发育过程中起一定的作用.

摘要： 为研究TSHR基因对绵羊繁殖性能的影响,利用RT-PCR技术进行了绵羊TSHR基因的克隆及组织表达谱分析.结果显示:获得了长度为3276bp的绵羊TSHR cDNA序列,其中编码区长2295bp,编码764个氨基酸.半定量RT-PCR结果显示TSHR基因在绵羊下丘脑和垂体组织中特异性高表达,在松果体呈中度表达,而在其他组织中表达相对较弱.

摘要： 为初步了解绵羊LPAR6基因信息,利用RT-PCR扩增绵羊LPAR6基因cDNA并进行序列分析;通过半定量RT-PCR检测该基因在绵羊组织表达谱.结果显示:首次获得了绵羊LPAR6 cDNA序列,其中CDS全长1026bp,编码341个氨基酸;其蛋白结构经预测存在多个磷酸化位点和蛋白激酶C磷酸化位点.LPAR6基因在绵羊心、肝、脾、肺、肾、甲状腺、卵巢、子宫、淋巴结、小肠和下丘脑中均有表达,其中以卵巢、子宫和淋巴结表达丰度较高.

摘要： 本实验采用荧光定量RT-PCR的方法对猪TSHR基因组织表达谱进行分析，及对16个物种的TSHR基因进行生物信息学分析，并建立系统发育树，以及进一步确定物种间的遗传分化。

摘要： 乙酰辅酶A酰基转移酶(ACAA2)属于脂肪酸氧化酶,参与动物体内脂肪酸的β氧化.为全面了解该基因在鸡各组织器官的表达情况,采用定量RT-PCR技术分析了ACAA2在固始鸡6、14、22、30周龄四个发育阶段13种组织中相对表达量.结果显示:ACAA2在固始鸡四个发育阶段13种组织中均表达,尤其是在心肌中呈高丰度表达,在肝脏、心肌、胸肌、肾脏和腺胃等多数组织中呈时序性表达;前期表达水平相对较高,30周龄时显著下降.总之,ACAA2在各器官组织中的时序性和特异性表达,与机体内脂肪沉积规律相一致.

摘要： MST1N是骨骼肌发育的负性调控因子,本文用RT-PCR方法克隆藏鸡MSTN编码基因,用半定量RT-PCR方法检测MSTN的mRNA在藏鸡腿肌等10个组织的表达情况。藏鸡MSTNDNA长1128bp,编码375个氨基酸.藏鸡与原鸡氨基酸序列一致率为99.7％,有6个同义突变和1个非同义突变的氨基酸差异.MSTN的mRNA在腿肌、胸肌、心脏、肾脏、睾丸、卵巢、胃中均检测到表达,脂肪、肝脏、肺中未检测到MSTNmRNA表达。MSTN的mRNA表达水平由高到低的顺序为：腿肌、胸肌、心脏、肾脏、睾丸、卵巢和胃。

摘要： 本实验采用分子生物学方法对民猪的MyoG基因进行了研究，首先采用RT—PCR方法克隆了民猪MyoG基因的全长编码区序列，利用生物学软件对其二级结构进行了预测与分析;然后采用RT—PCR的方法分析了MyoG基因在30日龄民猪各组织中的表达情况。获得了民猪MyoG基因675 bp的全长编码区序列，与NCBI上已提交的其他猪种的MyoG基因序列比对后发现一个突变位点：391T→c，该突变引起了氨基酸序列的改变131c→R。获得了MyoG基因组织表达特异性结果，即MyoG基因只在骨骼肌组织中表达，在心脏，肝脏，脾脏，肺，肾脏，大肠，小肠，胃，卵巢组织中均不表达。

摘要： 本发明涉及一种基于基因表达谱识别组织样本中细胞类型及组分的方法，包括1）获得基因表达矩阵中所有基因的特异性得分；2）利用获取得到的基因表达矩阵中所有基因的特异性得分并结合统计检验框架识别潜在的标记基因；3）利用互线性策略将识别的标记基因映射至标记基因所对应的细胞类型，并过滤掉低信度的标记基因，构建出可表征细胞类型特异性且具有最小条件数的标签矩阵；4）将加权最小二乘法纳入鲁棒线性模型，与标签矩阵相结合，构建解卷积模型，预测组织样本中的细胞组分。本发明提供了一种直接衡量基因在任意种条件下的特异性的方法，并建立了细胞类型识别算法，实现对细胞类型特异性基因的鉴定和组织样本中细胞组分的预测。

摘要： 本发明公开了一种利用基因表达谱筛选动物不同组织差异基因的方法，采用全基因组表达谱芯片技术多通量筛选动物各组织差异基因和调控通路。本发明采用全基因组表达谱芯片结合生物信息学技术对动物不同组织样品转录谱进行比对分析，筛选到了影响动物不同组织的一些重要基因和调控通路，得到不同组织间的差异表达基因、相应的基因功能注释、信号通路和代谢通路，为从转录水平揭示动物不同组织间差异形成的分子机制提供依据。

摘要： 本发明涉及一种利用mRNA表达谱与circRNA表达谱联合筛选脊髓损伤时间基因的方法，属于医学技术领域。本发明提供的方法利用mRNA表达谱与circRNA表达谱联合筛选脊髓损伤时间基因，进而能够指导患者在脊髓损伤后能够在最合适的治疗时间用药，提高治愈效果。

摘要： 本发明涉及一种利用mRNA表达谱与竞争性内源RNA表达谱联合筛选蒽环类药物心脏毒性基因的方法，包括步骤：通过mRNA和竞争性内源RNA表达谱芯片检测到大量基因的表达值，对所有基因的相关性进行排序；将获取的mRNA和竞争性内源RNA特征基因进行合并；通过遗传算法，对基因池进一步选择基因；通过比较乳腺癌患者、乳腺癌AIC患者及正常人mRNA与竞争性内源RNA联合表达谱不同，样本间的数据从而选出差异表达的基因；对差异表达基因预测，挑选score大于140，自由能小于‑20的作为可靠的靶基因；再从靶基因中挑选有显著差异的，用剩余部分RNA对构建的乳腺癌蒽环类药物心脏毒性发病目的靶基因进行验证。本发明可以候选出更为可靠的与蒽环类药物心脏毒性相关的潜在基因标志物。

摘要： 本发明涉及将细胞中基因和蛋白表达相关联的方法。

摘要： 本发明公开了一种基于共表达、共流出、二级质谱图相似的质谱峰注释方法，属于质谱数据注释技术领域。本发明基于同一物质不同质谱特征在不同样本中具有共表达、共流出、二级质谱图相似的特点，通过对常见加和物、多聚体、同位素、源内裂解碎片的质量差过滤，建立了一套针对高分辨率质谱数据的高效注释方法，可解决在实际代谢组学等领域中，未知物的结构注释这一步骤由于冗余质谱信息带来的耗时费力的困难。本发明的质谱数据注释方法准确且省时省力，对于实际样本中的未知物冗余信息的准确注释具有重要意义。

摘要： 本发明公开了一种采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法。本发明具有操作简便、快速高效、敏感性高、特异性强、有效解决了PCR污染、PCR热不稳定的问题、自动化程度高等特点，比采用其它方法适应性更强、效果更好。且本发明简单易懂，便于操作。

摘要： 本发明提供了一种基于实时荧光定量PCR的猪LYRM1基因组织表达谱的建立方法。本发明应用实时荧光定量PCR技术构建了一套适宜的LYRM1基因组织表达谱建立方法，通过该方法建立猪LYRM1基因在不同组织中的表达谱，具有操作简便、快速高效、敏感性高、特异性强的特定、并且有效解决了PCR污染的问题，且自动化程度高，比采用其它方法来建立组织表达谱适应性更强，对于阐明LYRM1基因表达的作用机理具指导作用及参考意义。

摘要： 本发明提供了一种基于实时荧光定量PCR的黔北麻羊FSHR基因组织表达谱的建立方法。本发明应用实时荧光定量PCR技术，建立山羊FSHR基因在不同组织中的表达谱，对于阐明FSHR基因表达的作用机理具有一定的指导作用。而且它具有操作简便、快速高效、敏感性高、特异性强及自动化程度高等优点，还有效解决了PCR污染的问题，因此比采用其它方法来建立组织表达谱适应性更强。本发明方法简单，易于实施，成本低廉，使用效果好。

摘要： 本发明公开了一种基于SYBRGreenI荧光定量方法的牦牛应激型HSPA1A基因组织表达谱建立。该表达谱建立包括了如下步骤：（1）牦牛各组织RNA的提取及cDNA合成；（2）引物设计；（3）标准曲线的建立；（4）荧光定量PCR方法的优化和建立；（4）采用建立好的方法检测牦牛应激型HSPA1A基因在各组织的表达分布；（5）采用相对定量的2